Basic Information

Symbol
DDR2
RNA class
mRNA
Alias
Discoidin Domain Receptor Tyrosine Kinase 2 TKT NTRKR3 TYRO10 Discoidin Domain-Containing Receptor Tyrosine Kinase 2 Discoidin Domain Receptor Family, Member 2 Discoidin Domain-Containing Receptor 2 Receptor Protein-Tyrosine Kinase TKT CD167 Antigen-Like Family Member B Tyrosine-Protein Kinase TYRO10 Discoidin Domain Receptor 2 EC 2.7.10.1 Neurotrophic Tyrosine Kinase, Receptor-Related 3 Neurotrophic Tyrosine Kinase Receptor Related 3 Cell Migration-Inducing Protein 20 Migration-Inducing Gene 16 Protein Hydroxyaryl-Protein Kinase CD167b Antigen EC 2.7.10 MIG20a WRCN
Location (GRCh38)
1:162630863-162787405
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006182.4
Sequence length
10086.0 nt
GC content
0.4145

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2882.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3091.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2738.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001014796.3 NCBI
CAAAGGCAUCUUGCAUCAGCCUGUGGAUGUAUGCCUACCACCGGGCUCC… 10166 nt 0.4159
NM_001354982.2 NCBI
AGCUCUAGGCUUUCAUGGUCAAAAUACUAAAGGUCAGCUCCGCGUGUGU… 10037 nt 0.4141
NM_001354983.2 NCBI
GAGUCACCCUCAGGCCUGACUUCAGAUGCUGUAAGUUAUUUGAAGAGUC… 10503 nt 0.4160
NM_006182.4 NCBI
CAAAGGCAUCUUGCAUCAGCCUGUGGAUGUAUGCCUACCACCGGGCUCC… 10086 nt 0.4145
Summary

This gene encodes a member of the discoidin domain receptor subclass of the receptor tyrosine kinase (RTKs) protein family. RTKs play a key role in the communication of cells with their microenvironment. The encoded protein is a collagen-induced receptor that activates signal transduction pathways involved in cell adhesion, proliferation, and extracellular matrix remodeling. This protein is expressed in numerous cell types and may alos be involved in wound repair and regulate tumor growth and invasiveness. Mutations in this gene are the cause of short limb-hand type spondylometaepiphyseal dysplasia. [provided by RefSeq, Aug 2017] CIViC Summary for DDR2 Gene

Forensic Context

A study in rats demonstrated that cardiac fibroblasts exhibit age-dependent transcriptomic heterogeneity, with principal component analysis showing developmental age as the primary source of data variance [Perreault et al. DOI:10.1152/physiolgenomics.00074.2021].