Basic Information

Symbol
DENND4C
RNA class
mRNA
Alias
DENN Domain Containing 4C BA513M16.3 RAB10GEF C9orf55B C9orf55 DENN Domain-Containing Protein 4C DENN/MADD Domain Containing 4C FLJ20686 DENN/MADD Domain Containing 4A Pseudogene Chromosome 9 Open Reading Frame 55B Chromosome 9 Open Reading Frame 55
Location (GRCh38)
9:19230435-19374281
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001330640.2
Sequence length
8143.0 nt
GC content
0.3996

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2181.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2344.06 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2676.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001386039.1 NCBI
AGACCGGACUGAGGCGGCGGCGGCCGCUGGAGCUAGUCCCCCGCCCUGC… 8102 nt 0.4005
NM_001386040.1 NCBI
AGACCGGACUGAGGCGGCGGCGGCCGCUGGAGCUAGUCCCCCGCCCUGC… 8125 nt 0.3996
NM_001386041.1 NCBI
AGACCGGACUGAGGCGGCGGCGGCCGCUGGAGCUAGUCCCCCGCCCUGC… 7785 nt 0.4003
NM_001386042.1 NCBI
AGACCGGACUGAGGCGGCGGCGGCCGCUGGAGCUAGUCCCCCGCCCUGC… 7931 nt 0.3991
NM_001386043.1 NCBI
AGACCGGACUGAGGCGGCGGCGGCCGCUGGAGCUAGUCCCCCGCCCUGC… 7820 nt 0.3988
NM_001386044.1 NCBI
AGACCGGACUGAGGCGGCGGCGGCCGCUGGAGCUAGUCCCCCGCCCUGC… 8343 nt 0.4000
NM_001386045.1 NCBI
AGACCGGACUGAGGCGGCGGCGGCCGCUGGAGCUAGUCCCCCGCCCUGC… 8078 nt 0.4002
NM_001386046.1 NCBI
AGACCGGACUGAGGCGGCGGCGGCCGCUGGAGCUAGUCCCCCGCCCUGC… 7753 nt 0.3982
NM_001386047.1 NCBI
AGACCGGACUGAGGCGGCGGCGGCCGCUGGAGCUAGUCCCCCGCCCUGC… 8233 nt 0.4037
NM_001386048.1 NCBI
AGACCGGACUGAGGCGGCGGCGGCCGCUGGAGCUAGUCCCCCGCCCUGC… 8073 nt 0.3994
Showing 11 to 20 of 21 entries
Summary

Enables guanyl-nucleotide exchange factor activity. Predicted to be involved in cellular response to insulin stimulus; protein localization to plasma membrane; and regulation of Rab protein signal transduction. Located in Golgi apparatus and cytosol. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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