Basic Information

Symbol
DEPP1
RNA class
mRNA
Alias
DEPP Autophagy Regulator 1 DEPP FIG Decidual Protein Induced By Progesterone C10orf10 Fseg Fasting-Induced Gene Protein Fasting Induced Protein DEPP1 Chromosome 10 Open Reading Frame 10 Fat-Specific Expressed Gene DEPP1 Autophagy Regulator Fasting-Induced Protein Fat-Specific Expressed Protein DEPP
Location (GRCh38)
10:44970981-44978809
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_007021.4
Sequence length
2120.0 nt
GC content
0.5679

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-835.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -874.18 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 455.39
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_007021.4 NCBI
ACACUGCUCAGGGAAGAGCCUGCUACGGUGGACUGUGAGACUCAGUGCA… 2120 nt 0.5679
Summary

The expression of this gene is induced by fasting as well as by progesterone. The protein encoded by this gene contains a t-synaptosome-associated protein receptor (SNARE) coiled-coil homology domain and a peroxisomal targeting signal. Production of the encoded protein leads to phosphorylation and activation of the transcription factor ELK1. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human trauma patients demonstrated that the DEPP1 mRNA was significantly downregulated in circulating CD3+ T cells during the injury stage compared to the recovery stage [Rau et al. DOI:10.2147/JIR.S375881].