Basic Information

Symbol
DEPTOR
RNA class
mRNA
Alias
DEP Domain Containing MTOR Interacting Protein DEPDC6 DEP.6 DEP Domain-Containing MTOR-Interacting Protein DEP Domain-Containing Protein 6 DEP Domain Containing 6 FLJ12428 HDEPTOR
Location (GRCh38)
8:119873717-120050918
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_022783.4
Sequence length
2569.0 nt
GC content
0.4570

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-771.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -822.82 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 694.49
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((((..((.((((((((((..........((.((((....((((((....))))))...)))).))..((((..(((((((...(((((..(((((((.(.(((((.(..(((((......))).))..))))))).)))))))..))))).......((((.((.(((((.......((........)).......))))).)))).)))))))))..))))....)))))..))))).)))))).))))(((.((..(((((((((..........((((((((((.(((.((((..(((...(((((...(((((..((...((((((.((((((..((.......))..)))((((.....)))).)))))))))..))..))).))....)))))...))).((((((.(((...))).)))))).......(((.....(((.(((((..((.(((((......)))))))..)))))...))))))..(((((..((((((....(((((((.(......).))))))).........((((.((((((((((((.....(((((........)))))((((((((((.(.((((((..(((.((.....))(((((....(((((((((....))))))))))))))(((((((...((((.....(((((((...)))))))...((((((.(((((.((((((......((...((((((.((((......))))))))))))..((.(((((.((((((((...))))))...)).))))).)).((((....(((...))).......))))...(((((((...((...(((((((((((((....(((((.((((.((((((((((....((((...(((((..((.....(.((.(((((((......((((((((((.(((((.((((...........)))))))))...((((((((.((((.(((((((......((((((.........((((.(((........)))))))(((((((.(((...........(((((((((((((((((...((((((.(...(((....)))...).)))).))...)))).)).....))))))).)))))))))))))).((((((((..........))...))))))....)))))).......))))))))))).))))))))..((..((...))..))..))))..))))))......))))))).)).)..))..)))))...))))..)))).))..)))).))))..)))))....))..)))))))))))...))..))))))).....)))))).))))))))))).......))))..))))))).(((((.((((((((......(((((.......((((((...(((((......((((.(((((((((((((((((..(((....))).........))))))))))....(((((.((((((((......(((((..(((((...))))))))))........)))))))).)))))...(((....))).....(((((.((((((((((......)))..))))))))))))...))))))))))).....)))))..)))))).....))))).....)))))))).)))))....))).))))))...).))))))))))..........(((((....(((((...)))))....)))))((((((((..(((((((((.((((...)))).((((((.(.......).))))))..........((((((((.(((((((.....))))).)).((((.((((.((((((((((((((((....))))))....(((((((....................((((...((((.((((....)))).)))))))).....)))))))...(((...........)))...(((((((((((((((((..((((((((((((.(((((......))))).......)))))))))))))))....................))))))))))))))....)))))))..))))))).))))))))))))....(((((((((((...(((.((((((..(((((((..(((((((.................))))).))..)))))))((.((((.......)))).))..)))))))))))))))...))))).......(((((((..........((((((....)))))).........)))))))..)).)))))))....))))))))(((((((((.....)))))))))....((.((((........)))).))...........((((((((((............)))))).)))).)))))))))))).)).)).(((((...)))))..(.((((......)))).).((......)).....))))))))))).....)).)))))))))))))))))))))))).)).))).................................
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(((.((((..((.{(((((((((..,......,((.((((..,.((((((....))))))...)))).)).,((((..(((((((.,.(((((..(((((((.(.(((((.(..(((((......))).))..))))))).)))))))..))))),,.{{..{,|{.((.((,((.,..,{.||.,.,|||,||.......)))),.)))).,.)))))))..))))....)))))..))))}.)))))).)))|(((.{{..{{{(((({.....,,,,.(((((((((((.((,,((,{..(((,,,{(((,.,,(((((,.,({.{((((((,(({{{{,.(({..,,{.,|{,|||(((({.{{.||||.,||,,,,,,..}}|.}||.}}....,}}}}...|||,((({({.(((...}}),}}}}}}.,}...,(({,{,.{(((,{((((..((.(((((......)))))}),.))))}...)))}{{{.(((({.{{((.(({{{{{{(((({.,..,,}}.{||,||||.,,,.....,{|.,|||||||||,,......(((((........)))))((((((((((.(.((((((..(((.((.....))(((({...,(((((((((....))))))))))))))(((((((...((((...,.(((((((...)))))))...{(((({.{{{((.||({{{{{{,,{{,.{{((((({,((({......}))))))))),)}.((,(((((.((((((({...})))))...)).))))).)),},}})}}}|,}}}})))..,,...,}}},..(((((((,..({...((((((((((({{.,..(((((.((({.((((((((((....((((...(((((..((.....{.((.(((((((......((((({{,,{.(((((.((((...........))))))))).}.((((((((.((((.(((((((...,{.((((((.........((((.(((......,.))))))){(((((,,({(...,,,.....{(((((((((({{(((({..{((({{.,...{||.,.,))}...}.}}))}.}...}}}}.,}.....))))))).)))))))))))))).{((((({|..{|......,)}.}))))))....)))))).}.,...))))))))))).)))))))).,{{.,{,...}},.}},,,}}}..))))))......))))))).)).}..))..)))))...))))..)))).))..)))).})))..)))))....)),.)))))))))))...)).,)))))))...|{||}}},.))))}}||))),}...,.))))..))))))).(((((.((((((((.,...,(((((.......((((({.,,(((((......(({{{(((((({{(((((((((..({(,...}},.}.,,....)))))))))}....(((({.((((((((...,..{{(({..(((((...)))))}})))........)))))))).}))))...(((....))}..,..(((((.((((((((({......}))..))))))))))))...})))))))))).....))))).,)))))).....))))),...,)))))))).)))))....))).))))))...).)))))))))).,,,,{.,,.{(({{,{{,{,,,,,,{,}},,,,,,,}}}}|{{{{{{{,.{(((,,{{||||},,,..,.},((((((.{.......}.)))))).......,,,{{{{{{{,.{{({{{,...,,)}))),)).,|||,||||||||(((({{,((((((....))))))...,|||,,,.....,},}|}}}||||}}}}||||,,.||||,||{{....)))),))})))}),,,..)))))))|,,{{(...........}}}...((((((((((((({(((..{{((((((((((.{((({.....,))))}.......))))))))))))))}.......,|||,.....,,,}))))))))))))).,,,|||}}},..|||||||,|}||,},|||||,...(((((((((((...(((.((((((..(((((((..(((((((.,,..........,,..))))).))..))))))){(.((((.......)))).))..)))))))))))))))...))))).......(((((((..........((((((....)))))).,.......)))))))..))})))})})}.}}))))))){,({(((((({.((((((((((....,.((((({(({,{..............)),}},))))).)...)))))))))))...))))))})),).,))))))||}}}.,,.)).(((((...)))))..{.((((......)))).}.{({{,........}}))}}},||||.....})),))))))))))))))))}))))))).)).)))........................,,,......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001283012.2 NCBI
AGUCAGAGCAGCGGAGCUGCCCCGAACAAAGAUGGCGCGGGAAGCGUCU… 2266 nt 0.4607
NM_022783.4 NCBI
AGUCAGAGCAGCGGAGCUGCCCCGAACAAAGAUGGCGCGGGAAGCGUCU… 2569 nt 0.4570
Summary

Enables phosphatidic acid binding activity and protein serine/threonine kinase inhibitor activity. Involved in several processes, including negative regulation of TOR signaling; negative regulation of cell size; and negative regulation of protein kinase activity. Is active in lysosomal membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly dysregulated the DEPTOR in microglia, implicating it within the autophagy pathway as part of the profound transcriptomic changes contributing to glial cell dysfunction [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].