Basic Information

Symbol
DGAT1
RNA class
mRNA
Alias
Diacylglycerol O-Acyltransferase 1 ARGP1 DGAT Acyl-CoA Retinol O-Fatty-Acyltransferase Diglyceride Acyltransferase EC 2.3.1.20 ARAT Acyl Coenzyme A:Cholesterol Acyltransferase Related Gene 1 Diacylglycerol O-Acyltransferase (Mouse) Homolog Acyl-CoA:Diacylglycerol Acyltransferase Retinol O-Fatty-Acyltransferase ACAT Related Gene Product 1 ACAT-Related Gene Product 1 EC 2.3.1.76 EC 2.3.1 DIAR7 AGRP1
Location (GRCh38)
8:144314584-144326910
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis Cause of death analysis Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_012079.6
Sequence length
3653.0 nt
GC content
0.6315

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1706.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1763.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1041.10
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((.((......)).)))))((((((((..((((....))))...(((.((((.((...)).)))).)))..((((((.((((((((((((((((((.((........)).)))))))))).(((.(((((.(((((.(....).)))))))))).)))((....))...(((((.((((((((....)))))))).)))))..)))).)))).))))))(((.(((...)))))).)))))))).(((.((..(((((..(((((((....))(((((((((((((((.....(......)....)))))))))))))))...(((((...)))))((((.((.((((((...((...((..((.(((((((((.((((.(.(((.....(((((((((((((((((.....(((........)))......)))))))))..))))))))((((((..(((((..(((.((......))))).))))).)))))).(((((......(((((......)))).).......))))).((((..(((....)))..))))))).))))).))))))))).))..))...))....)))))).))))))..((((((....((((((((..((....))..))))))))..)))))).((((.((((...((((((((((....((((((..(((((((..(((((..(((((((((((...)))))))......))))....)))))(((((((((((..((((((.(.(((((((.((((((((...)))))))).).))))))).)).))))((((((((((.............(((((.((.......)).)))))..((((((((.(((.(((((.((((((((((.(((((((((((..((.((((((((((((((....((((.(((....(((...(((((..((((((((.................))))......(((((((.((((((............))))..((.((.((.(((.((((((..((.((((..((.....((.((.((((.........))))))))(((((((.(.(((((....))))).).))))))).((((....(((.((((....)))).)))..))))...))..)))).))..)))))).))).)).)).))(((((.((((..((..(((..((((((.......((((.(((..(((...........))).))))))).)))))).)))..)))))).)))))((((((((((((....)))))))))))).(((((((((........)))))).)))(((...)))..))))))))).))))..)))))...)))....))).))))....).)))))))))))))..))((.((((((((((....)).)))))))))))))))))))))..((((((((.((((((((((....(((.......)))....)))))))))).))......(((.(((......))))))((((.(((((((.(((((....)))))...(((((..(((..(((((.((((((((...........))))))))))))))))..)))))...)))))))))))....)))))).......(((((((((..((((.........))))..))).))))))(((........)))..(((((.(((((..((((.(((.((((((..((((((((...(((.((((((.((((...(((.((((.(.((((((.(.((((..((((((..(((.....(((((...)))))....(((((((((((.(((((.(((((.((((.((((((((...)))))..))).))))((.(((.....))))).(((((((((((...(((........((.((((...((....))...)))))))))..)))))))))))((((((((((....(((((..(((.(...(((....)))...(((((((((((.((((((((.((.....)).)))).)))).).))))).)))))...).)))..)))))(((..((((((((...((...(((....)))))))))))))..))))))))))).))...(((...)))((((.(....).)))).))))).)))))..))).))))))))...))).))))))..).))).).)))))).).....)))).))))))).))))))))).)))))))))))))).))).))))....)))))..)))))..((((((((((.(((((.(((((.....)))).).))))).))))))).)))(((((((..((((((((((...(((....(((((((((....))))))))).)))..((((((((((..((((((((((((((.((((.......)))).((((....))))(((((..(((((((...))))))).))))))))))))(((...)))......))))))).))))))))))..))))))).)))))))))).((((.((((.....)))).))))))))).....))).)))))))..))).)))))))).(((((......))))).((((((((((((((((.(((((((.(.(((((.((((..((.((((((((..((....))....((...(((((((................))))).))...))....)))))))).)))))).))))).).))))....))).)))))..(((((((..((.((((((....))))))))..))..))))).)))))))))))((((...)))).....(((((((((..(((..(((((((((((((((.((((.........)))))))).)))))))...((((((.((((((....))))))...))))))(((((((((.(((.(((((((.....(((((((.((((((((((((((((((..((....))..)))))))).((((((.((((((..(((.....(((((.(((((((((..(...........(((((((........)))))))..)..))))))))).)))))...((((((((((((...((((((((...)).))))))............((((((.....))))))....(((((....(((((((((.(((...((((.(.......).)))).)))..))))..)))))....)))))........)))))))))))).(((((.(((....))).))))).((((((((((((((...(((((.(((.......))).)))))..........(((......)))))))))))))).)))))).)))))))))))).(((...)))..))))))))))))))))).))))))).))).(((((...........)))))..))))))..))).)))).)))..)))))))))..)))).))))))........))))))))))).(((((...(((((....)))))))))))))))))..))))))))))))))))............)))).)))))))))..)))))..)).)))((((((((...........))))))))))))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
,{,{{((((((,{({,.{,,||.,}}))}|||||{,{,((({,.,,||||||.{{|}|||(,((,,.}|,|||}{|||(((((((({((({((((,{{{{{{{((,(({{{,,{,{||{||||||}}}|{(((.(((({{(((((.(....).)))))))))).))).},.,.}}}},(((((.((((((((....)))))))).))))),.||||.||||.|,||||.((((((((((.(((((..({.{(((((....))))).,..)}.))))).))).)))||))){||||,(((((((((((((.,.,.((((|{{((((,,(((,...,)))..)))))|(((.((.((((((...((..,({..{,,(((((((((.((({,{.((({{,,,(((((((((((((((((..,..{{{.,,.....)}}......)))))))))..))))))))((((((.,{((((..(((.((......))))).))))).)))))).{{{{(,...,,|({((......))}).}.....,.))}}).||||,.{(({{{{||,..))),)))}))))).))))))}})})}..))...)}....)))))).)))))}..((((((....((((((((..((....))..))))))))..)))))).....((((((.(((((.(((.((((..{{({{((({,{{(,,||||}|}}||,|||(((({...}))))||{{{.{{||,.....,,)))),.})))}|,,(((((.(((.....)))..)))))))))})))))))))))))..}))))).)))).))))))))).,..|||{,,,.|{,||||||.||||||,}}.,(({|({({((((({.(((,((((({{(({{{(({.,(((((((((((..((.((((((((((((((....((((.(((....(((...(((((..{(((((((.................))))....,.(((((((.((((((............))))..{(.((.((.(((.((((((..((.((((..|||,...{{,({.{{((........,|||||}||(({(({({(,(({{{,,..|||||{|,}}}}))),||||....((({((,,.,,.,,,,.)),}}))))...,,..)))).))..)))))).))).)).)).))(((((.((((..{(..(((..((((((.,.....{{{{.(((..,,,.......},..},,.)}})})).)))))).)))..)})))).)))))((((((((((({....}))))))))))).(((((((((........))))))},))((,...,,),.))))))))),))))..)))))...,)),...))).))))....).)))))))))))))..))((.((((((((((....)),})))))))))))))))))))).,..{,.{({,((((((({((,...(((.......)))....))))))))))|||{.....{||}|{(,,,|||||||}},{|||||{|||{,||{{...||}||||..,,,{({,.,{(,.(((((.((((((((..........,)))))))))))))})},{{{{{{,..{,,|{{|,......)))),,}...,})))}|{{{{{|},||||,||{{{{{{||||..,,,,(((||(((({{({({{{(((.,({(((.(((((..((((.(((.((((((..((((((((...(((.((((((.((((,{{((({((((,..,,((((((,((((,{((((((.{((,.....|||||..,)))||.{{{(((((((((((,((({(,,(((..((((.((((((((...)))))..))).)))),,.|||,}.}}}||{|,(((((((((((..,(((........((.((((...{(....},,,.))))))}))..))))))))))),,}|||||||||.{(({{,|.({(,,..}||,|.},)))}.{((((({{{{||,|||((({{.{|,,.,,|},||||{|}}}.),))),),)))))}))}}})}}..,)))||,||||||||||,..||},,|||....|||.,.{{{||||,|||}|}}}}}}}.,|...,{|,,{|||{(((.{....}.))))},))),.}}}}},,))),)))})))),,.))).}}}}}),.,,,,|{|{|||,}}.....}}))))}}},)))).))))))))).)))))))))))))).))).))))....)))))..)))))..(({(((((((.(((((.{((((.....)))).).))))).))))))).}))|{(((((,.{(((((((((...(({....(((((((((....))))))))).)))..((((((((((..((((((((((((({.,(((.......)))|{((((....))))||(((,.(((((({...})))))),|}},,}}))}}}(({,..}})}}..},))))))).))))))))))..))))))).))))))))||,,}||}||}.}}).})).)))))))))})),,}}))),},||||}.,|||,||||||||.(((((......))))).,.,))}))}...{|||,||{{{||}|.{||{{,||||,..|}|||,||||,}|}}}}}))}...||,,}}||||||,,,}}}}}......,,,}}|||.,..,))..||||}}||||.},},))})})))}}.||||{{{{|},.}},|((((((({{(((.((((((((......((((....))))......)))))))).))))},})))))}.....(((((((((..(((..(((((((((((((((.((((.........)))))))).)))))))...((((((.((((((....))))))...))))))(((((((((.(((.(((((((.{...(((((((.((((((((((((((((((..({....})..)))))))}.((((((.((((((..(((.....(((((.(((((((((..,........,,.(((((((........)))))))..,..))))))))).)))))...{(((((((((((...(((((((,...,).)))))).........{..((((({..{{.,,))}}..}}|||||....|{{(({(({.{({.,,{(((....{{{{{|{|||,.,,,..))).}})))))}..,}})),..,,,,..)))))))))))}.(((((.(((....))).))))).((((((((((((((...(((((.({(,,....,))},)))))..........(({......}))))))))))))).)))))).)))))))))))).(((...))),,))))))))))))))))),))))))).))).(((((...........)))))..))))))..))).)))).)))..))))))))),|}}},,}}}|}.......,|,,}})}}}}}}..,}|}))}|}}|{{{{{{{|.||,,,,.(((((((((((.{,,.(((((.{.{.((((((....))))))}.}.))))),.)})),}))))))))((((((...........))))))...,))))}}}}}},.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_012079.6 NCBI
AGUUAGCGGCUCCGGAGCAACGCAGCCGUUGUCCUUGAGGCCGACGGGC… 3653 nt 0.6315
Summary

This gene encodes an multipass transmembrane protein that functions as a key metabolic enzyme. The encoded protein catalyzes the conversion of diacylglycerol and fatty acyl CoA to triacylglycerol. This enzyme can also transfer acyl CoA to retinol. Activity of this protein may be associated with obesity and other metabolic diseases. [provided by RefSeq, Jul 2013]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the DGAT1 gene was upregulated in common in both blood and spleen leukocytes across three distinct models of systemic inflammation and injury—trauma/hemorrhage, burn injury, and lipopolysaccharide infusion—at a 2-hour post-injury time point [Brownstein et al. DOI:10.1152/physiolgenomics.00213.2005]. This upregulation was identified through large-scale microarray analysis and represents part of an early transcriptional response common to different inflammatory stimuli.