Basic Information
Symbol
ADRM1
RNA class
mRNA
Alias
ADRM1 26S Proteasome Ubiquitin Receptor
GP110
PSMD16
ARM1
Proteasome Regulatory Particle Non-ATPase 13
Proteasomal Ubiquitin Receptor ADRM1
110 KDa Cell Membrane Glycoprotein
Adhesion Regulating Molecule 1
Rpn13 Homolog
Rpn13
ARM-1
Adhesion-Regulating Molecule 1
Proteasome Ubiquitin Receptor
M(R) 110,000 Surface Antigen
HRpn13
Gp110
Location (GRCh38)
20:62302066-62308867
Forensic tag(s)
-
MANE select
Transcript ID
NM_007002.4
Sequence length
1379.0 nt
GC content
0.6323
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-578.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-596.61 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
443.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((.(((......(((((((((....)))...))))))((((..(.....)..)))).))).)))))))....((((((....))))))...(((((..(((((.(((....))).)))))..((((((.((......((((((...))))))..(((......)))...(((((((.(((((((((.((.(((((((...((((..((((((....(((((((((((((...((((..((((.(((((.(((((((....)))..)))).))))).)))).))))...))).))))))......))))....))))))...))))...))))))))).)).((((((((.......(((((((((((((.(((..(....)..).))..)))))).)))))))...(((((...(((...((((...........((((((.((((...)))).))))))(((((((..((.((((((((...(((.((((.....)))).))).)))))).))...)))))))))....(((((((........)))))))..))))....)))...)))))...((((((...(((((((.(((((((((((((((...((((...))))((((((((.....))))))))((((.((((((.............))))))))))))))))))....)))).))).))...)))))...)))))))))).))))...))))))).)))))))......((((...))))..)).)))))))))))(((((((((((((((..(((.((.......))..))).)))....((((.......)))).(((.((((((.(((...((((..(((.....))).))))(((((.(((((.((((((((.........)))))).)).))))).).))))........((((((((((.((....)).)))))....)))))....(((((((............)))))))(.((((.((((((((((.(((((...(((......))).......(((((((((...(((((..((((.(((.....))))))).)))))...)).)))))))....))))).)))......)))))))..)))).)))).)))))).))).......((((.(((....((((..((....)).))))...))).))))..((((...........))))........(..(.....)..).....(((((((....((.(((......))).))...)))))))..)))))))))))).....((((...))))..))))..............((((........))))..................
Thermodynamic Ensemble Prediction
{,(((((((((.(((......(((((((((....)))...))))))((((..(.....)..)))).))).)))))))})}.((((((....))))))..{(((((.{(,(((,,,,....)))},)),)}}|||((((((,,,{,.((((((...)))))),,(((,...{{|(|...,{||||,.{{||{||||..{.((((((({{.(({,...,,,,,...,}.|.}}}}}})||.,.((((..((((.(((((.(((({((....)))..)))).))))).)))).))))...|||.|{|{((({((.(((((((((((((((.((((,|,{.({,({{..{{{..(((({,,,.....,.(((((((((((((.(((.,(...,)..).))..)))))).)))))))..}))|,}}}..||}.}|,}},...,....})))))))....))))))))))),))|((((((,,,{{,((({{{,|...{{|,||{|,,,.}))||{|||{|||}||{||{{.({||((|({,...(((((((........))))))),.}}||,|,{|.|,,{}|}||.,(((((((..,(((((({{((((((((((,((({..{((((,,,|}}|((({{{{(,,,,,|}|}|}}|((((.((((((.,...........))))))))))))))))))|,,.))},.))),),..,}))))...})))))),)}})))}.,.}}})))).}})))))|,.{,,({((,..}}))..}}.))}}))))}}}(((((((((((((({..{((.((..{{...,,.))..)))),.)))|{{,,.,,,.)}||,(((,((((((|(((...((((..{((.,...}}}.}))){||||.(((((.((((((((.........)))))).)).))))).},))||........((((((((((.((....)).)))))....))))),,..|||{|{{....,,,..,,,))))}))}}||,({((,,,,,|||},{(((.,.(((......))),.}}}({(((((((((.,.(((((..((((.(((.....))))))).))))),,,)),))))))))...}||}|||}||...,,))})))}{{|||,.{|||.||||||,|||{......||||.{((....||||,,{|},.}))}.)))}}.,,,.}},,..((((...........))))..,.}}..|..|.....),.,.....(((((((....((.(((......))).))...)))))))..))))))))))))..||||,||.,}))))}}))))}}}...}}}}}.}}|{{{........}}}}...,})}}..}}}}}}..
Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GUUAGAGCCGGCUGCGCGGCUUACGGGGCUCAAUCGGCGGCGAGAGCGG… | 1375 nt | 0.6407 | |
| GUUAGAGCCGGCUGCGCGGCUUACGGGGCUCAAUCGGCGGCGAGAGCGG… | 1379 nt | 0.6410 | |
| GAGGAAGAGCGAGCCCGGACGGCGCCUCUCGAACGAGUGUGGGCGCGAG… | 1379 nt | 0.6323 | |
| GUUAGAGCCGGCUGCGCGGCUUACGGGGCUCAAUCGGCGGCGAGAGCGG… | 1492 nt | 0.6361 |
Summary
This gene encodes a member of the adhesion regulating molecule 1 protein family. The encoded protein is a component of the proteasome where it acts as a ubiquitin receptor and recruits the deubiquitinating enzyme, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase L5. Increased levels of the encoded protein are associated with increased cell adhesion, which is likely an indirect effect of this intracellular protein. Dysregulation of this gene has been implicated in carcinogenesis. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2013]
Forensic Context
No relevant information is available at the moment.