Basic Information

Symbol
DGKZ
RNA class
mRNA
Alias
Diacylglycerol Kinase Zeta DAGK6 HDGKzeta DGK-ZETA DAGK5 Diacylglycerol Kinase, Zeta 104kDa Diglyceride Kinase Zeta DAG Kinase Zeta EC 2.7.1.107 EC 2.7.1.93 DGK-Zeta
Location (GRCh38)
11:46332905-46380554
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001199267.2
Sequence length
3588.0 nt
GC content
0.6519

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1649.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1707.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 871.59
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001105540.2 NCBI
CAAACUAGGACUUGCUCAGCAGAGGCCGCCAGCCCGGAGCUGGAUCCAG… 4072 nt 0.6491
NM_001199266.2 NCBI
GGCACUUCCUGGAGCGGCGGCGGCAGCGGCUUCCCGGGCACCUGGGCGU… 3606 nt 0.6525
NM_001199267.2 NCBI
GGCACUUCCUGGAGCGGCGGCGGCAGCGGCUUCCCGGGCACCUGGGCGU… 3588 nt 0.6519
NM_001199268.2 NCBI
GGCACUUCCUGGAGCGGCGGCGGCAGCGGCUUCCCGGGCACCUGGGCGU… 3522 nt 0.6528
NM_003646.4 NCBI
GGCACUUCCUGGAGCGGCGGCGGCAGCGGCUUCCCGGGCACCUGGGCGU… 3591 nt 0.6519
NM_201532.3 NCBI
ACUCGGGUGCGCGGCAGCAGCGGCGGUUGCAGGAGCUCGCUCUCCGCCC… 3792 nt 0.6551
NM_201533.3 NCBI
AGCUGGCCCCAGCCAGCGGAAGGCGCCUAUGAGCCCUGAGCCUGUGGUC… 3560 nt 0.6374
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the eukaryotic diacylglycerol kinase family. It may attenuate protein kinase C activity by regulating diacylglycerol levels in intracellular signaling cascade and signal transduction. Alternative splicing occurs at this locus and multiple transcript variants encoding distinct isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Nov 2010]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the DGKZ was part of a 13-gene prediction model (HF.Sig) derived from peripheral blood immune cell analysis that could accurately distinguish between post-myocardial infarction heart failure and non-heart failure patients, achieving an area under the curve of 1 in a validation cohort [Sun et al. DOI:10.3389/fimmu.2023.1163350].