Basic Information

Symbol
DHX35
RNA class
mRNA
Alias
DEAH-Box Helicase 35 KAIA0875 C20orf15 DDX35 DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) Box Polypeptide 35 DEAH (Asp-Glu-Ala-His) Box Polypeptide 35 Probable ATP-Dependent RNA Helicase DHX35 FLJ22759 Putative ATP-Dependent RNA Helicase DHX35 DEAH-Box Protein 35 DEAH Box Protein 35 EC 3.6.4.13 EC 3.6.1
Location (GRCh38)
20:38962299-39039723
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_021931.4
Sequence length
3314.0 nt
GC content
0.4909

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1132.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1189.65 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 932.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001190809.2 NCBI
AGCCUCGUGACCUUUUACCCCAACAUGGCUGCGCCCGUGGGACCGGUGA… 3221 nt 0.4943
NM_021931.4 NCBI
AGCCUCGUGACCUUUUACCCCAACAUGGCUGCGCCCGUGGGACCGGUGA… 3314 nt 0.4909
Summary

DEAD box proteins characterized by the conserved motif Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), are putative RNA helicases. They are implicated in a number of cellular processes involving alteration of RNA secondary structure such as translation initiation, nuclear and mitochondrial splicing, and ribosome and spliceosome assembly. Based on their distribution patterns, some members of the DEAD box protein family are believed to be involved in embryogenesis, spermatogenesis, and cellular growth and division. The function of this gene product which is a member of this family, has not been determined. Alternatively spliced transcript variants have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2010]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.