Basic Information

Symbol
DICER1
RNA class
mRNA
Alias
Dicer 1, Ribonuclease III HERNA K12H4.8-LIKE KIAA0928 Dicer Dicer 1, Double-Stranded RNA-Specific Endoribonuclease Dicer 1, Ribonuclease Type III Endoribonuclease Dicer Helicase MOI EC 3.1.26.3 MNG1 Dicer1, Dcr-1 Homolog (Drosophila) Helicase With RNAse Motif Helicase With RNase Motif Multinodular Goitre 1 Dicer1, Dcr-1 Homolog EC 3.1.26 Dicer1e RMSE2 DICER DCR1 GLOW AviD
Location (GRCh38)
14:95086228-95158010
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_177438.3
Sequence length
10384.0 nt
GC content
0.4016

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2764.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2965.87 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3095.86
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
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NM_001271282.3 NCBI
AUCCUAAGGCUGGAUCUUUUCAUGGGUCUGUGUAGUGUAAUUGCAGCAG… 10263 nt 0.3908
NM_001291628.2 NCBI
GCGGAAGUGGGUGUUUGUUAUUUCCCCAAAUGCGGAGGCCCCUGCACCA… 10160 nt 0.3921
NM_001395677.1 NCBI
AGAGGGAAGCUAAGCUCUCCGGGAAACAAUUACGGCCACGUUACGGUCU… 10434 nt 0.3942
NM_001395678.1 NCBI
AGUGGGAUUCUCCAAGCGGCUGUGCGCCGUUGCCGCGGGCCGUGCGCUG… 10223 nt 0.3959
NM_001395679.1 NCBI
AGUGGGAUUCUCCAAGCGGCUGUGCGCCGUUGCCGCGGGCCGUGCGCUG… 10551 nt 0.4012
NM_001395680.1 NCBI
AGUGGGAUUCUCCAAGCGGCUGUGCGCCGUUGCCGCGGGCCGUGCGCUG… 10390 nt 0.3956
NM_001395682.1 NCBI
AGUGGGAUUCUCCAAGCGGCUGUGCGCCGUUGCCGCGGGCCGUGCGCUG… 10694 nt 0.4019
NM_001395683.1 NCBI
AGUGGGAUUCUCCAAGCGGCUGUGCGCCGUUGCCGCGGGCCGUGCGCUG… 10485 nt 0.4015
NM_001395684.1 NCBI
AGUGGGAUUCUCCAAGCGGCUGUGCGCCGUUGCCGCGGGCCGUGCGCUG… 10527 nt 0.4023
Showing 1 to 10 of 27 entries
Summary

This gene encodes a protein possessing an RNA helicase motif containing a DEXH box in its amino terminus and an RNA motif in the carboxy terminus. The encoded protein functions as a ribonuclease and is required by the RNA interference and small temporal RNA (stRNA) pathways to produce the active small RNA component that represses gene expression. This protein also acts as a strong antiviral agent with activity against RNA viruses, including the Zika and SARS-CoV-2 viruses. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2021] CIViC Summary for DICER1 Gene

Forensic Context

A study in mice demonstrated that Dicer, an RNase III enzyme, is a core component of miRNA biogenesis that cleaves pre-miRNA hairpins in the cytoplasm, with its activity and substrate selection regulated by its N-terminal helicase domain and cofactors like TRBP [Shang et al. DOI:10.1038/s41576-023-00611-y].