Basic Information

Symbol
AEBP1
RNA class
mRNA
Alias
AE Binding Protein 1 ACLP Aortic Carboxypeptidase-Like Protein Adipocyte Enhancer-Binding Protein 1 AE-Binding Protein 1 Adipocyte Enhancer Binding Protein 1
Location (GRCh38)
7:44104295-44114565
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001129.5
Sequence length
4097.0 nt
GC content
0.6241

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1637.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1706.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1413.86
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.(((((((((.(((((..(((((.((.......)).))))))))))..(((.((...)).)))...(((((.((..(.((((........(((.((.((((((((((.((..(((..((((((((((((..((((..((..((((..(((.......(((((.((((((((..((....))............(((((.((((..((.((((((((((((........(((((((.((...(((((((...(((((((..(.(((.....))).......(((((((((..((.(((((.((((((.(((((.......))))))))))).))))).))...((.((((((((....))))..))))))..........))))))))).((..(.((((....)))).)..))...((((((....))))))((((((....((.......))....))))))(((((((.((.((.((....)))).))))))))).(((((((.....(((((.(((......(((((((((((.((..((((.((((((((((.((((((((...((((((..((......))...........((((..((((...........((((.....(.(((...(((.((((((((.((((((....(((.(((......((((((((((((..((((....((((.((..((.((((((((((((((((((...(((.........)))...((....(((......)))..)).....(((...(((...((..((((.(((....(((.(((.....(((((((.(.(((...((((...(((((((((......(((((.(((((..(((((................)))....))..))))).))))).(((((((....)))))))......((((......))))))).)))).))...))))((((..((.....)).))))(((((((((...(((((((...........((((.(......).)))).(((((.(((((..((...))..)))).....).))))).((((((..(..(.(.((((.((.((........)).)).)))).).)..).))))))(((((((((((.((.....((.(((((((((((.((((((...((((......))))((.(((.((((((((((((((((((((((.((......((((((((((.((((.((..(......)..))))))))))))))))((((..(((((((((.......)).((.(((((.....))).))..))..........((.((((......(((.....)).).....)))).))..))))))).))))..)).)))))))))....))))).............(((((...(((.((.((.(((((((((((..((((....(((((.(..(.((...((((((......)))))))).)..).)))))....((....))...))))..)))))))))....)).)).)).))).))))).((((((((((((((((.((((((.(((((((((((..((........))..).)))))).)))).)))......((.((((((((((((((((...(.((((((.((..((.(..((.(((((((((...((....((.((((((((.(((((((((.....((((..(((((((.(..((((.(((((((((((((((....)))...((((...((((((((((.(((((.(((((.((.(((..(.((....((((((...(((........))).))))))....)).)..))))).))))).))))).............))))).))))).....))))...(((.((.(((.(.((...(((..(((((((((((..((.(((((((((.((....((......)).......)).).)).)))))).))..))).......)))))))).)))...)).).))).))))))))))))))))).))))......((((((.............))))))...((((((((....))))...))))).)))))))))))...))))).)))).)....))))))))))).)))))))))))..)))..)))))))).).)))))))).))).))))).))..))).)))))))...)))).)))))((((....))))..((((((((.((.((..(((((((((...)).))).))))..))))))))))))......((..((((((.(((((.(((........))).))).)).))))))..)))))))..)))))).))))))))..))))).)))))).)).....)).))).))))))))..((((....))))....))).))))..))))).))))((((((.(((.(.((.(((......))).)).)))).))))))..........)))).)))))))..)))..)))..))).(((((....)))))(((((((((((((((.......)))))))............)))))))).)))).))...)))....)))((((.(((((((.((((.((....)).))))))).)))).))))..(((.((.((.(((((((((....)))..)))))).)))).)))((((((((.((.(..(((((((........)))))))...).))....))))))))))))))).....))))))..((((((((....(((.........))).......))))))))((((..(((..((......)))))))))))))).))......))))))..))))....((((...))))...........((((((......(((.......))))))))).))))))))).)))((((((((....(((((((((((..(.((((..((((((...((((...((((...(((.((((((((((((((((((((((..((((...((.((((....(((((((.(..(......)...).)))))))..))))..)).))))..))))))))((((......))))((.((.((((..(((((((((....)))))))))...))))..)))))))))))).(((((((......))))))).(((......))).))))))....)))....))))..)))).....))))))..)))).)((....((.((((((.(((((((....)).)))).).)))))))).....)))))))..)))))).((......))...))))).)))...))).)))..)))))))))..)).))).)))...))).)...))))........))))....))))))))))...)))))))).((((......)))).......)))).))))..........)).))))..))))))))))))).(((.((((((((((.......(((...(((..((((((........)))..)))..)))...))).(((..((((...))))..)))...))).))))))).)))..))).)))))..))))).))..)..)))))))....)))))))...).).)))))))((((((((.(.((.......)).))))))))).....)))))).)))))).)).)))))))))))))).))))))))..(((...)))((((...((((((((((....((((....))))...)))))....)))))..))))...((((.(((((((((...................(((.....))).((.(((((......((((((..................))))))...)))))))...))))).)))).)))).)))..)))).))....))))....)))))))))).....))...)))..))..))))))))))..)).)))..((((((((((((((((((((((((((.....)))))))))..)))).).))))))))))))...))).).)..)).))))).))))).......)))).).)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.(((((((((.(((((.,(((((.((,,,.,,,|}.}}}|||||||{.((({{,...||||||,.,({(((.((.,{.,{{{,.,,..,.(((,((,({(((((((,{{{{({.(((((((((((({{{,,((((,,(({.({((,,(((..,,,,,((({((((((((((..((....}}..,,,,......(((((.((((..(({(((((({(((((........((((({{,(,,,,(((((((.{{(((({{{,,{.,,(,,,{{||}.......(((((((((..((.(((((.((((((.(((((.......))))))))))).)))))||}...((.(((({(((....)))}..))))))...,.,}},.))))))))).((..(.((((....)))).)..))...((((((....))))))||||||...}||.,.{,{.,...,,})))}}(((((((.({.{(,((..,,}}}|||))))))|}.(((({((,{,{{((({{.,,,.}},,.{||||||||{..{{..|||{.(((((({{((.((((((((...{{{{{{|,{{......}}.........}}||||..,||{............((({{...||,|||..,||.|{||{(((.((((((....,||||{{||,.,.||||{{{{({{|.((,..{{..(((......,..(((..(((.,..,,{.|||..|||......,..|||,,{|{,{,.(({......|||,.,,.....{{{...,{{...(({.{{,,.|||......,..{{,{{(,{{{|||{.{.(((...{{{{,,{||{{{{{||||....{{|||.|||||,.,{(((((..{((,({{{{{{(,{,..,.))).))),.....)).))).))))}},|{|||||......((((.....,))))))),)).,.,||..||}}{(((.,((,....}}.})))|,||{||||},,||,,||},}}...,,.,.((((.(......).))))...}}}})))||}.{{..,||,.||{{{{{,.,.||}|{,((({{,.,{..({(,((((.,{.{{..,,,...||,||,|||}....,{|{||||||({({((({{((.{{.,,..||,{|{||{{((({.(((((,,,.{{((......||||((.(((.,(((({{(((((((((((((((.{(,.....((((((((((.{(({,((..,......),,,))})})))))))))),||(,.(((((((,{.,.....,,.({.{{(((.....))).)}..}}.......}}.((.((((......{((.....)).}..,..)))).))..))))))).)),,,.}).)))))))))....))))).,...........((((,....||}||,||.,|||{||||||..{((({{{,{{{,{......||..,|||||{,,,...))),||}.,|,.|.}}},..,,.}),}..}},},)))).,)))))))),,}))}}.,,.,),)))}))})).(({(((((((((((({.{,,(((.(((|(((((((..((........))..).)))))).)))).))),...,.{{.{{{{{{{{{{{{||||,,,|.|||||{.{{.,||.|,.{,.|||||{{((,,,((,{{,(,.{((((((,.((({{{{({,,...{{{{,.(({{{((.,..{{{{.||,|||||(((((((....))).,}||((,..((((((((({.(((((.(((((.((.(((..(.((,{,.((((((...(((........))).))))))..),)).)..))))).))))).)))))....,...,,,,,)}})).}}}}}.,..,)))).,||||.||,|||,{.{{.,.{{|,.||||||||||{,,||,|{|||{{({,({,.,,{(,.,,..}}..,,..,}}|)|)),)))}}},}}..}}},,,...,|||||}}}.}})}}.}}.).)}}.}}}))))}))))}}}))}))}}..,...({{{{{..,.,,.,,....}}}}}}...{({{{(((,,.,||||....||||.||}}||||}|||,,||||}.||||,|.,..}}}}}})}|||.}|||||}|||,..))).,))))}))).}.)))))))),))),))))).},,}))}.))))))}.}}))),)}))||((((....))))},(((((((({,{.((,,((((,(((....))})))}}))},.}}}))))))))).....{((..((((((.(((((.(((........))).))).)).))))))..))))))}.))))))),}}}}}})}..}}|||,||||||.||,{,..}},}||,|||||}}}..,{{{.,,.}|||{|{||||{}}}}..,}}||,||||{(({{(|{|{,||{{|((...,{{{.|{{|....))).})))}..........)})}.)))))}}.,}},.,|}}|,}}}.(((((,.,,)}}}}{{{{|||||{{((({.|.....))))))}|{{,{.....,||))))}}|,||||.||...}}},...}|}((((.(((((({,((((.{,....,}.)))))))})))).))))..{{{.((.((.(((((((((....))),.}))))),||||,|||(((((({(,({.,{,((({(((,,,,,..,|||||}}.,,|.}}..,,}}}}}}}})))))))))...))))))..||||{{{{..,,|||...,,,,..|||,,,..,,||}}}|||({{{..|||..((......)))))))}},)))).))|||,.{(({{((....))...)||||..,||||.........,.{,,{{|,,..,}|,,.......,)))))).))))))))))).)))|||||||,....{{{{{((((((,{,(((((,.((((({...((({...,,||...,||.||||{{||||||{|||||||{{,,|{||,.,|{,||||,...|{{((((,({.{{...,.||,.|,}}}}))).,))))..)),)))),,}}}}}}||((({|.....,},}((,((.((((..(((((((((....)))))))))...))))...,}}||||||||.(((((((......))))))).,,|}}.}}))),.,)))))....|||,..,||||..,,,},}),,))))))}})))}.,{{....||.((((((.,((((((....)),,))).}.)))))))),,...}}}}}}}..)))}}),||}}}.}}))...))))).))),..)))})),..},}}))}}},..|{|||{||}{,,|}}|||..}},,.......,))))}}}})}))))))})...)))))))).((((......)))).......)))).)))),,......,,)),)))).,))}}}||}|||||,(((,{{((((((((,{,....{{...{{(({.,.,||||||...(((((,.{{{,,.{||},|||{{{{.,(({{...))}}..)))...))).))))))).}}}..}}|||},|||,}}|}}.}}.,...))))))},,},))))))),,,},}.}))}}}}((((((((.(.((.......)).)))))))))....,)))})).}))}}}.||.|||}}}}||}}}}}.}}}}}}}}..(((...}}}{{||,..((((((((((....((((....))))...)))))....))))),,|||}...((((.(((((((((.{...,.,{,.........|||...,{|||.((.(({{{...|..||||((.....{,........,,,|}}}}}..}))}}))}...))))).)))).)))).}))..)))).)),,..||||,,..}})))))))}......,..,))).}),..)})))))))),,)).))).,{||||{{|||{{|{{((((((((({{..,,,))))))}})}}}))).),}))})))))))),,.))).))),))).}}))).))))),......,))).).)))).

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001129.5 NCBI
GCCAGCGCUUUGGAGACGGCUAUCCGCGCGGGAGUGCGCCACGCGGGGC… 4097 nt 0.6241
Summary

This gene encodes a member of carboxypeptidase A protein family. The encoded protein may function as a transcriptional repressor and play a role in adipogenesis and smooth muscle cell differentiation. Studies in mice suggest that this gene functions in wound healing and abdominal wall development. Overexpression of this gene is associated with glioblastoma. [provided by RefSeq, May 2013] CIViC Summary for AEBP1 Gene

Forensic Context

A study in mice and humans identified the AEBP1 as a novel regulator of cardiac fibrosis, primarily acting in POSTN+ fibroblasts and ACTA2+ myofibroblasts [Wang et al. DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143171].