Basic Information
Symbol
DIO2
RNA class
mRNA
Alias
Iodothyronine Deiodinase 2
TXDI2
SELENOY
SelY
Deiodinase, Iodothyronine Type II
Type II Iodothyronine Deiodinase
Thyroxine Deiodinase, Type II
Type-II 5'-Deiodinase
Selenoprotein Y
Deiodonase-2
Deiodinase-2
Type 2 DI
DIOII
5DII
Type 2 Iodothyronine Deiodinase
Type-II 5'Deiodinase
EC 1.21.99.4
EC 1.97.1.10
EC 1.97.1
ITDI2
D2
Location (GRCh38)
14:80197526-80387757
Forensic tag(s)
Other applications
MANE select
Transcript ID
NM_013989.5
Sequence length
6017.0 nt
GC content
0.4002
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1710.47 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-1829.10 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
1461.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GUGAGACUGGUCUAGCCUCCCAGCCUACAUCUUUCUUCAGUGCUGGAUG… | 6374 nt | 0.4076 | |
| GCAGAGAGAGGCACUUUGCACCACAGACAGAUAGCAAGAAGGGAAAGAC… | 6383 nt | 0.4011 | |
| GCACAAGGGAACUGACUCAGGAGGCAGAGAAGAUGGGCAUCCUCAGCGU… | 6017 nt | 0.4002 | |
| GCACAAGGGAACUGACUCAGGAGGCAGAGAAGAUGGGCAUCCUCAGCGU… | 6017 nt | 0.4002 |
Summary
The protein encoded by this gene belongs to the iodothyronine deiodinase family. It catalyzes the conversion of prohormone thyroxine (3,5,3',5'-tetraiodothyronine, T4) to the bioactive thyroid hormone (3,5,3'-triiodothyronine, T3) by outer ring 5'-deiodination. This gene is widely expressed, including in thyroid and brain. It is thought to be responsible for the 'local' production of T3, and thus important in influencing thyroid hormone action in these tissues. It has also been reported to be highly expressed in thyroids of patients with Graves disease, and in follicular adenomas. The intrathyroidal T4 to T3 conversion by this enzyme may contribute significantly to the relative increase in thyroidal T3 production in these patients. This protein is a selenoprotein containing the non-standard amino acid, selenocysteine (Sec), which is encoded by the UGA codon that normally signals translation termination. The 3' UTRs of selenoprotein mRNAs contain a conserved stem-loop structure, designated the Sec insertion sequence (SECIS) element, that is necessary for the recognition of UGA as a Sec codon, rather than as a stop signal. Unlike the other two members (DIO1 and DIO3) of this enzyme family, the mRNA for this gene contains an additional in-frame UGA codon that has been reported (in human) to function either as a Sec or a stop codon, which can result in two isoforms with one or two Sec residues; however, only the upstream Sec (conserved with the single Sec residue found at the active site in DIO1 and DIO3) was shown to be essential for enzyme activity (PMID:10403186). Alternatively spliced transcript variants have been described for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2018]
Forensic Context
A study in pigs demonstrated that cold exposure significantly induced the expression of the DIO2 in the biceps femoris and longissimus dorsi muscle of both cold-tolerant Tibetan and cold-sensitive Bama breeds [Yang et al. DOI:10.3390/ijms24087431].