Basic Information

Symbol
DIRAS2
RNA class
mRNA
Alias
DIRAS Family GTPase 2 Distinct Subgroup Of The Ras Family Member 2 Di-Ras2 DIRAS Family, GTP-Binding RAS-Like 2 GTP-Binding Protein Di-Ras2 DKFZp761C07121 EC 3.6.5.-
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses Other applications

MANE select

Transcript ID
NM_017594.5
Sequence length
4105.0 nt
GC content
0.4470

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1270.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1345.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1317.37
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((..(((((...........))))).)))(((((.......)))))(((((...((((((.(((((((((((.((((((((((.((((((....))))))(((((...)).))).(((((((((........(((.(((((....((((((((((.(((((((((.....((((((((((((.((..((((.....))))..))((((........))))..((((((.......))))))....((((((.((((((.((........))))))..)).))))))))))))..))))))((((((......(((((((((((((((((....((((((.(((((((((.(((((.((((((........))))))((..((.....))..)).((((.......((((((......(((.(.........).))))))))))))).(((((((((...)))))))))....(((((.((((.(((((.(((.((..((.....))..)).))))).)))))))...)))))))))).)))))))))..))))))...)))))((((((...(((...)))...))))))...(((((((((((....(((((((..(((......)))..)))))))...((.((((....((((((((((.(((..(((..((((((((.....(((...(((((....)))))...)))(((((....))))).....((((.((((.((((((((((.((.(((((.......((((..........)))).((((((.((((((....)))))).))).)))........((((((((.(.((..(((.(((((((((.((...)).))....((((...((.(((((..((((.((.(((((.((...(((((((((........))))..(((.(((((..(((...))).)))))..))).((((....))))..((((........))))...(((((((((.((((((.(((((((........((((((((..(((.(((.....))).)))..))))))))......((((((((.....))))...))))...((((((..(((.(.......).)))))))))..((((((((((.(((.....(((.....))).....)))(((((((((((....)))))))))))....((((((((......))))))))....))))))))))....))))).))))))))..))))))))).)))))(((((((....((((((((((((((((((((.((((((.(((((......))))))))....(((((((....)))))))..............(((((((((((((((((...))))))))...((((((..(..((((((.((...)).))))))..)..))))))...................))))))))))))..)))))))(((((((.((....)).)))))))..........(((.(((((((...))))))).))))))))))............((.(((.((((...(((....)))..)))).))).))....))))))......))))))).......))))))))))))).))))).)).(((......)))(((((((.((((((..(((.((.(((.(((((......))))).))).)).))).................((((..(((((......)))))..))))))).))))))))))......)))).((((((((((((...(((((.(((((......................))))).)))))....)))))).))))))..(((((.....))))).(((......)))..............))))))).)))..)).))))))))).....................(((((...((((...))))...))))))))))..)))).))).))))).)))).))))))))))))..)))((((.(((((...((((((.....(((((((....)))))))..))))))....))))).........)))).(((((((...))))))).))).))))))))))((((((((((........)))...)))))))........)))).))))))))..)))))((((((.((((((((((....(((.......))).......))))))).))).))))))..))))))))))))...))))))..))))))))).((((((((....((((((((((...((...((((((...((((..(((((((...((((((.........))))))...)))))))..)))).)))))).))..)))))))...)))......)))))))).......((.(((.(((((((.((((..((((((((.(((((.(((.((((.(.((((((....(((.............)))...)))))).).)))).))).))))).)).((..((((.(((........)).).))))..)).......((.(((((......)))))))....(((((((((..(((......))).....)))))))))))))))..)))).))))))).))).))))))))))))))))))))....(((((((((((((((((......))))).....(((((...)))))........((((....((((((((.(((((((((((((..(((.((((((((((((((((((.(((((.(((((.((((......)))).))))).)).........)))))))).))))))).....)))))).))).....((((((((((....(((.((((((((((..(((((.((((((((....))).))))).))))).....(((.((....(((((....((((....(((((((((......................))).((((.((.((((((((....((((((.......(((((....((((.((((((.((((.......))))....))))))))))))))).......)))))))))))))))).))))..))))))....)))).)))))...)).))))))))))))))))....))))).)))))((........))(((((((..((.((.((((.....)))).)).)).)))))))....((((((.......)))))).)))))))))))))))))))))))))..))))))))))))(((((((((((..((((....))))((((........)))).....((((..(((((((.(((((....((....))....))))))))))))))))....(((((((((((..((((.(((.(((((((((((((.....(((((((((((...(.(((.((((.......))))..(((((((.(((................))))))))))....((((...((.....)).))))((.(((((...)))))))....))).)...)))))))))))((((.....))))......................)))))).)))))))))).))))((((((((...(((((((((.(((((..((((.((..((((((..........)))).)).)).))))..))))).))..........)))))))...))))))))...........)))))))))))))))))))))).................((((((((........((((((((((((((((((.(((((((((.......))).((((((.....((((((...........(((..........)))))))))..)))))).......)))))).)))))...))))......)))))))))...(((((.((((((((.......)))))))).))))))))))))).....................)))))))))(((.((....)).)))((((....)))).........))))).)))))))))).......))))))...))))))...))).))..............
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((.,{((((.,.........))))).)})((((({....,.})))){{(((...((((((.(((((((((((.((((((((((.((((((....))))))({((,...})},)).(((((((({........({(,(((((....,(((((((({,(({{{{{{,...{(((((((((((((.((..((((.....))))..))((((........)))),.((((((.......))))))....((((((.((((((.((........))))))..)).))))))))))))..))))))))|,||}}||}}|||||||{|{{{(((((....((((((.(((((((((.((({,.((((((........)))))){(..{{{,,,|)),,)).(({{..,|,,.((({((......{({.{.,,,,....},)}})))))})})).(((((((({...))))))))).,..(((((.{(((.(((((.(((.{{.,{(,,...)),.)).))))).))))))}...)))))})))).)))))))))..))))))...)))))((((((...(((...)))...)))))},{{(((((((({{{....(((((((..(((......)))..)))))))...{{,((((,,,.(((((((((({(({{,{((..,((({{{{{,,.{((((((({,{{...,..{{{.,((({(((((((.(((,((((.{(((((.((((.(((((((({{.||,(((({...((((({.....,,|,|{{(((((((((((.((((((....)))))).)))},(({{{{.....}|}}||{{({{.,{(....}}}.}))))||{{{{(.(((((..((((((((({((,,,{(((,..,,,|}||,.({{(,,{||||||}..|||,...,,..,,|.(((((..{{{,,,))).}}))).}))).,,}}..,)))))..))))).).}))}}.,,,..(((((((((.((((((.(((((((......,.((((((((..(((.(((.....))).)))..))))))))....({(,({((((.....)))),.,)),}...((((((,.{((.,.......,.))))))))),.((((((((((.{((((((((((((.((((((.(((((((...}))))))...))))))..)))),),))))))}........,,........,.)))))))))),...))))).))))))))..)))))))))(((((....)).))).})))))))))|,|((((({{{{{{{(((.(((({......}))))|||,,..{{{,{,,{{,.||||,|{{{{{{{{{{.....,,,|||||}|||||,||},.))))))}}|,|((((((,.{..((((((.({...}).))))))..}..))))))......,{{,,.,,.....}}}}.,|}|(((({..,.(((((((({,..(((({.{{...,||||((....,..,,{.||||||,...))))))}.}))))))).)))....})))),||.{{{.{(((.,.{{{....}}),.)))}.}}},}}..,}))}}|,,.|||,,,,,,.........,..{(({{{((.,..)))),,})|||,},...))},,.,|||,,,,{{|,|||||||,|,,.,,{{{.|}}},}}},}.}}}.,,,||{,{{,,...}}}......{(((..(((((......)))))..))))..}||||||{{{{{{..,,.{{{{{(((((,{(({((,,.(((((.(((((....,,,.....,..,,,....))))).)))))....)))))).}}}}},||||{{|,}}}})))),..}}}.}},})))}}},..,,,..........,,.)}}..,)))})}}},,............|,........{((((...((((...)))).,.))))))))))..}})).)))}})))).)))).))}}})).)))).)))|||||}|,|||,,,{{(({{.....(((((((....))))))).,)))))}.,}}))))).,}},...}))},,|{{{{{,|}|})))},}.,,},}}}}}{(({.((((((((((........)))...))))))).}))}....,,,|||}||||||.}}||}{(((((.(({(((((((,,..{{,.|,,,.,}|||....,,))))))).))).)))))),}))}},}})))))}}))))))},.))))))}}),||||||||,,..{{{(((((((...((...((((((...((((..(((((((...((((((.........))))))...)))))))..)))).)))))).))..))))))),,..}}.}})}}))))}}}}.......{{.|||,|||||,,.||||}}|||{{,({.(((((.(((.((((.(.((((((,...(((.............}}}...)))))).}.)))).))).))))).}}.,...,{|,.|||}}}}.}}}...|{||||{{||{,.....,(.(((((......)))))})..,,(((({{,,{||{{|||,,||}|||{{{|{||,|{|||||}}}},{||||{}|||}}}.,,,.||||||,,,,,,)))))))),,,,|{{{{|||{{((((((,,,,|..}},,,.....(((((...)))))..,{{{,.(((({{{{((((((((,((({,{((((({{,.,(({{{{{{|{{{{{{|{|{{{.,,,,,.(((((.((((......)))).))))).}}.,,,|,....,,))))).|}|||||...,||,,||||,,,,,,,.||||{{{{||,...{{{,|||||{{{{,..(((((.((((((((....))).))))).)))))..|||,||,|,..,,,||,.....||||}},,|{|||||||,,.}}}}|,...}},,.,,}},}}}.((((,({.{(({{{{(....{,,||,...,}},|{{{|}}}}{{{{.||||,,.,|||}},,.||||||,,..|})))}))}||||||,{,.,,,,||||||||||}},},.)))),,}},},,....))}|,|||.....,,,))))}})))))))))}....})))},}))))|||,,....,}|{{{{{{{.,{{,((,{{((.....}})).)},}}.}}}}}}}.,|,{{{{||,,,,,..}}},,,.})))))))))))}}}}}}})}|||},.}}))))))}}}}(((((((((((..,,({..,,||||(((,,{,,{{{{|||{..,,.((({..(((((((.(((((....{{....}},,..)))))))))))))))).,,.((((((({(({,.((((.((,,(((((((((((((,,,,.|{{{{{((({{....,((({{{,(|{{|...|||}..(((((({,(((................))))))))))..,,|{{|,,,|{.....)),))}}((.(((({...}))))))..,.}},.....}|||||||}}}.,))}},,,..................,{{{{...,,)))),))))))}))).}))|{{{{{{{{...{{{{{{{{{.(((({.,((((.,,.,({((((..,.......)))).)}.},.))))..))))).))..,,,...,,}}}}}})..,))}))))))}..,}}}.,})))))))))}}))))))))))).,,,,,,},}}}},,..,,.{{,,{,{{{{|,,{{{{||||,|{|||,||||{,,,,|||,.,.,,..|||||||{|{{{{{{{,{(({...{{{{{{{{(({..........}},,,}))}..})))))...,,}|)|})))|}}}}),}.}}}},,}}}},})}}}}}}|,.(((((.((((((((,......)))))))).))))).,,..,|,.......,,...,........}))))))))(((.{{....}}.}))((((....)))).........))))).)))))))))).......))))))...))))))...))).}},.............

Transcripts

ID Sequence Length GC content
ACACCCUGCGCUGCCCUGUCCUGCGCGAGUGGAGCUCUGAAGAAGCUCU… 4105 nt 0.4470
Summary

DIRAS2 belongs to a distinct branch of the functionally diverse Ras (see HRAS; MIM 190020) superfamily of monomeric GTPases.[supplied by OMIM, Apr 2004]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the DIRAS2 was identified as a member of the upper quartile gene coexpression modules significantly associated with lifetime alcohol consumption in postmortem prefrontal cortex, with prior validation in independent studies for alcohol consumption [Farris et al. DOI:10.1038/Mp.2014.159]. A study in mice demonstrated that dietary methylmercury exposure significantly altered hippocampal protein and RNA expression, with the GTP-binding protein Di-Ras2 (DIRA2) being downregulated at both the protein and RNA levels in the high-dose exposure group [Mellingen et al. DOI:10.1093/Mtomcs/Mfab022].