Basic Information

Symbol
DISP1
RNA class
mRNA
Alias
Dispatched RND Transporter Family Member 1 DISPA Protein Dispatched Homolog 1 DKFZP434I0428 MGC13130 MGC16796 Dispatched Homolog 1 (Drosophila) Dispatched A HPE10
Location (GRCh38)
1:222814730-223006258
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001377229.1
Sequence length
4796.0 nt
GC content
0.4733

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1494.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1579.82 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1139.30
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001350630.2 NCBI
AGCCCGGCUCCGGGCCAGCAUCCGAGAGCCCGGACUGGAGGUGAGUUCG… 4991 nt 0.4745
NM_001369594.1 NCBI
AUUCAGUCUGUCCUGCCGCUCUGUGGAGCUGCGCCUGCCAACUCAUUGC… 4762 nt 0.4708
NM_001377228.1 NCBI
GAGUUCGCAGCCGGAACGUUGCAGGCACUUGUUUCCUCAGUGGAUGCCU… 4706 nt 0.4743
NM_001377229.1 NCBI
AGCCCGGCUCCGGGCCAGCAUCCGAGAGCCCGGACUGGAGUCUGUCCUG… 4796 nt 0.4733
NM_032890.5 NCBI
AGCCCGGCUCCGGGCCAGCAUCCGAGAGCCCGGACUGGAGGUGAGUUCG… 4974 nt 0.4797
Summary

The pattern of cellular proliferation and differentiation that leads to normal development of embryonic structures often depends upon the localized production of secreted protein signals. Cells surrounding the source of a particular signal respond in a graded manner according to the effective concentration of the signal, and this response produces the pattern of cell types constituting the mature structure. A novel segment-polarity gene known as dispatched has been identified in Drosophila and its protein product is required for normal Hedgehog (Hh) signaling. This gene is one of two human homologs of Drosophila dispatched and, based on sequence identity to its mouse counterpart, the encoded protein may play an essential role in Hh patterning activities in the early embryo. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

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