Basic Information

Symbol
DKK2
RNA class
mRNA
Alias
Dickkopf Wnt Signaling Pathway Inhibitor 2 Dickkopf-Related Protein 2 Dickkopf-2 HDkk-2 Dickkopf (Xenopus Laevis) Homolog 2 Dickkopf 2 Homolog (Xenopus Laevis) Dickkopf 2 Homolog Dickkopf Homolog 2 DKK-2 Dkk-2
Location (GRCh38)
4:106921802-107283806
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014421.3
Sequence length
3654.0 nt
GC content
0.4201

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1030.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1105.40 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1024.67
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((.((((((((((((((((((((.((.(((((((((.(.(.((........))).)))))))))).)).))).(((.((((((.(((((.(((((((((((..(((((....(((..((.(((((((..(((((((.((((((.(((....)))..)))))).....(((.((((....)))).))))))))))....))))..))).)).)))....)))))....)))))).......))))).))))).))))))))).....((((((....(((((((..((((.(((((.(((.((.((((((((((((((...........))))).......((((((......))))))(.(((((((((((.((((((((((((..(((.....(((.....)))....)))..))))))))).))).......))))))))))))........))).))))))((((((....)))))).((((((.((((((..((((((((((.((((((.(((....))).))))))....((((((((((((.((((((.((..((((..((((.(((((((((..((((......))))..))))(((((.((((((.((((((((.......))).)))))(((......))).((((((...(((((((((((......(((..((((((((((.((((((.((.....)).))))))((((....))))))))))))))..)))...((((((((((((((((((((((.(((((((((((.(((((.(..((((.(((((((...(((.((((.((..((((..((((.....((((.....))))..))))..)...)))..)))))).)))))))))).)))).).))))).....)))))))..)))))))))...(((.......))))))))))))..........))))).)))..)))))))))))..))))))....(((...((((.......))))....))).)))).))))))).............((((((((((......))))).)))))..))))).))))((((..(((..(....)..)))..))))...))))..)))))).)).)))))(((((.......)))))......)).)))))(((((......)))))......((..(((.....)))..))(((((.(((((((((((...(((......)))...........((((((....(((((((.(((...(........)...))).....)))))))...))))))))).))))))))......))))).........))))))))))))))))))))))(((.((...((((((.(((((((.....(((((((...))))))).((((......))))))))))).))))))...)).)))......))..))).))))).)...((.(((((.....((((.(((((((((((((((.(.....(((.((((.....((((...((((((((((.(((.....((((......))))..(((((((((..(((((((.((((..((((.((.............(((((.............)))))..(((((((((..........((((((((((((((.....((((.(((..(((....((..(((((((((((((.((...(((((((.....((((((((((((....))).....))).))))))...)).)))))..)).)))))))).))))).))....)))))).))))......))))))((((((.(((((((((....)))))))))...((.....))............((((...(((...((((((..(((((((..((.(((((((....((((((((((...((((...))))...)))))).......................(((....)))))))..))))))).))..)))..........(((((((((.(.(((((.......).))))))))))))))(((((.....))))).........((((.(((((.(((....)))..))))).))))..))))..)))))))))...))))......................))))))......................))))))))...((((.(((....((((((((.....(((.......)))...)))).))))....))).))))....))))))))).......)).)))))))))))))))......)))))))))................((((...((((...))))..))))..))).)).))))))))...))))...........)))))))((((((((((((((....((((((.(((((((....)))))))...).)))))...........((((((((((....((((((((((...(((((....))))).((((((....))))))(((.(((.(((((.(((.(((((..((((((((((.((....(((((.((((((((...(((((..(((((((((((.(((((.....)))))(((((....(((((((((((.(((((((.......))))))).))))))....(((((((((((((((.....................))))))))))..)))))...(((((....((.((.(((((((..................))))))).)).))))))).......((.((((((((((..((((.....)))))))))))))).)).(((((((((((((((((..(........(((((...((((((((..(((((..(.......................((((...))))..)..)))))...))))))))..))))).(((((.....)))))........(((((((......)))))))......(((...))).......((((.((....)).))))....)..)))))))...)))))))))).....)))))..)))))...........))))).))))).)..))))).)))))))).)))))...)).)).)))...))))))))))...)))))))))))...))).....))))))..)))).....(((((.(((((((((((..((((......))))))))))))))).)))))..))))))))))........))))))))))))))......).))))))).......)))))))))))))))))))............((((((((.((.(......).))...))))))))..))).)))))))......(((((((((((.........)))))).)))))...))))))((((((......)))))).........))))))))).((((((((((((...............((((((((......))))))))..(((((((....((((((((((((((((((.((((((((...(((((...))))).)))))))).))))))))))).....))))))))))))))..)))))))))))).(((((.(((...))))))))..))))))))))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((((.(((((((((((({,(({{{{,((.(((({{(({...|,{|},,,,,..}||,|||||||}}}.))})))}}.{|,(((((((((.....))))))))}.,|{{||,,|||{{|||{.(({((((..((((((({((((((.(((....)))..)))))).....{{{.((((....)))).))))))))))....)))),||||.{((({{...{|{|}}...,||||}}.}}}})}|,||||||,,..((({.(({...{.((((((((....(((,((..,,{{,.,(,({((,(((.{(((((((((((((...........))))).......((((((......)))))),.{((((((((((,((((((((((((..(((..,,,(((....,)}}.,.,)))..))))))))).))},,...,.))))))))))||.......,))).)))))}.}.}}.))))).,}}..(((((,,((((({..((((((((((.((((({.(((....))).|))))).,,{((((((((((((.((((((.((..((({..((((.(((((((((..((((......))))..))))(((({.{{((((.((({{{({,,.,...|||.|||||(((.....}))},((((((...(((((((((((..({(,...})).....(((({{(((((.((.....)).)))))))))).((((|....}))))(((,,(({....}))))))(((((((((((((,{(((({((((({.(((((.(..((((.(((((((,..{((.(({({((..((({..((((.....((((.....))))..))))..}...)))..)))))).)))))))))).)))).).))))).....,))))},,.)))))))))...(((.......)))))))))))){{{{....)}))..}.}....)))))))))))..))))))....(({,..{{{(,,.....))})....))).)))).}}))))).............((((((((((......))))).)))))..))))).))))((({..,,...|}}..|,{||,..)}),,,,))))..)))))),,).)))))(((((,{,.,,.)}})},....,)).))))))||{{...,,.,||||{,..........})))}}|||,.}}{((((.(((((((((((..,{,,.....,|||,..........(((({{..,{{{({{{{|{,{...{{,{{....},.}).,,,}.,)))}))).,})))})}))).))))))))......)))))...,}},..))))))))))))))))))))))(((.((...((((((.(((((((.....(((((({...})))))).{(((,....})))}))))))).))))))...)).)))..,,.)))...)}.))))))}...{||{{{{|,..,,||||,|{(({{{((((((((.,...,.((,,((((...,,((((...((((((((((.(((.....((((......)))}{{(((((((((..(((((((.((((..((((.((.............(((((.............)))))..{((((((((.........,,{,{((((((({.,,{,,{((((,{({.{(((,,{,({..(((((((((((((.((...(((((((.....((((((({,{{(,,,,}}}..,,,)),,))))))...)),}))))..)).))))))))}})))).}},,|.|||||}{{{{{,...}})))}{{((((((.(((((((({....}))))))))...((.....))........))))))}}}}}|}|,...,||||}}}}..,,|,|||{{{{,{{,....|{{{(((({{.,{((((,..,}))},,)))))}.........|||.,...,,,,..{{{....}}}}}}),,})))|||.{{,{{,,,{,|,.....{|||||{||||,|||{,,.....}},))))})}}|}||}|{|||||,|,,,,,|{,,,,{|,,,|,,.....((((((((((((((.......,,},})))))))).))))|{{..,,.|,...................,..}..)))......,,}}}}}}}}}.....,||||||},..|||,,}|},...,((((((,.............)))))}..}}}}||||}...))}),}}}},...)))))))))....,..)).)))))))))))))))......)))))))))..,,...........,((((...((((...))))..)))),.))).))}})))))))...)))}.....,,....))))))){(((((((((((((..,.((((({.(((((({....}))))))...}.)))))}.......,..{(((((((((...{{{{{{{,,.....{((({....}}})},{{{(((((({{{((({,(,.,,,.,|,,|}|||}|||||..|{||{{(({({(({{{,(((((,{{{{{|||.,,||{||.,|(((({(({,,,{{(((,,...}}}}}{{(((,,..{{{{{((((((.((((((({....}}))))))).))))))....(((((((((((((((.....................)))))))))),.,)))),,.(((((....((.{{.(((((((....{{{........,,.))))))),||,||}}}}}.....||||.((((((((((..{({,.....}))})))))))))),||.{((((((((((((((({..{........{{{{{...((((((((..(((((..........,...............((((...)))).....)))))...))))))))..})}|}.{{({({...,|||||,,......(((((((......))))))).,,}),}}}..,})),....,.{{({.{{....)},}}}}.......})))))}...)))))))))}.,,..}}}}}..}}})),,.,,......,)))}})}})).}|,}}},,.}}||||||,||},,...,.}))}))),..,,}}}))),}.,,}},,,}}},}}}},)))}}}}},}}))).....,,.,,,{((((.(((((((((((..((((......))))))))))))))).))))}..)))))))))}........))))))))))))))......}.))))))),......}))}}))}))))))))))),...........{{{{{{{{.,|,|,,,,..}.||,..}}}|||||....|,||})}}).,})))||||{((((((.........))))))}.}}},,|{||||||({((({......})))},,,,{{{.,{|||},||||,({{{{{{((({{.......,{{...,,((((((((......)))))))}..}|},|||,{{|({{,{((((({{{{{{({,|{{{{{{{,,.|{|||...}))}}.)))))))).))))}))))))}}}}.,))))),.))))}}..))))))}})))).((((,{(((...))))))))..})))))))))))..........

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_014421.3 NCBI
AGCAGAGAGAGAGAAAGCGGGAGCCCGCGGCGAGCGUAGCGCAAGUCCG… 3654 nt 0.4201
Summary

This gene encodes a protein that is a member of the dickkopf family. The secreted protein contains two cysteine rich regions and is involved in embryonic development through its interactions with the Wnt signaling pathway. It can act as either an agonist or antagonist of Wnt/beta-catenin signaling, depending on the cellular context and the presence of the co-factor kremen 2. Activity of this protein is also modulated by binding to the Wnt co-receptor LDL-receptor related protein 6 (LRP6). [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human ex vivo skin explants demonstrated that the mRNA for DKK2 (Dickkopf-related protein 2) was significantly upregulated in burned tissue at 24 hours post-burn, identifying it as an early burn response gene [Foessl et al. DOI:10.3390/ijms22179209].