Basic Information

Symbol
DLC1
RNA class
mRNA
Alias
DLC1 Rho GTPase Activating Protein ARHGAP7 STARD12 P122-RhoGAP DLC-1 HP StAR-Related Lipid Transfer (START) Domain Containing 12 Rho-Type GTPase-Activating Protein 7 START Domain-Containing Protein 12 Deleted In Liver Cancer 1 Protein Rho GTPase-Activating Protein 7 Epididymis Secretory Sperm Binding Protein StAR-Related Lipid Transfer Protein 12 Rho-GTPase-Activating Protein 7 Deleted In Liver Cancer 1 HP Protein KIAA1723 StARD12
Location (GRCh38)
8:13083361-13604610
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_182643.3
Sequence length
7412.0 nt
GC content
0.4563

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2207.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2347.20 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1682.33
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001164271.2 NCBI
ACUGACUUCGUGCCCUCCAUGUUCCUUGACAGCCUGGGCCUCUCCUACU… 5788 nt 0.4610
NM_001316668.2 NCBI
GCCAGCCGCAAUGCCGGCCUCCUGAAGGCAGGCGACAGCCUGCGGCCGG… 5949 nt 0.4703
NM_001348081.2 NCBI
GCUCACUCAUGAUUAUCAGACAACACAUUGGCAGUGAGUUCAUCUGCUC… 7246 nt 0.4550
NM_001348082.2 NCBI
GCUCACUCAUGAUUAUCAGACAACACAUUGGCAGUGAGUUCAUCUGCUC… 7164 nt 0.4552
NM_001348083.1 NCBI
GCGUUUCCCUUUGAAAACGCGAGGUCACCUGGACUGCCCCUGAAGGGAA… 5777 nt 0.4632
NM_001348084.2 NCBI
AGUUCGCUCCGACUGCCCGAGCGAGGGCGCUUCGCUCCCAGCCAGGACA… 5953 nt 0.4730
NM_001413124.1 NCBI
AGUUCACAAAAUUUGUGACGGACGAAGGAUGCAGAUACCAUGAGCGGCU… 7355 nt 0.4552
NM_001413125.1 NCBI
AGUUCACAAAAUUUGUGACGGACGAAGGAUGCAGAUACCAUGAGCGGCU… 5891 nt 0.4021
NM_001413126.1 NCBI
GAAGGGAAGACCUGCUAUGUGACCCAGGAGCAGCCCGGCGCGGACCCAG… 5826 nt 0.4657
NM_001413127.1 NCBI
GAAGGGAAGACCUGCUAUGUGACCCAGGAGCAGCCCGGCGCGGACCCAG… 5904 nt 0.4660
Showing 1 to 10 of 25 entries
Summary

This gene encodes a GTPase-activating protein (GAP) that is a member of the rhoGAP family of proteins which play a role in the regulation of small GTP-binding proteins. GAP family proteins participate in signaling pathways that regulate cell processes involved in cytoskeletal changes. This gene functions as a tumor suppressor gene in a number of common cancers, including prostate, lung, colorectal, and breast cancers. Multiple transcript variants due to alternative promoters and alternative splicing have been found for this gene.[provided by RefSeq, Apr 2010]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the DLC1 is a marker for electrophysiologically associated cardiomyocytes, as it is highly expressed in the ventricular cardiomyocyte cluster vCM5 identified via single-cell RNA sequencing following myocardial infarction [Bian et al. DOI:10.3892/mmr.2025.13680].