Basic Information

Symbol
DLG2
RNA class
mRNA
Alias
Discs Large MAGUK Scaffold Protein 2 Chapsyn-110 PPP1R58 PSD-93 PSD93 Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 58 Channel-Associated Protein Of Synapse-110 Postsynaptic Density Protein PSD-93 Disks Large Homolog 2 Discs, Large Homolog 2, Chapsyn-110 (Drosophila) Channel-Associated Protein Of Synapses, 110kDa Discs, Large Homolog 2 (Drosophila) Discs, Large Homolog 2, Chapsyn-110 Discs Large Homolog 2
Location (GRCh38)
11:83455012-85628335
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001142699.3
Sequence length
7959.0 nt
GC content
0.4340

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2278.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2436.68 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2118.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001142699.3 NCBI
AAUCCUCUCGGUUAAUACAUGGGAGGAUCAGAAUCAGAGGGGCAUUAAG… 7959 nt 0.4340
NM_001142700.2 NCBI
AGUUUGAGUGUUACCAGCUUUCGCUAUGCAACGGCCAAGUGUUUCUCGG… 7081 nt 0.4307
NM_001142702.2 NCBI
GUCAGAGUCUUAGUUAUAAAGGCAAGUGUGAACCGGACAGCAGACAGGA… 5986 nt 0.4257
NM_001206769.2 NCBI
AGAUAAUGCUGUGCGGAGCUGCUGUCGCUGCUCCCACUGCUCCCACGAU… 7728 nt 0.4411
NM_001300983.1 NCBI
AAUCCAGUGAUUUAAAAUGCUAGAAGGAAAAGCAACUGAGGUCUUAACU… 7668 nt 0.4322
NM_001351274.2 NCBI
AUUUCCUUCCCUGACUAUUUAUCAGCUUAGCUCCCUGAUCUCUUCGCGU… 8537 nt 0.4413
NM_001351275.2 NCBI
AUUUCCUUCCCUGACUAUUUAUCAGCUUAGCUCCCUGAUCUCUUCGCGU… 9469 nt 0.4370
NM_001351276.2 NCBI
ACUUGCCCGGCCAGCGCUCCCCACAGUGACUCUGGAUUGCAGCAAGCCA… 7967 nt 0.4408
NM_001364.3 NCBI
AAUCCAGUGAUUUAAAAUGCUAGAAGGAAAAGCAACUGAGGUCUUAACU… 7737 nt 0.4307
NM_001377966.1 NCBI
AGAUAAUGCUGUGCGGAGCUGCUGUCGCUGCUCCCACUGCUCCCACGAU… 7710 nt 0.4411
Showing 1 to 10 of 25 entries
Summary

This gene encodes a member of the membrane-associated guanylate kinase (MAGUK) family. The encoded protein forms a heterodimer with a related family member that may interact at postsynaptic sites to form a multimeric scaffold for the clustering of receptors, ion channels, and associated signaling proteins. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. Additional transcript variants have been described, but their full-length nature is not known. [provided by RefSeq, Dec 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the DLG2 was part of a common cosplicing network of glutamatergic synapse genes in brain reward circuitry, identified through RNA-Seq analysis of selectively bred lines with differential risk for methamphetamine intake [Hitzemann et al. DOI:10.3390/brainsci9070155].