Basic Information

Symbol
DLG2
RNA class
mRNA
Alias
Discs Large MAGUK Scaffold Protein 2 Chapsyn-110 PPP1R58 PSD-93 PSD93 Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 58 Channel-Associated Protein Of Synapse-110 Postsynaptic Density Protein PSD-93 Disks Large Homolog 2 Discs, Large Homolog 2, Chapsyn-110 (Drosophila) Channel-Associated Protein Of Synapses, 110kDa Discs, Large Homolog 2 (Drosophila) Discs, Large Homolog 2, Chapsyn-110 Discs Large Homolog 2
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses

MANE select

Transcript ID
NM_001142699.3
Sequence length
7959.0 nt
GC content
0.4340

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2278.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2436.68 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2118.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((((......((((((((((((((((..((((((.....((((.((((((....))))))(((((.((((((((....((((((((((.(((..((((((((((((((((.((....))..))))))).....((((((...........))))))(((..((....)).))).((((...))))..))))))))).....((((.(((((.((((..((((..((((((.....((((.(((......)))....)))))))))).......(((((.((((((((((..(......)..)))).))).))).........(((((((...((((.....((((((((((((((........)))))).....(((..(((((((((...(((((............)))))...)))))))))....((((.(((((..............))))).)))).((((((((.((((((....((((.(..(((.(...(((.((...(.((((((......)))))).))).))).).)))..).))))....))))))...)))))))).((((((.(((((...(((....((((((...(((((((.............((((((....((((((((.((((.(((((((((((.((........(((....))).......)).)))))((((((((((....))))((((....)))).)))))).......((((........)))).(((...)))(((((..(.(((....((((.(((.........)))..))))....)))...)..)))))...(((........)))............(((((....))))))))))))))).)))).))))..))))))(((.....)))....((((((((((((.............(((......)))((((((((((.........)))).))))))....((((...(((((((.((.(((((((......((((((((.(((((...)))))(((((.......))))).....(((((((..(((((.(((.((........)).))).))))).((((..((((..((((........((.(((((((.((.((((....((..((.((((((((.(((.(((((((.(((((((.(((((..((((((((..((((((.......))))))))))))))..)))))..((.(((.....))))).......)))))))...(((((.......(((((...(((((.(((....))))))))..((.((.((((((((((((....)).)))).)))))).)))))))))((((((((..........))))))))(((((......((...((((((..((((((.......((((((((((((..((((......((((.((((.......((.....))....)))).))))................))))..))))))))))))........)).)))).....))))))...)).....)))))....))))))))))))...))).)))))))).))..))((((....))))..........)))))).)))).))).)).........)))).)))))))))))))))...(((((((....)))..)))).((((....))))((((....)))).....(((((.((((.....((((((((....)))))))).....)).))...)))))....))))))))....))))))).)).)))))))......))))(((((((((((((((((((((((((..(((((((((((((((..(((((...........))))).........))))).........((((........))))..((((..(((......)))))))((..((((((.(((.((....)))))....))))))..)))))))))).........))..)))))).........((((((((....))).)))))..((((.((((....))))))))....)))))))))))...)))))))).((((.((((...((((...(((((((.(((((((((......))))).).)))))).)))).))))....))))))))........))))))))))))......(((........)))...))))))).)))))).....)))..((((..((.((((..(((.((.....)).)))..))))))))))..))))))))))))))..........))).)))))..(((.((((...)))))))...((..((((.(((((..(((((.....(((((((.(((((((.........((((((...))))))((((((((.......)))))))).(((((((.(((..(((((((.......((((((.(((((.(((((((((((((....)))).....((((((((.(((.((.((((((.......((..(((((.((((.(((((...((((....((((((((.((((((....)))))).)))........(((.((((((......)))))).)))........((((((.(...........).))))))..(((((.........)))))...((((.(.....).)))).(((((((((....((((......))))(((((((......((((.....))))))).))))((((.((.((((((.(((((((((.......))))..))))).....(((.((((((((((((((.((.(((((.......))))))).)).((((..((((((((.((((......))))))))))))..))))...........((((........)))).)))).)))))))))))..((((((.((((..((((((...((((.((.(((.(.(((((((.((((((((..((((((((.(((((((....(((.((((.....)))))))....))).....((((((........)))..)))............(((((((((((...((((....))))......)))))))))))...(((.((((..((((.(((..((((((((((..((.((.((.(((......))).)).))))...(((((.((((.........)))).)))))(((.(((((((((..............(((((((....)).)))))..((((((((((((....((.((((((((((......)))).(((((.....)))))..(((.(.((((.......)))).).)))...............................(((.(.(((((((((((((.((((((((((..(..((((((.....))))))..)....)))))..))))).)))).))).)))))).).))).....((((((((((..((((((..(((.........((((((.(.(((((((((.((((((.(((((((((......(((.((......))(((...((((.....))))...)))........(.((((((((((((((((..........(((((...))))).(((((((((((.(.((((((.(((((((((((...((((((((...((((..(((...(((((((........(((((.(((..((....((((...((((.............((((((..((((.............))))...))))))))))...))))....))..))).)))))...........)))))))......)))..))))..)).))))))..((((((..................))))))(((((((..((((......(((((((..((((((((........((((((((.(((((((.((.(((.........))).)).))))))))))).((((((.(((..(((((..((((..((((.((((((((........(((.((((((((....)))))))).))).....((((((....((((((..((....)).))))))..))))))....(..((((((.((((....(((......)))....))))..))))))..)....))))))))...))))..)))).....))))).))).))))))((((((.....))))))..))))........))))))))...)))))))....((((((((((((.(((......))).))))).(((.(((((....(((.(((((.((((((((..((((......))))..(((((..(((((........((((....)))).(((.((((((((....)))))))).))).........)))))...)))))((((..((((....))))))))(((((((((((((........)).....((.(((..........))))).......))))))))))).........((((((...)))))))))))))).))))).))).)))))))).((((......)))))))))))......))))..))))))).))))))))))))))))).)..)))).))).))))))).))))))))))))).).(((((...(((((((.(((.....))).))))))))))))..........))).......)))))))))..)))))).......))))))))).).)))))).)))..))).((((.((((((((..(((((.......)))))))))))))..))))..))).(((((....((((..........))))))))).(((((....))))).)))).......((((((((...((((.((((((((((((((((((((((.((((........))))....(((((((((((((..(((...((..((((((((((((((....((((((.....))))))..((((((.....))))))..((((.((((..((......))..)))).))))((..((..........))..)))).))))))))))))..))...)))....)).)))))))))))..)))))))))))))))))..((((((.((...................)).)))))).(((....))).)))))..........((((((((......))))).)))......(((...(((.......)))...))).)))).)))))))).....))))))...............))))))))....))))))))))))......)))))).))).))).((.((((((..(((((((((..((....((((......(((((((((((.........((.(((((....))))).))......((((((..((((.......((((((....((.....))..)))))).......))))..((...((((((((((...............)))))))))).....))))))))..((((((((((.((((..((....))....))))..)))))).))))....((((((........)))))).(((((......))))).........((((((((((((((((......)))..)))))))))))))..(((((((.((((((.(((((...(((....))).))))).)))))).)))))))(((((((.....)))))))((((((...(((.....)))...)).)))).....(..((((......))))..).))))))))))).......))))))...)))))))))....))))))))((((((.((((((.((((.......)))).))))))..))))))....(((((((....)))).)))(((.(((((((....((((((((.(((........(((((((((((..........((((((((((((((((((((......)))))))).....)).)))))..)))))...((((((((.........)))))))).........))))))).)))).)))))))))))....))))))))))....(((((...((((.((.((((.((......)))))))).))))...)))))......((((.(((((.....((((...........))))))))).)))))))))))))).))).)))).))))))).....(((((((.........))))))))))).))))))......))..))).)))))..))))))).).))).))..))))...))))....))..)))))))))))))))))).)))).....)))))))))..))))).....))))...))))).)))))))))..))......)))))).)).))))))))))).................)))))))))......))))).)))))).....)).))))).))).)))))))..))))))).)))))))...)))))..)))))))))..))))))....)))))))))))))))).))))))))).))))..)))))))).)))))..)))))))).)))))))))))))))..)).))))))).....)))))))((((((.(((.........(((((((((...((((((((..((((.......)))).((((((.....)))))).............((((((((((..(((((((...((((((............)))))).)))))))..))))))))))...(((((............)))))(((((((((.((((((.......)))))).)))).).))))))))))))...(((((....)))))((((((((......(((....)))((((....(((((((......(((((((((((((((..(((.((.(((((((.(((........)))....))))..))).)).)))........))))))..).))))))))......(((((..(((.((((((....)))))))))..).))))....................((.(((((.......))))).))))))).))..)))).((((((...(((.((((.((((((.(((.(((....((((.((((((((((.((((((((.(((((............))))).))..)))))).)))).......(((((((((...)))))))))..........)))))).))))))).)))))....)))).))(((((.((.((((.(.(((.....))))))))))))))).(((((....)))))................(((((((..(((((((((((...))))))))))))))))))..(((((((((((.((..((..((((........))))..)))).))))))...)))))....))))))))))).....((..((((((.........((((...(((((((((((....)))).)))))))))))))))))..)).))))))))...((((((.........))))))((((.(((.......)))...))))..)))))))))(((((.........))))).........((((..((((((((................))))))))..)))).((((........))))..(((.((((.(((((((....(((.((.....)))))...))))))).))))..)))....)))))))))......)))))).....((((((.((((((.(((((((.(((((((((..((....)).)))).........(((((..((((.........))))..)))))...)))))..))))))).))))))))))))..................((((....))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,{({{((((((....}}.|||||||||((({.,.,(((((({{,.,(((({(,((({.{{{||||||(,{,({(((((((,...,{(((,,(((({{{({{((((,((,...(({...,,((((({{{{{,{{|({{.{{..((((....}}}}..,,{{{{,((({{((..{{{..{{{{(,{({{{{{||{{|||||,}},|}}}.,...}|||.,,,,...,{{{...,,{{||,...{((((.{((......)))....)))))))))}||,|.}||||((((({..{((..{{(.{{,{.,..,,}}.,,,.{(({{{{,...,,..........,{{...,,,{,(((((((((((,,,.....}}}}|,....,,,{..(((((((((...,,((({((({.....})))),}}}}))))))))),,,{|{{|.{{{({.....,,...,,,,))),,....{{(((((((({((,((({{{{(({,.,.,(((,....((({(,.{{(((((((({.....,||,|{{{{{.{{{,|{{||.{|.,|||....,,,|||{..||,,,,.....||,,}|||,,...,}},..,||||||}}}}}.))))),..........{((((((.(((((....,,.{{{{{{(((.......}}},.......(((....)))..,....|,.,,|,}||||(({{(({((({(((((.(({..(({{{{{{{||,,|..,)}||,.....{{.|{{{{({{{||,,.,,.,||.,,,,{(((,,{((,{{{..{{{{|||.||..|{(((((,{..{,.{{{,..|,.((({{..{{{,...,,,,,....{({..{{(((...,}}}}},}}},,,,|.......,}}}}..})))){(({{{{{,{{|{{{((({,,{((((..,,..{{|{.,..(((......}}}..,||||.,}}.)))},.,,||,,.,.,,|||||,,,,,,,||,{{,{,|{}|{{{{{{.,.,|||((({{{{.{((((...))))}(((((.......))))).{{{(((((,(({{(((((.(((.((........)).))).))))).((((({(..,..({(({(((({..((((((((((..{.,.,.}}},,({{(({{{{{{((({{({.(((((((.(((((((,(({((..,||{|||||}||||||,.{{{.{|}}|||}|||||||{{||,||{{(({(,,.{,,,|.,{{{{.{{{{|||||}}.,,((({{..{{..,(((,....((((({(({....))))))))},||.{(.((((((((((((....)),,))).)))))).)},,..|,,((((((((..........)))))))),{|||.,,.}}||...{(((((..,(((((.(,,.{,(({(((({((((..({{({{{{...,,..}}}}}.....,|},.......{{{{{,,{{{{}..,{{{{,.....,.{||,}{,||||||||||,|{,,{{|,{{,...)).,}}.,},)))}.,})})},.})))),))}),},,,))))))}}}),,})))),}}}{||,....}))}...,,}))}}}))})),)))}}..{{{{{..,.{,.........,}}..,))))).)))))))))))|||||||..,,,,,..))),.,,||}}}})),,||||,..})))},..,,|{{||.|||(,....((((((((....)))))))).....,}.}}...|||||....},,)))))...,))))}}}|||,||}|}||......}})}{|||,||||||{{{,{{|||{|||,..,||||{{||||||,,..||}}}}}}}}.||.,},,))}})}......)))))}}.......||||..}}}}}})),},,{{{{.,(((.....,)))))},{|},{{((((.((,{((....)))))....)))))),,)}))))))))}}}}....,},},})))))..}}.}.}}|||||,||....)))))))))}}},}}|,|||}}}}),,))),..},}))))))),)))}}.||||||||{,((({.,,....,{,({{.((((.,({,,,,(((((......))))){{{||,,,,})))),,|||{{{{||{{,{(|{{{{{.{{,||,|||,}},}......,||....|{{{,|{...{{{{|||.,||||,....{|||..((((,.{(.((((..(((.{(.....)).)))..)))))))))).}))),,,,|||.............})),.))))...|||.)|||..||})}|.....||..((((.(((((..(((((..,..(((((((.(((((((.........((((((...))))))((((((((.......)))))))).(((((((.(((..((((({{.......((((((.(((((.(((((((((((((....}}},,{...((((((((.(((.((.(,((((.,,...{{..{(((((..(((((((((..,,{,,....{{,.{(((.((((((....)))))).))}.}..},.,,}}.....))))))))),)))))))}....||||..||||...||||.,{||{{.((((((((,(((({,..{{,{.|||||,,.((((,,.....,.}}}).}}}|{((({....((((......)))))))}},.......{{((.,...))})....,}}}||{{.({.((((((.(((((((((.......))))..))))).....((,{(((((((((((({{.((.(((((.......))))))).,}.({{{..{({{(({{(((((,,,,,.}))))))))))),,))))}..........((((........)))).)))).)))))))))))..((((({,((((..,,((((...((((.((.(((.{.(((((((.(((((((({{{,((((((.(((((((,...{(({(,.({((({({{|,,....}))).}))))}.,|,}})}.,))))}..{{...........}}(((((((((((...((((....))))......))))))))))),,.(((.((((..((((.,({..((((((((((.....,,.,,,((({,...,|||.||.||||,,,(((((.((((.......,.)))).))))}(((.((((((((,..............(((((((....))},))))..((((((((((((....((.(((((({(((......)))}.(((((.....)))))...((.((((((,{{{.{(((.|(((((.{{{{{.,{....................,,.}}}}}},)))))|.)))}.}})|{,{.((((((((((((((((...((({.{{((....)))).,,,,,}}.,.)))))).))))}}))))),....)))))).))....(((,(((,,,{.........((((((.(.(((((((((.((((((.(((((((((.,,..,{,,{((,.....})}||,.,((((.....))))..,}}.........{.(((((((((((((((({{{{......(((({...})))).{,||{((((((.{.((((((.(((((((((((...((((((((...((((..(((...(((((((........(((((.(({..((....{{{{...,,,,.............((((((..((((((...,......,),))}}})))))}},}},..}|||,...}),,))).))))).......,,..)))))))....,.)))..))))..)).))))))..((((((.....,.....,......))))))(((((((..((((......(((((((..((((((((.,,,....||||((((.(((((((.((,.((........,}.}.)).))))))))))).{(((((.(((..(((((..((((..((((.((((((({.....,,.(((.((((((({....}))))))).))).....((((((....((((((..{{....)).))))))..))))))....|..((((((.((((....(((......)))....))))..))))))..,....))))))))...))))..)))).....))))).))).)))))}((((((.....))))))..,,},........))))))))...)))))))....((((((((((((.(((......))).))))){(,,.,||,,.....{{.,,,,|.,,(((((,..((((......))))..(((((..{((((.,......,,{|,...,|||.(((.((((((((....)))))))).))).,.......))))}...))))){(({..{(({....})))}))}(((((((((((.,........,......((.(((..........))))).....,.))))))))))).{(((((({(((((..{((((({|,,|||....))))))))).,..)))))).))))))).,)))))))))))....},))))..))))))).))))))))))))))))).)..))))},))}))))}))}))))))))))))).).((({{.,,(((((((.(((.....))).))))))))))))..........,}........)))))))))..)))))}.......))))))))).).)))))).,||{.,,..((((.(((((((,.,(((((.......)))))))))))))..)))).,,}}...{{{...,{{{{.,,{{.....}}))))))}.{((((....))))|{{|,,..}}},.((((((((...((((.((((((((((((((((((((((,((((........)))},,,,(((((((((({(({.(({...((..((((((((((((((....((((((.....))))))..((((((,...,))))))..,({(,{..{...(((((......)))))...}....}),...|,,.......))}).))))))))))))..}}.,,))),),,),,)))))}}))))..)))))))))))))))))..((((((.((...................)).)))))).(((....))).)))))..........((((((((......))))).)))......(((...(((.......)))...))).)))).))))))))..,,}))),))}..,...........))))))))....))))))))))))......)))))).))).))).((.((((((..(((((((((({{{....((((......(((((((((((....,{(({((.(((((....))))).}}..,},,||,,,,..((((.......{(({{(..,.((.....)}..))))}}.......))))..({{{.((((((((((.,,,.....,.,,..)))))))))).,...)}}|}|||,.((((((((((.((((..((....))....))))..))))))},)))....|{{||(,,,.....))))},.(((((......))))}.........((((((((((((((((......)))..)))))))))))))..,,{{{((,((({((,(((((...{||||,.}},.))))).}|||||,||}}}},{{{{|||,,,,,))))})}((((((...(((.....)))...)).)))),....|..((((......))))..,.))))))))))).......))))}}..})))))))))....))))))))((((((.((((((.((((.......)))).))))))..))))))...,({(((((....)))),})||(,{(((((((....((((((({,(((........(((((((((((..........((((((((({((((((((((......)))))))).....)).}))))..)))))...((((((((.........)))))))).........))))))).)))).)))))))))))....)))))))))},...........,||},|..,}}}}|}}}},{{|||.|||)})))),....)))))),,.((((.(((((.....((((...........))))))))).)))))))))))))).}),.)))).))))))).,...((((((({({....}))))))))}))).))))))..,,..,,..))),}))))..))))))).}.))).))..))))...))))....,,..)))))))))))))))))).}|||((((((((...{,....,,.....})))))))},}}.,,,,}}})}))})))))))).)))))).}),))))))))))).,.,,...,,.....}))))))))))......})))).)))))).....,}.))))).))).)))))))..))))))).))))))).,.)))))..)))))))))..,,....,,.}).)))))))),)))}))))))))},,.,,,)}.,)))),))).,.,...,,,)))),.,,,))))))))),))}}).})))))),.}})))))))))..,,..}}}}}}}}}}}}}))}|||,|}}.....))}}}}}}}}..|}||,,||}|,((((((.....}))))}.............((((((((((..(((((((...((((((............)))))).)))))))..))))))))))..})}))).,...,,|(((((((((((((.((((.((((((....,,,)))}}).)))).(((((((((((.,.{{.(({((...,|||}}{{.,,..},.,,,|||{,,..}))).)))))}...})))))....||,|||||}}|,|||....}}}}}}}},||,.|||}}..,})})))}........})),,.)))))}}.))}}.|}|}}},,},||||}|||{(....{{{{({,.(((((((((.,,{|||||||||..,,.,||{,,||,,|||||{{,.....||.|{(((.......))))}.}|||,}},},..))}}})).))),.,},}})),}}))}))|.||||.|||,,.}}}}}}}}||,((((.((((((((.(((((............))))).))..}))))}.)))).......,{(((((((,,,|}}}}}}}|.,,,{,,..(((((((.........))))))),.,,...{.(((({.{(.((((.{.|{{,....}}))))))))))))),{((((....))))},,..,|,,..,.,...{||{{{{,{(((((((((((...})))))))))))))}))}.,,{|{{{{{{{{,{|..||..((((..,{....}}}}}}}|}}.}}}}}}{{{{{|.........{(((({.{{{..{{{{(((({{(|,......,||{{,,.(((((((((({....}))),})))))))})}))}})),...))))).,,,...((((((.........)))))){{||...,...,}}.,,},,.,,))}))))))))))|||||,,,,,,,,.))))}..{{{|...)))}.}})|}}|}},,},,},}......,}}))))))),,,)))}..|}}}}}.,,.,)))}}|{|}||,|}|||||,,.}}}|||.||}}}},}||,,..,},,,},,.))))},)))}}}}}}}|||}},...,,,,,,}}|{{,,.((((({{((((((.(((((((.(((((((((..((....)).))))}.....,..{{{||,.{{{{.,,,,,,,.}}}}..))))),..,))))..))))))).))))))))))))..........,,......(({{....})))..

Transcripts

ID Sequence Length GC content
GUCAGAGUCUUAGUUAUAAAGGCAAGUGUGAACCGGACAGCAGACAGGA… 6040 nt 0.4248
GUCAGAGUCUUAGUUAUAAAGGCAAGUGUGAACCGGACAGCAGACAGGA… 6028 nt 0.4257
GUCAGAGUCUUAGUUAUAAAGGCAAGUGUGAACCGGACAGCAGACAGGA… 5968 nt 0.4256
GUCAGAGUCUUAGUUAUAAAGGCAAGUGUGAACCGGACAGCAGACAGGA… 5935 nt 0.4254
GUCAGAGUCUUAGUUAUAAAGGCAAGUGUGAACCGGACAGCAGACAGGA… 5809 nt 0.4233
Showing 21 to 25 of 25 entries
Summary

This gene encodes a member of the membrane-associated guanylate kinase (MAGUK) family. The encoded protein forms a heterodimer with a related family member that may interact at postsynaptic sites to form a multimeric scaffold for the clustering of receptors, ion channels, and associated signaling proteins. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. Additional transcript variants have been described, but their full-length nature is not known. [provided by RefSeq, Dec 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the DLG2 was part of a common cosplicing network of glutamatergic synapse genes in brain reward circuitry, identified through RNA-Seq analysis of selectively bred lines with differential risk for methamphetamine intake [Hitzemann et al. DOI:10.3390/brainsci9070155].