Basic Information

Symbol
DLG3
RNA class
mRNA
Alias
Discs Large MAGUK Scaffold Protein 3 SAP102 KIAA1232 SAP-102 PPP1R82 NEDLG MRX90 Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 82 Synapse-Associated Protein 102 Disks Large Homolog 3 Neuroendocrine-Dlg NE-Dlg XLMR Discs, Large Homolog 3 (Neuroendocrine-Dlg, Drosophila) Discs, Large Homolog 3 (Drosophila) Synapse Associated Protein 102 Discs, Large Homolog 3 Discs Large Homolog 3 Neuroendocrine-DLG XLID90 MRX
Location (GRCh38)
X:70444835-70505490
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_021120.4
Sequence length
6042.0 nt
GC content
0.5218

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2251.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2356.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1670.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001166278.2 NCBI
GUGUCCGUGGUCUCCCGCGCGGGACGGAGGGACUGGCCGGAGCUGGCGC… 4453 nt 0.4797
NM_020730.3 NCBI
GUGGAGCGUUUAGGGGGCUGAGGAGGCGAGGGCAGCGGAGUUUCCUGCC… 5090 nt 0.5014
NM_021120.4 NCBI
ACUCCACUCAGAUCCAUCCUGGGGACCAGAGCAGAAGCGGUCCUCACAG… 6042 nt 0.5218
Summary

This gene encodes a member of the membrane-associated guanylate kinase protein family. The encoded protein may play a role in clustering of NMDA receptors at excitatory synapses. It may also negatively regulate cell proliferation through interaction with the C-terminal region of the adenomatosis polyposis coli tumor suppressor protein. Mutations in this gene have been associated with X-linked cognitive disability. Alternatively spliced transcript variants have been described. [provided by RefSeq, Oct 2009]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the DLG3 (Discs large MAGUK scaffold protein 3) was identified as part of a common cosplicing network of glutamatergic synapse genes and as a key interacting partner of Grin1 in a ventral midbrain differential splicing protein-protein interaction network, indicating its role in synaptic organization and differential splicing associated with genetic risk for methamphetamine intake [Hitzemann et al. DOI:10.3390/brainsci9070155].