Basic Information

Symbol
DLG4
RNA class
mRNA
Alias
Discs Large MAGUK Scaffold Protein 4 SAP-90 PSD95 SAP90 PSD-95 Synapse-Associated Protein 90 Discs Large Homolog 4 Disks Large Homolog 4 Discs, Large Homolog 4 (Drosophila) Post-Synaptic Density Protein 95 Postsynaptic Density Protein 95 Tax Interaction Protein 15 MRD62
Location (GRCh38)
17:7187187-7219836
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses Sudden death from CNS diseases
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001321075.3
Sequence length
6176.0 nt
GC content
0.5471

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2364.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2474.84 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1762.93
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001128827.4 NCBI
CCUCCUCUCUCCCCUUCCCUCUUCGGCUCCACGGCUCCCUCGGCCGCUG… 6167 nt 0.5471
NM_001321074.1 NCBI
AGACCUUCCGCCCCCGAGCCUCAGCAGCUGCCGCCCCAAGCUCGCGGCC… 4344 nt 0.5769
NM_001321075.3 NCBI
CCUCCUCUCUCCCCUUCCCUCUUCGGCUCCACGGCUCCCUCGGCCGCUG… 6176 nt 0.5471
NM_001321076.3 NCBI
AGUUCCUGACGUCCUUUGCACUGCGUAGGGUGAGGGGCGUAGGGGAGCG… 5842 nt 0.5380
NM_001321077.3 NCBI
AGUUCCUGACGUCCUUUGCACUGCGUAGGGUGAGGGGCGUAGGGGAGCG… 5833 nt 0.5380
NM_001365.5 NCBI
GUAGUUCCCUGGAGCCCGGCCCUGCGUUCCGCUGACUUAGAGGGAUCUC… 6812 nt 0.5376
NM_001369566.3 NCBI
GAUCAGUCCUUUCCCUCAUCAGUCCUCUCCCUCCAUCAGCCAGCUCCCC… 5932 nt 0.5339
Summary

This gene encodes a member of the membrane-associated guanylate kinase (MAGUK) family. It heteromultimerizes with another MAGUK protein, DLG2, and is recruited into NMDA receptor and potassium channel clusters. These two MAGUK proteins may interact at postsynaptic sites to form a multimeric scaffold for the clustering of receptors, ion channels, and associated signaling proteins. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the DLG4 was part of a common cosplicing network of glutamatergic synapse genes in brain reward circuitry regions, specifically identified through RNA-Seq analysis of selectively bred lines with differential risk for methamphetamine intake [Hitzemann et al. DOI:10.3390/brainsci9070155]. A study in rats demonstrated that the DLG4 exhibits a biphasic upregulation in mRNA and protein levels following spinal cord injury, with peaks at 2-8 hours and again at 5-14 days post-injury [Cheng et al. DOI:10.1111/j.1365-2990.2007.00917.x].