Basic Information

Symbol
DLGAP1
RNA class
mRNA
Alias
DLG Associated Protein 1 SAPAP1 DAP-1 GKAP Discs Large Homolog Associated Protein 1 Guanylate Kinase-Associated Protein SAP90/PSD-95-Associated Protein 1 Disks Large-Associated Protein 1 DAP1 Discs, Large (Drosophila) Homolog-Associated Protein 1 PSD-95/SAP90 Binding Protein 1 PSD-95/SAP90-Binding Protein 1 DAP-1-ALPHA DAP-1-BETA DLGAP1A DLGAP1B HGKAP
Location (GRCh38)
18:3496032-4455307
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry evaluation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004746.4
Sequence length
6655.0 nt
GC content
0.5019

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2149.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2273.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1623.66
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001003809.3 NCBI
ACUUAGAAUCGGCAAAUCAUAGAGAGAAGCUAAAUGCUCUCAGCUGCAC… 5257 nt 0.4552
NM_001242761.2 NCBI
AGCCCAGCCUUGCAGCCCCAGCCCGCCGCGUCCCGGCGCUCAGCCUCCG… 3634 nt 0.5625
NM_001242762.2 NCBI
AGAACUAUUGUACCGCUGCCAGUGACUGUCUGUAUUAGGGUUGGGAGCA… 5193 nt 0.4566
NM_001242763.2 NCBI
AGAACUAUUGUACCGCUGCCAGUGACUGUCUGUAUUAGGGUUGGGAGCA… 5307 nt 0.4558
NM_001242764.2 NCBI
AGAGGGAGCGAGAGAGAGAGCAAGACAGACCGAGAAGGAAAGCACUCCC… 5279 nt 0.4575
NM_001242765.2 NCBI
ACUUAGAAUCGGCAAAUCAUAGAGAGAAGCUAAAUGCUCUCAGCUGCAC… 2236 nt 0.4906
NM_001242766.2 NCBI
ACUUAGAAUCGGCAAAUCAUAGAGAGAAGCUAAAUGCUCUCAGCUGCAC… 5287 nt 0.4549
NM_001308390.2 NCBI
AGAGGGAGCGAGAGAGAGAGCAAGACAGACCGAGAAGGAAAGCACUCCC… 5309 nt 0.4571
NM_001398525.1 NCBI
AGCCCAGCCUUGCAGCCCCAGCCCGCCGCGUCCCGGCGCUCAGCCUCCG… 6685 nt 0.5014
NM_001398526.1 NCBI
AGCCCAGCCUUGCAGCCCCAGCCCGCCGCGUCCCGGCGCUCAGCCUCCG… 6680 nt 0.5013
Showing 1 to 10 of 29 entries
Summary

Predicted to enable molecular adaptor activity. Predicted to be a structural constituent of postsynaptic density. Predicted to be involved in several processes, including aggresome assembly; protein localization to synapse; and regulation of proteasomal protein catabolic process. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be active in glutamatergic synapse and postsynaptic density, intracellular component. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans using RNA-seq data from 59 brain samples demonstrated that the DLGAP1 is downregulated and involved in the glutamatergic synapse pathway, with a machine learning model achieving 61.11% test accuracy for classifying Major Depressive Disorder and its suicidal subtype [Verma et al. DOI:10.007/s11571-021-09724-8].