Basic Information

Symbol
DLGAP1
RNA class
mRNA
Alias
DLG Associated Protein 1 SAPAP1 DAP-1 GKAP Discs Large Homolog Associated Protein 1 Guanylate Kinase-Associated Protein SAP90/PSD-95-Associated Protein 1 Disks Large-Associated Protein 1 DAP1 Discs, Large (Drosophila) Homolog-Associated Protein 1 PSD-95/SAP90 Binding Protein 1 PSD-95/SAP90-Binding Protein 1 DAP-1-ALPHA DAP-1-BETA DLGAP1A DLGAP1B HGKAP
Location (GRCh38)
18:3496032-4455307
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry evaluation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004746.4
Sequence length
6655.0 nt
GC content
0.5019

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2149.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2273.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1623.66
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001398539.1 NCBI
AGAACUAUUGUACCGCUGCCAGUGACUGUCUGUAUUAGGGUUGGGAGCA… 2286 nt 0.4913
NM_001398540.1 NCBI
AGAGGGAGCGAGAGAGAGAGCAAGACAGACCGAGAAGGAAAGCACUCCC… 2294 nt 0.4943
NM_001398541.1 NCBI
AGAGGGAGCGAGAGAGAGAGCAAGACAGACCGAGAAGGAAAGCACUCCC… 2288 nt 0.4943
NM_001398542.1 NCBI
AGAACUAUUGUACCGCUGCCAGUGACUGUCUGUAUUAGGGUUGGGAGCA… 2256 nt 0.4925
NM_001398543.1 NCBI
AGAGGGAGCGAGAGAGAGAGCAAGACAGACCGAGAAGGAAAGCACUCCC… 2264 nt 0.4956
NM_001398544.1 NCBI
ACUUAGAAUCGGCAAAUCAUAGAGAGAAGCUAAAUGCUCUCAGCUGCAC… 2266 nt 0.4894
NM_001398545.1 NCBI
AGAGGGAGCGAGAGAGAGAGCAAGACAGACCGAGAAGGAAAGCACUCCC… 2258 nt 0.4956
NM_001398546.1 NCBI
AGAGGGAGCGAGAGAGAGAGCAAGACAGACCGAGAAGGAAAGCACUCCC… 2174 nt 0.4982
NM_004746.4 NCBI
AGCCCAGCCUUGCAGCCCCAGCCCGCCGCGUCCCGGCGCUCAGCCUCCG… 6655 nt 0.5019
Showing 21 to 29 of 29 entries
Summary

Predicted to enable molecular adaptor activity. Predicted to be a structural constituent of postsynaptic density. Predicted to be involved in several processes, including aggresome assembly; protein localization to synapse; and regulation of proteasomal protein catabolic process. Predicted to be located in plasma membrane. Predicted to be active in glutamatergic synapse and postsynaptic density, intracellular component. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans using RNA-seq data from 59 brain samples demonstrated that the DLGAP1 is downregulated and involved in the glutamatergic synapse pathway, with a machine learning model achieving 61.11% test accuracy for classifying Major Depressive Disorder and its suicidal subtype [Verma et al. DOI:10.007/s11571-021-09724-8].