Basic Information

Symbol
DLGAP4
RNA class
mRNA
Alias
DLG Associated Protein 4 SAPAP4 DAP4 KIAA0964 Discs Large Homolog Associated Protein 4 SAP90/PSD-95-Associated Protein 4 Disks Large-Associated Protein 4 PSD-95/SAP90-Binding Protein 4 SAPAP-4 DAP-4 Discs, Large (Drosophila) Homolog-Associated Protein 4 DLP4
Location (GRCh38)
20:36306302-36528637
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001365621.2
Sequence length
5058.0 nt
GC content
0.6135

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2016.45 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2099.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1103.08
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001042486.4 NCBI
GUACAAAACCGGAGCCUCGGGCCGGGCUGCGUGAGGGAGGAGGGUUCAU… 2976 nt 0.5709
NM_001365621.2 NCBI
GCAGCCGCAUCUGGGGCGCCGCGCCGGCCGGAGGAGAGGCAUGGGGCGC… 5058 nt 0.6135
NM_001388257.1 NCBI
GUACAAAACCGGAGCCUCGGGCCGGGCUGCGUGAGGGAGGAGGGUUCAU… 2887 nt 0.5708
NM_001388260.1 NCBI
GUACAAAACCGGAGCCUCGGGCCGGGCUGCGUGAGGGAGGAGGGUUCAU… 3056 nt 0.5710
NM_001388262.1 NCBI
GUACAAAACCGGAGCCUCGGGCCGGGCUGCGUGAGGGAGGAGGGCUGUG… 3079 nt 0.5700
NM_001388265.1 NCBI
GUACAAAACCGGAGCCUCGGGCCGGGCUGCGUGAGGGAGGAGGGCUGUG… 3159 nt 0.5701
NM_001388268.1 NCBI
AGUCCUCCAGCCCGUGUCCCCGCUCCGCCCGCUUUGUCUCUCCCCGGCU… 3649 nt 0.5807
NM_001388271.1 NCBI
AGUCCUCCAGCCCGUGUCCCCGCUCCGCCCGCUUUGUCUCUCCCCGGCU… 3818 nt 0.5804
NM_001388274.1 NCBI
AGUCCUCCAGCCCGUGUCCCCGCUCCGCCCGCUUUGUCUCUCCCCGGCU… 3841 nt 0.5795
NM_001388275.1 NCBI
CUUCCGGGGCAGAGCUGAGCUGGAGCUGGGCUUCUGUCAGCUUGGGAAA… 3036 nt 0.5682
Showing 1 to 10 of 14 entries
Summary

The product of this gene is a membrane-associated guanylate kinase found at the postsynaptic density in neuronal cells. It is a signaling molecule that can interact with potassium channels and receptors, as well as other signaling molecules. The protein encoded by this gene can interact with PSD-95 through its guanylate kinase domain and may be involved in clustering PSD-95 in the postsynaptic density region. The encoded protein is one of at least four similar proteins that have been found. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice selectively bred for high or low methamphetamine intake identified the DLGAP4 as a key interacting partner of Grin1 in a ventral midbrain differential splicing protein-protein interaction network and as part of a common cosplicing network of glutamatergic synapse genes [Hitzemann et al. DOI:10.3390/brainsci9070155].