Basic Information

Symbol
DLGAP4
RNA class
mRNA
Alias
DLG Associated Protein 4 SAPAP4 DAP4 KIAA0964 Discs Large Homolog Associated Protein 4 SAP90/PSD-95-Associated Protein 4 Disks Large-Associated Protein 4 PSD-95/SAP90-Binding Protein 4 SAPAP-4 DAP-4 Discs, Large (Drosophila) Homolog-Associated Protein 4 DLP4
Location (GRCh38)
20:36306302-36528637
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001365621.2
Sequence length
5058.0 nt
GC content
0.6135

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2016.45 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2099.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1103.08
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001388277.1 NCBI
GUACAAAACCGGAGCCUCGGGCCGGGCUGCGUGAGGGAGGAGGGUUCAU… 2967 nt 0.5709
NM_001388278.1 NCBI
AGUCCUCCAGCCCGUGUCCCCGCUCCGCCCGCUUUGUCUCUCCCCGGCU… 3729 nt 0.5806
NM_014902.6 NCBI
GCAGCCGCAUCUGGGGCGCCGCGCCGGCCGGAGGAGAGGCAUGGGGCGC… 5049 nt 0.6136
NM_183006.4 NCBI
AGUCCUCCAGCCCGUGUCCCCGCUCCGCCCGCUUUGUCUCUCCCCGGCU… 3738 nt 0.5805
Showing 11 to 14 of 14 entries
Summary

The product of this gene is a membrane-associated guanylate kinase found at the postsynaptic density in neuronal cells. It is a signaling molecule that can interact with potassium channels and receptors, as well as other signaling molecules. The protein encoded by this gene can interact with PSD-95 through its guanylate kinase domain and may be involved in clustering PSD-95 in the postsynaptic density region. The encoded protein is one of at least four similar proteins that have been found. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice selectively bred for high or low methamphetamine intake identified the DLGAP4 as a key interacting partner of Grin1 in a ventral midbrain differential splicing protein-protein interaction network and as part of a common cosplicing network of glutamatergic synapse genes [Hitzemann et al. DOI:10.3390/brainsci9070155].