Basic Information

Symbol
AFAP1L1
RNA class
mRNA
Alias
Actin Filament Associated Protein 1 Like 1 Actin Filament-Associated Protein 1-Like 1 AFAP1-Like Protein 1 FLJ36748 Actin Filament Associated Protein 1-Like 1
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis

MANE select

Transcript ID
NM_152406.4
Sequence length
6024.0 nt
GC content
0.4962

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2052.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2159.19 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1430.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGAGAGCGCCGGCCGCUGGGCUGGCCUGAGAGCGCAGCGCGCCGGCCGC… 5895 nt 0.4957
AGAGAGCGCCGGCCGCUGGGCUGGCCUGAGAGCGCAGCGCGCCGGCCGC… 5925 nt 0.4949
AGAGAGCGCCGGCCGCUGGGCUGGCCUGAGAGCGCAGCGCGCCGGCCGC… 1301 nt 0.6126
AGAGAGCGCCGGCCGCUGGGCUGGCCUGAGAGCGCAGCGCGCCGGCCGC… 6024 nt 0.4962
Summary

Predicted to be located in several cellular components, including actin cytoskeleton; anchoring junction; and cell projection. Predicted to be active in cytosol. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in human cardiac tissue demonstrated that the AFAP1L1 gene, involved in actin stress fiber formation, was increased in EC-angiogenic and EC-general capillary endothelial cell populations in ischemic cardiomyopathy (ICM) compared to non-failing controls [Simonson et al. DOI:10.1016/j.celrep.2023.112086].