Basic Information
Symbol
DLX5
RNA class
mRNA
Alias
Distal-Less Homeobox 5
Distal-Less Homeo Box 5
Homeobox Protein DLX-5
Split Hand/Foot Malformation Type 1 With Sensorineural Hearing Loss
SHFM1D
SHFM1
Location (GRCh38)
7:97020396-97024950
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
MANE select
Transcript ID
NM_005221.6
Sequence length
1418.0 nt
GC content
0.5381
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-411.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-435.88 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
327.02
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| AGCAGUCAGCCGGCCGGAGACAGAGACUUCACGACUCCCAGUCUCCUCC… | 1418 nt | 0.5381 |
Summary
This gene encodes a member of a homeobox transcription factor gene family similiar to the Drosophila distal-less gene. The encoded protein may play a role in bone development and fracture healing. Mutation in this gene, which is located in a tail-to-tail configuration with another member of the family on the long arm of chromosome 7, may be associated with split-hand/split-foot malformation. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
A review of proteomic applications in forensic science spanning 2004–2024, which included studies on human and animal models such as pig, rat, and mouse, identified the DLX5 as a protein marker showing loss post-mortem in bone for late post-mortem interval estimation [Alex et al. DOI:10.1016/j.scijus.2025.101320].