Basic Information

Symbol
DNAJB12
RNA class
mRNA
Alias
DnaJ Heat Shock Protein Family (Hsp40) Member B12 DJ10 DnaJ (Hsp40) Homolog, Subfamily B, Member 12 DnaJ Homolog Subfamily B Member 12 FLJ20027
Location (GRCh38)
10:72332830-72355167
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_017626.7
Sequence length
2935.0 nt
GC content
0.5366

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1024.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1073.38 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 967.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001002762.5 NCBI
GGUUCCGCGUUCUGGUUCCGCCAUGGAAUCCAACAAGGAUGAAGCUGAG… 4097 nt 0.5631
NM_001365080.3 NCBI
GGUUCCGCGUUCUGGUUCCGCCAUGGAAUCCAACAAGGAUGAAGCUGAG… 2881 nt 0.5345
NM_001365081.3 NCBI
GGUUCCGCGUUCUGGUUCCGCCAUGGAAUCCAACAAGGAUGAAGCUGAG… 2929 nt 0.5367
NM_017626.7 NCBI
GGUUCCGCGUUCUGGUUCCGCCAUGGAAUCCAACAAGGAUGAAGCUGAG… 2935 nt 0.5366
Summary

DNAJB12 belongs to the evolutionarily conserved DNAJ/HSP40 family of proteins, which regulate molecular chaperone activity by stimulating ATPase activity. DNAJ proteins may have up to 3 distinct domains: a conserved 70-amino acid J domain, usually at the N terminus; a glycine/phenylalanine (G/F)-rich region; and a cysteine-rich domain containing 4 motifs resembling a zinc finger domain (Ohtsuka and Hata, 2000 [PubMed 11147971]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly dysregulated the DNAJB12 in microglia, specifically within the protein processing of endoplasmic reticulum pathway [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].