Basic Information

Symbol
DNAJB2
RNA class
mRNA
Alias
DnaJ Heat Shock Protein Family (Hsp40) Member B2 HSPF3 CMT2T HSJ1 DnaJ (Hsp40) Homolog, Subfamily B, Member 2 DnaJ Homolog Subfamily B Member 2 Heat Shock 40 KDa Protein 3 Heat Shock Protein J1 HSJ-1 Heat Shock Protein, Neuronal DNAJ-Like 1 DnaJ Protein Homolog 1 DSMA5 HMNR5
Location (GRCh38)
2:219279342-219286898
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006736.6
Sequence length
3072.0 nt
GC content
0.6126

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1375.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1429.79 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 662.80
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001039550.2 NCBI
AGUAGUUUCCGCACCGCUGACGCAUGCCUGCGCGCACAGCUGGGCCGGG… 1921 nt 0.6054
NM_006736.6 NCBI
AGUAGUUUCCGCACCGCUGACGCAUGCCUGCGCGCACAGCUGGGCCGGG… 3072 nt 0.6126
Summary

This gene is almost exclusively expressed in the brain, mainly in the neuronal layers. It encodes a protein that shows sequence similarity to bacterial DnaJ protein and the yeast homologs. In bacteria, this protein is implicated in protein folding and protein complex dissociation. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2011]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly dysregulated the DNAJB2 in microglia, where it is involved in the protein processing of endoplasmic reticulum pathway [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].