Basic Information

Symbol
DNAJC10
RNA class
mRNA
Alias
DnaJ Heat Shock Protein Family (Hsp40) Member C10 ERdj5 PDIA19 Endoplasmic Reticulum DNA J Domain-Containing Protein 5 Protein Disulfide Isomerase Family A, Member 19 DnaJ (Hsp40) Homolog, Subfamily C, Member 10 DnaJ Homolog Subfamily C Member 10 ER-Resident Protein ERdj5 Macrothioredoxin MTHr J-Domain-Containing Protein Disulfide Isomerase-Like Protein EC 1.8.4.- ERDJ5 JPDI
Location (GRCh38)
2:182715607-182794464
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018981.4
Sequence length
20144.0 nt
GC content
0.3745

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-5320.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -5709.54 kcal/mol
Frequency: 1.0073e-274
Diversity: 4959.67
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001271581.3 NCBI
CCCGGCUCGCCGUGGAGACCGGCGCGUGAGGAACCUACCGGUACCGGCC… 20006 nt 0.3745
NM_018981.4 NCBI
CCCGGCUCGCCGUGGAGACCGGCGCGUGAGGAACCUACCGGUACCGGCC… 20144 nt 0.3745
Summary

This gene encodes an endoplasmic reticulum co-chaperone which is part of the endoplasmic reticulum-associated degradation complex involved in recognizing and degrading misfolded proteins. The encoded protein reduces incorrect disulfide bonds in misfolded glycoproteins. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2012]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly dysregulates the DNAJC10 in microglia, where it is involved in the protein processing of endoplasmic reticulum pathway [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].