Basic Information

Symbol
DNAJC3
RNA class
mRNA
Alias
DnaJ Heat Shock Protein Family (Hsp40) Member C3 P58IPK ERdj6 Interferon-Induced, Double-Stranded RNA-Activated Protein Kinase Inhibitor Endoplasmic Reticulum DNA J Domain-Containing Protein 6 Protein Kinase Inhibitor Of 58 KDa P58(IPK) PRKRI HP58 P58 DnaJ (Hsp40) Homolog, Subfamily C, Member 3 DnaJ Homolog Subfamily C Member 3 Protein Kinase Inhibitor P58 ER-Resident Protein ERdj6 Protein-Kinase, Interferon-Inducible Double Stranded RNA Dependent Inhibitor ACPHD
Location (GRCh38)
13:95677114-95794988
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006260.5
Sequence length
5590.0 nt
GC content
0.3987

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1524.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1635.00 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1333.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_006260.5 NCBI
AGAGCCACUGAGGCCUGAGCGAGAGCCGACGGCGGGCGGGCGCAGCUGC… 5590 nt 0.3987
Summary

This gene encodes a protein with multiple tetratricopeptide repeat (TPR) motifs as well as the highly conserved J domain found in DNAJ chaperone family members. It is a member of the tetratricopeptide repeat family of proteins and acts as an inhibitor of the interferon-induced, dsRNA-activated protein kinase (PKR). [provided by RefSeq, Jul 2010]

Forensic Context

A study in male C57BL/6J mice demonstrated that the DNAJC3 transcript was positively associated with an Addiction Index, a composite score of addiction-like behaviors, across five brain reward regions following cocaine self-administration and withdrawal [Walker et al. DOI:10.1016/J.Biopsych.2018.04.009].