Basic Information

Symbol
DNAJC5
RNA class
mRNA
Alias
DnaJ Heat Shock Protein Family (Hsp40) Member C5 DNAJC5A CLN4 DnaJ (Hsp40) Homolog, Subfamily C, Member 5 Ceroid-Lipofuscinosis Neuronal Protein 4 DnaJ Homolog Subfamily C Member 5 FLJ00118 FLJ13070 CSP Ceroid-Lipofuscinosis, Neuronal 4 (Kufs Disease) Cysteine String Protein Alpha Cysteine String Protein Mir-941-2 Mir-941-3 Mir-941-4 Mir-941-5 CLN4B NCL
Location (GRCh38)
20:63894641-63936031
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_025219.3
Sequence length
5249.0 nt
GC content
0.5790

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2193.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2281.85 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1526.58
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_025219.3 NCBI
GCGUGCGUGAGCGUGCUCGUCUCCGCUGCCGCUGCCGCUGCCGCUGCCG… 5249 nt 0.5790
Summary

This gene is a member of the J protein family. J proteins function in many cellular processes by regulating the ATPase activity of 70 kDa heat shock proteins. The encoded protein plays a role in membrane trafficking and protein folding, and has been shown to have anti-neurodegenerative properties. The encoded protein is known to play a role in cystic fibrosis and Huntington's disease. A pseudogene of this gene is located on the short arm of chromosome 8. [provided by RefSeq, Nov 2010]

Forensic Context

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