Basic Information

Symbol
DNAJC6
RNA class
mRNA
Alias
DnaJ Heat Shock Protein Family (Hsp40) Member C6 KIAA0473 Auxilin PARK19 DnaJ (Hsp40) Homolog, Subfamily C, Member 6 Putative Tyrosine-Protein Phosphatase Auxilin DnaJ (Hsp40) Homolog, Subfamily B, Member 6 DnaJ Homolog Subfamily C Member 6 EC 3.1.3.- DJC6
Location (GRCh38)
1:65248219-65415871
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001256864.2
Sequence length
5962.0 nt
GC content
0.4309

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1702.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1816.32 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1568.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001256864.2 NCBI
GAGCCGAGCUCAGCCCAGGGCGGCGGCUUCGCCUCGCCCGGCGAAGCUU… 5962 nt 0.4309
NM_001256865.2 NCBI
AACCCCGCACACCGACUUGCAUGCAAUUAUCAUAGCCCGAGUGCUCCUC… 5863 nt 0.4228
NM_014787.4 NCBI
AACCCCGCACACCGACUUGCAUGCAAUUAUCAUAGCCCGAGUGCUCCUC… 5750 nt 0.4224
Summary

DNAJC6 belongs to the evolutionarily conserved DNAJ/HSP40 family of proteins, which regulate molecular chaperone activity by stimulating ATPase activity. DNAJ proteins may have up to 3 distinct domains: a conserved 70-amino acid J domain, usually at the N terminus, a glycine/phenylalanine (G/F)-rich region, and a cysteine-rich domain containing 4 motifs resembling a zinc finger domain (Ohtsuka and Hata, 2000 [PubMed 11147971]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

Forensic Context

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