Basic Information

Symbol
DNASE1
RNA class
mRNA
Alias
Deoxyribonuclease 1 Deoxyribonuclease I DNL1 Deoxyribonuclease-1 Dornase Alfa EC 3.1.21.1 DRNI Human Urine Deoxyribonuclease I DNase I, Lysosomal DNase I
Location (GRCh38)
16:3611728-3680143
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005223.4
Sequence length
1346.0 nt
GC content
0.5513

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-473.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -496.14 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 390.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001351825.2 NCBI
GCAGUUUUUACAGCAGCAAGAAACCUGUGCUUACAGAAAGAAACACGUG… 1181 nt 0.5563
NM_001387135.1 NCBI
GAGGCGGAAGCGGCGCUUGCUUCAGGUGGAGUCUGUUAGUUUUUGAGAA… 1991 nt 0.5902
NM_001387139.1 NCBI
GCAGUUUUUACAGCAGCAAGAAACCUGUGCUUACAGAAAGAAACACGUG… 1415 nt 0.5541
NM_001387140.1 NCBI
GAGGCGGAAGCGGCGCUUGCUUCAGGUGGAGUCUGUUAGUUUUUGAGAA… 4668 nt 0.5895
NM_001387141.1 NCBI
GCAGUUUUUACAGCAGCAAGAAACCUGUGCUUACAGAAAGAAACACGUG… 1257 nt 0.5481
NM_005223.4 NCBI
GCAGUUUUUACAGCAGCAAGAAACCUGUGCUUACAGAAAGAAACACGUG… 1346 nt 0.5513
Summary

This gene encodes a member of the DNase family. This protein is stored in the zymogen granules of the nuclear envelope and functions by cleaving DNA in an endonucleolytic manner. At least six autosomal codominant alleles have been characterized, DNASE1*1 through DNASE1*6, and the sequence of DNASE1*2 represented in this record. Mutations in this gene have been associated with systemic lupus erythematosus (SLE), an autoimmune disease. A recombinant form of this protein is used to treat the one of the symptoms of cystic fibrosis by hydrolyzing the extracellular DNA in sputum and reducing its viscosity. Alternate transcriptional splice variants of this gene have been observed but have not been thoroughly characterized. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.