Basic Information

Symbol
DNM1
RNA class
mRNA
Alias
Dynamin 1 DNM EC 3.6.5.5 Dynamin-1 Dynamin I Dynamin DEE31A DEE31B EIEE31 DEE31
Location (GRCh38)
9:128191655-128255248
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004408.4
Sequence length
3217.0 nt
GC content
0.5931

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1265.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1319.15 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 754.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001005336.3 NCBI
AGUCUGGGCGCGCGGCUGCAGCGGCGGAGCCGGAGUCGGAGCCGGGAGC… 3254 nt 0.5925
NM_001288737.2 NCBI
AGUCUGGGCGCGCGGCUGCAGCGGCGGAGCCGGAGUCGGAGCCGGGAGC… 3254 nt 0.5928
NM_001288738.2 NCBI
AGUCUGGGCGCGCGGCUGCAGCGGCGGAGCCGGAGUCGGAGCCGGGAGC… 3899 nt 0.6014
NM_001288739.2 NCBI
AGUCUGGGCGCGCGGCUGCAGCGGCGGAGCCGGAGUCGGAGCCGGGAGC… 3217 nt 0.5934
NM_001374269.1 NCBI
AGUCUGGGCGCGCGGCUGCAGCGGCGGAGCCGGAGUCGGAGCCGGGAGC… 3862 nt 0.6018
NM_004408.4 NCBI
AGUCUGGGCGCGCGGCUGCAGCGGCGGAGCCGGAGUCGGAGCCGGGAGC… 3217 nt 0.5931
Summary

This gene encodes a member of the dynamin subfamily of GTP-binding proteins. The encoded protein possesses unique mechanochemical properties used to tubulate and sever membranes, and is involved in clathrin-mediated endocytosis and other vesicular trafficking processes. Actin and other cytoskeletal proteins act as binding partners for the encoded protein, which can also self-assemble leading to stimulation of GTPase activity. More than sixty highly conserved copies of the 3' region of this gene are found elsewhere in the genome, particularly on chromosomes Y and 15. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the DNM1 gene, which encodes dynamin 1, was identified as part of a common cosplicing network of glutamatergic synapse genes in brain reward circuitry regions of animals selectively bred for differential risk for voluntary methamphetamine intake [Hitzemann et al. DOI:10.3390/brainsci9070155].