Basic Information

Symbol
DOC2B
RNA class
mRNA
Alias
Double C2 Domain Beta DOC2BL Double C2-Like Domain-Containing Protein Beta Double C2-Like Domains, Beta Doc2-Beta Double C2-Like Domains, Beta-Like
Location (GRCh38)
17:142789-181691
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003585.5
Sequence length
6062.0 nt
GC content
0.5879

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2467.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2568.44 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1323.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_003585.5 NCBI
ACUCGCUCGCGCCGUCCGCAGCGGAGCGGGCAGCGGCCAAGUCAGGGCC… 6062 nt 0.5879
Summary

There are at least two protein isoforms of the Double C2 protein, namely alpha (DOC2A) and beta (DOC2B), which contain two C2-like domains. DOC2A and DOC2B are encoded by different genes; these genes are at times confused with the unrelated DAB2 gene which was initially named DOC-2. DOC2B is expressed ubiquitously and is suggested to be involved in Ca(2+)-dependent intracellular vesicle trafficking in various types of cells. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the DOC2B mRNA is dysregulated in lung tissue after radiation exposure, as part of a panel of genes relevant to lung fibrosis [Molykutty J. Aryankalayil et al. DOI:10.1080/09553002.2023.2214205].