Basic Information

Symbol
DOCK1
RNA class
mRNA
Alias
Dedicator Of Cytokinesis 1 DOCK180 Ced5 Dedicator Of Cytokinesis Protein 1 180 KDa Protein Downstream Of CRK DOwnstream Of CrK Dedicator Of Cyto-Kinesis 1
Location (GRCh38)
10:126905397-127452518
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001290223.2
Sequence length
6840.0 nt
GC content
0.4719

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2096.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2221.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1698.20
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001290223.2 NCBI
CUCCCCAUCCUGUCGCGGCUCGAAAGGAAUGGAAAAUGGCGGCCUAGAC… 6840 nt 0.4719
NM_001377543.1 NCBI
CUCCCCAUCCUGUCGCGGCUCGAAAGGAAUGGAAAAUGGCGGCCUAGAC… 6939 nt 0.4730
NM_001377544.1 NCBI
CUCCCCAUCCUGUCGCGGCUCGAAAGGAAUGGAAAAUGGCGGCCUAGAC… 6813 nt 0.4719
NM_001377546.1 NCBI
CUCCCCAUCCUGUCGCGGCUCGAAAGGAAUGGAAAAUGGCGGCCUAGAC… 6720 nt 0.4696
NM_001377547.1 NCBI
CUCCCCAUCCUGUCGCGGCUCGAAAGGAAUGGAAAAUGGCGGCCUAGAC… 6714 nt 0.4723
NM_001377548.1 NCBI
CUCCCCAUCCUGUCGCGGCUCGAAAGGAAUGGAAAAUGGCGGCCUAGAC… 6693 nt 0.4720
NM_001377550.1 NCBI
CUCCCCAUCCUGUCGCGGCUCGAAAGGAAUGGAAAAUGGCGGCCUAGAC… 6678 nt 0.4714
NM_001377553.1 NCBI
CUCCCCAUCCUGUCGCGGCUCGAAAGGAAUGGAAAAUGGCGGCCUAGAC… 6657 nt 0.4687
NM_001377554.1 NCBI
CUCCCCAUCCUGUCGCGGCUCGAAAGGAAUGGAAAAUGGCGGCCUAGAC… 6624 nt 0.4721
NM_001377556.1 NCBI
CUCCCCAUCCUGUCGCGGCUCGAAAGGAAUGGAAAAUGGCGGCCUAGAC… 6582 nt 0.4707
Showing 1 to 10 of 13 entries
Summary

This gene encodes a member of the dedicator of cytokinesis protein family. Dedicator of cytokinesis proteins act as guanine nucleotide exchange factors for small Rho family G proteins. The encoded protein regulates the small GTPase Rac, thereby influencing several biological processes, including phagocytosis and cell migration. Overexpression of this gene has also been associated with certain cancers. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Mar 2014]

Forensic Context

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