Basic Information

Symbol
DOCK1
RNA class
mRNA
Alias
Dedicator Of Cytokinesis 1 DOCK180 Ced5 Dedicator Of Cytokinesis Protein 1 180 KDa Protein Downstream Of CRK DOwnstream Of CrK Dedicator Of Cyto-Kinesis 1
Location (GRCh38)
10:126905397-127452518
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001290223.2
Sequence length
6840.0 nt
GC content
0.4719

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2096.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2221.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1698.20
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001377558.1 NCBI
CUCCCCAUCCUGUCGCGGCUCGAAAGGAAUGGAAAAUGGCGGCCUAGAC… 6570 nt 0.4717
NM_001377560.1 NCBI
CUCCCCAUCCUGUCGCGGCUCGAAAGGAAUGGAAAAUGGCGGCCUAGAC… 5985 nt 0.4759
NM_001380.5 NCBI
CUCCCCAUCCUGUCGCGGCUCGAAAGGAAUGGAAAAUGGCGGCCUAGAC… 6777 nt 0.4710
Showing 11 to 13 of 13 entries
Summary

This gene encodes a member of the dedicator of cytokinesis protein family. Dedicator of cytokinesis proteins act as guanine nucleotide exchange factors for small Rho family G proteins. The encoded protein regulates the small GTPase Rac, thereby influencing several biological processes, including phagocytosis and cell migration. Overexpression of this gene has also been associated with certain cancers. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Mar 2014]

Forensic Context

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