Basic Information

Symbol
DOCK4
RNA class
mRNA
Alias
Dedicator Of Cytokinesis 4 KIAA0716 Dedicator Of Cytokinesis Protein 4 FLJ34238
Location (GRCh38)
7:111726110-112206407
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001363540.2
Sequence length
8353.0 nt
GC content
0.4390

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2463.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2623.85 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2457.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((....(((.((((..((((....))))..)))))))(((((.(((((((.(((((((((..((((.((((((((((..((((.(((..(((((((((....)))..))))))..))).))))....))))))))))((((.((.((.((((((((.(((((((((..(((((((..((((.(((...((((((((..(((.((((((((((.(((((....((.....))....)))))..)))))))).((((((((((.....((((..(.((.(((((..((((.......)))).)))))))..)..))))))))))))))(((..((((.............)))).))).(((.(((((.((((.(((((((((...(((((.(((((((.....((((.........)))).....(((..((((((.(......((((...((..(((((.....((((.((.....((((...(((......))).))))..)).))))..)))))..))....))))......))).)))))))((((((((((......)))))))).))....)))))))..))))).))))))))).)))).))..........))).)))(((((((((((..(((((((((((........))))).(((((.(((.(((...((((..((((..(((((((((((..(((.((((.........((((...((((.((((((((((.....)).)))).............(((.(((..((((.....))))..))).))).((((((...))))))((((((............))))))))))))))))))...((.((((((.(((((.....(((((....).))))....))))).)))))).))((((((((((((((.(((((((....)))))))...(((((..((((.((((....))))))))))))).........((((((....))))))(((......))).......((((((..(((....)))...))))))((((((((((((((.((............)).((((((....(((((..(((((..(.((.((.(((.(.....((.....))....).))).)).)).)))))).))))).)))))).)))))))).)))))).((((....)))).))))....))))))))))..((((...((.(((....))))).))))..(((((((((((....(((((((((.............(((((.((..(((.....((((.((((((((..(((((...((((.((......)).))))))))).))))....(((.....)))..((((((((((....)))))))))).(((((...)))))......(((((((((.(((((((((....((.(.((((((((.(((((......)))))...)))))......))).).))))))))))).((((((((((((.((((((....(((.....(((((((....))))))))))....)))))).....(((((((.......))))))))))))((((((((((..((((.(((((((..((((((((((....(((((..............)))))..((((((((((((((..((((....))))........(((((((........)))))))))))))))))..))))))))))))))...(((.((((((((..........)))))))).)))((((((((((((((((((..(((((((((...(.((((..(((((.(((....(((....((((((((((.........))))))...))))...)))................((((((((((.....)))))))))).........))))))))..)))))..))))))))).........)))))).((((((..((((((...((((........)))).........((((((((..((((((...((.((((.........)))).))..))))))..))))))))..))).)))..)))))).......(((((.((((((((((((((((.((.(((((((((((((.....))))))))...))))).))))))..)))))..(((((((.((((........((((((((((.....))))))))))..........))))(((((.(....))))))..)))))))))))))).))))).))))))).)))))...........)))))))..))))..))))(((((.((((((((((.((...((....))...))....((((((((((.(((((...((((........))))............(((.((((((((((((..(((...)))))).)))))...((((((((((((....)).....))))))))))....(((.((.((((((((((....))))))).))).)).)))(((......)))....(((((((((((((((((((((......((((((((((((((....((((..(((((((.........)))).)))))))...(((((((....))))))).(((....)))...((((((.(.(((....))))))))))........))).)))))).)))))......(((..((((((((((...((((.(((((((((.((.....(((..((((((((((((((((((.(((((...((((((((..(((((((((((..(((((....((((((....(((((((((..((((.(((((.((((........((((.((((....)))).)))).........)))).)))))...((((....))))))))..)))))))))......(((......)))(((((.((..((((((.(.(((..((((((((((((...(((((..(((((((((((.(((((((...((((...((((........))))...)))))))))))..((((((..((((((.................((((((......((.((((((.(((((((((((..((((.(((........((((..((..((((....))))..(((((((...(((((.(((......)))))))).(((.......))).))))))).....((((((((.....(((.(((...(((......)))..)))))).......))))))))................)).))))........))))))).))))))))))).)))))).)).(((((((...........))))))).......(((((....)))))((((......((((.(((((((....(((.((((................)))).)))..)))))))....))))......))))))))))))))))....))))))))))))((((.(((.....(((((((((..........)))))))))...)))))))..((....))((..((((..((..........))..))))..))...)))))..)))))..((((.........))))...((((........))))((((.(((((((...........(((.....)))((((..((....(((.....))).....))..)))).....((((((..(((((((..........)))))))....))))))...))))))).)))).........)))))))))).....))...))).).))))))....)).)))))))))))))))))))))))...)))).)))).......))))...))))).)))))).))))).............((((.(((((((((((((..........((((((.(((((((....((((((((((((........(((((.((((((((((((.(((((....(((((.....))))).......((((((((.((....((((.((.....))..))))......(((((((((.....(((((((........))))))).....(((((......))))).....(((((...))))).....(((((...))))).(((....))).(((...))))))))))))....)).)))))))).............(((((....(((.((((....))))...)))))))).....(((((((....))))))).((((....))))...((.(((((((((.(((.(((((((((.((.((((((...))))))....(((......)))..))))).....)))))).))).))))))).)).)).......))))).)))))))..))))).....))))).......((((.....(.(((.(.(((.(......).))))))).)....)))))))).))))))))................))))))).)))))).......((((((((((.((((((((((..((((((((((....((((..(((((((.((...............(((((......)))))...)).)))).))).))))((((..(((...))).))))((((.......)))).......))))))))))............(((((....(........)...)))))............(((((....(((((((.((((.((..(((((....((..((((.....))))..))..)))))..))...)))).)))))))......))))).))).))))))).))))))))))...((((...(((((((...)))))))...))))......(((.......)))))))....)))).)))))))))(((....)))...))))))).))).)).))))))))).))))..(((((.........)))))((((.....))))............))))))))))..))).(((........)))...)))))))))))))))).......(((((((....)))).))).)))))(((((.....))))).)))).)))))))).)......))))))))))))))))))).)).....)))....((((..............))))(.((((((.((((.((((...(((((((.((((((.((((((((((......(((((((((......))))......((((((.((((((....))))))...(((.......((.((((.(((........((((....))))........))).)))).))........)))(((((((((((....)))...))))))))....((((((....))))))............(((((....)))))((((((.((((..((.(((((((.(..(((......((((.......))))......)))..).)))..))))..))...)))).))))))))))))....((((.((........)).)))).........((((((..............)))))))))))..)))))))))).))))))........))))))))))))))).)))))).).))))))...)))))))....))))........))))).))))))))....))).))))))).......((((((...)))))).......(((((((((......))))))))).....))))..))))))))))))))))..(((......)))....)))).)))..))))))))).)).....))))..)))).))).))).))))).))))))))))....))))))).........)).)))..)).))))))))).))))..).))))))))))))))).))))..((((.....))))((((.((((....(((.........)))...)))).)))).....)))).)).)).)))).)))))))))).........)))..))))))))))))......(((......))).(((((.(((((((((............))))))))).(((((....))))).....(((((.((.((.....))))))))))))))((((((..((((...(((((((......(((.....((((.((((((((.((..(((..((((((((.....(((((((......((((.....(((((((..(((.((((....))))..)))..))).))))....))))(((((.((.(..(((..(((((((..........((((.((((....(((((((((.....(((((....(((((((..(((((....((((.......)))).....)))))..)))))))((((((((((.((..((((((.....))))))..)).)))))...))))).....(((..(((........(((((..((((((((((((((.((........)).)))))))))))))).)))))........)))..))).)))))...))))).))))....))))))))......((((.((((.((......)).)))).)))).....)))))))..)))....).))..))))).((((....))))..(((((..((((((((((((..((....))..)))...((..((((((((((...(((.((((((((............(((((.(((((.((((((((((((((((((((..((((((((((((((((......(((....(((((.(((.....))))))))....))).((((...))))..((((((((((...((.((..(((((((...((((......)))).....)))))))..)).)))))))))))).......)))))))))).(((((((((((((((....)))).......((((......)))).(((....)))......((((((.((((((......)))))).))))))))))))...)))))..(((((.....)))))...........((((((.............))))))....)))))).))))).).)))))))))))))))))))...)))))))))))))..))))))))))))))).........................(((((((......)))))))..)))))).)))..)))))(.((((((....)))))).).....)))))))...((((((((((....(((......)))..))))).))))).))))))))...)))..)))))))))).))))....))))))))))..))))(((.((((((((((((((((((...........(((.((((...)))).)))...))))).)))))))))..)))).)))(((((((((((........(((((.........)))))(((......)))(((((..((((((((((((((((.(((..(((...))).))).)))..(((((((((((((((((.((((((((((((((((.......))))))))....((((((((.....))))))))..((((.((((....)))).))))...))))....)))).))))))).........)))))))))).......)))))).)))))))...))))).)))))))))))....((((((((...((((((((.((..((((....(((((((((.((((((((...(((.....(((((.(((((((......)))).....))).))))))))...)))))))))))))))))...)))).)))))))))))))))))).(((((((((...((.((....((((((((((((((.......((((((((....((.((((((..((.((((((((((...(((((...)))))(((....))).(((((((((((....)))))))))))(((..((......))..)))....)))))))))).))....)))))).))..)))).)))))))))).))))))))....)))))))))))))((((........))))..............))))))((((((.(((((((((..(((.((((((.....((((...(((.....)))...))))...)))))).))).......))).)))))).))))))......))))))((((((.((.(((((((((((.((((.((...)).)))).....)))))).))))))).))))))...((((((.............))))))............
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((((({...,(((.((((..((((....))))..)))))))(((((.(((((((.(((((((((,{((,{.((((((((((,.((((.(((..(((((((((....)))}.})))))..))).))))....))))))))))((((.((.((.((((((((.(((((((((..(((((((..((((.{{{.,|({{{{|||,.{(({{,((((((((.(((((.{{.((.....)).,..)))))..)))))))).((((((((((.....{(((..{.{{.{{{{{..{{||,,,,...}))},||}))|}..}..}}}})))))))))),,,||,||||||||||}.,,,,}}||||{,.{((,({{((.((((.(((((((((...(((((.(((((((.....((((.........)))).....{{{..{((({(.,...,..{{{{,,,.(((((.(((.....))).))).)}.}}}....{((,...,,|||........(((((....))))},|||...,,,.,,,,..,)).)))))))|{((((((((......)))))))).))....)))))))..))))).))))))))).)))).}|..........|||.|||(((((((((((..(((((((((((........))))).(((((.(((.(((...((((..((((..,{(((((((((..(((.((((...,,.....,((((({(((.{{(((((.{({(((.{(.(,{{{,{{{((((((,,({(,(((..((((.....))))..|||.|||{((((((...)))))},|||||.,,}..{{,,..,,|||{,,(((.....))}.,)}))||,,|})),.,|{{{,((({{((,((.{({(({.,((({{{(((,.,(({{{{{(((,(((((..(((((((....}))))))...,(((({{((((.({(({...,,}}}}|||||||...,,..,,((((((,,,,,}||}|{{(...((({{((((,,(,(({(({{((((((((((({{{{(((((((((((((((((((.{(.........,..}}.((((((....(((((..(((((..(,({.((.(((.(.....((.....))....).))).)).)),,))))).))))).)))))).)))))))).)))))).,|)))}..||||,,,,.,...,,,,..,{{{{{{((....{{.{{{..,.||||}.,,.}|}}}|||{{||,|||,,|||||||{{,...........,((((,.,|{..((((.....)))){|,((((..(((((,,,((((.((,,,,..}}.|}}}}}))}.)))).}..{{{.....}}},.,{{{{{{{{|...,}))))))))))}}|||...{{{,.....,))},(((((..,{{{{{{{{.,.,{{,{.({({((((.{{{{{|.,,,,}}}}},,.||||||.....|||{||{,}||||||||,{,{(((.,,,,.,((((((....({(,,,,,(((({((.,,,,|||||}}||,.,,}||}}|,,|||}((({((,,,,.,,|||||}(((((....}}))).}}}))...||.}}}}}}|||||||{||..}}||||,.....{{{.,{...,,)).}}|,{{(((((((((({.((((....))))........{{(((((....,,,,)}}}}})))))))))))..}}))))))))))}}..}))})),..}}}))),))),))))}}},,}}}|)},}}}}.}}}}))))}))}))))..}}))))))},))),}}.}|||}}}}}.)))),.....{(((,,,,,..}}}}...))))),}}}}.}},)),})),,))),,.,))))},{(((((((((.....)))))))))}.....,,,,.(((,,,..|||{(((((((...}))))}}|{{((((((({((((({{||,.......,{(((.,....,}))))......,,.((((((((..((((((...((.((((.........)))).))..))))))..))))))))....{{{{{(((,,{(((.{{,,,||}||||{(((,.((((({(({.((.(((((((((((((.....))))))))...))))).)))))),.})))).{{{,||,..|,,}},......((((((((((.....))))))))))..........,,)))))}..})).}}}}})}}}..))))))}}(((((((((.((.((((((((..((((...{{...(((((.....)))))(((((...(((.(((...((((.((((.(((((..((((..((({(((((...)))))....((((........))))..............((((((((((((({(((((.,....}))))}......(((((((((({{....}}.....)))))))))).,,{(((.((.((((((((((....))))))).))).)).))){{{|.,...{{(((.{{({...}})),..)))))}}}......{(((((((((((((....,,,{..|{||((({|||.,.|||}}}.}|},,||,..(((((((....))))))),||,}}},}})||,(({{{{.,.|||,,..))))}))))).,,,,,,.})),)))))),})))).....}.)))))),})))))).............}))).))))..)))))))))))))..)))...)))...)))))..,{.,{{....,,.,.,,,,)}...)))).)))))))).))..)))))))))...,{(((,,,,...})))}....|(((.((((....)))).))))))))))..}))))))))))))})),|||,(((((((.....(((((((.,....((((......))))..,.))))))).)))))))..)))}}}},,)}})),)))|)))|..}||.,|||||||||||||,,,((((,.{((((........,,,,...))))|,,|}}}}.,}}),,))))))},,},{{{{{{{.......,{,,}}}}}},.{{,{{{{{{.{((((((((((..{(((.(({...,,...{{{{..{|.,{{{|,||,,}}}..{||||||||||{{{||{,|||||||}}.,,,}}|,||,,.,,..,,}})))}}},...,.{(((((({....,{{|,{((,..{{(,,....))}..}}}}}}......,)))))))}..},,,...,,,,,..}),)))}...,,...}}))))).))))))))))),))}))}.|||(((((((.......,...}))))))..,,...(((((....)))))(((({{.,,{(((({(((,,,({{{{{{,.{(({,,....,...,|||||))}},})},}}}}}}}})}}}|}})}}}}}||}}.,,{{..}))))}}}||||.....((({((((.....,,...(((((((((..........)))))))))..))).))))).||,}}})}{({(({{,.|||}|...,||||}},{||}..{||..,{{({{..|,((...,))|,.}|}},{,{|||...((((........))))..,,}}|}}}},,,,,......}}}}}}}}},,}||{|}.||}}}}(((.....}}}.....{{(.(((......((((((..(((((((.{.....,}.)))))))....))))))..((((((({((((,(((((....((.((((((((.....(((((((((((((((,.......(((((((((..(((((,(((({....{((....,,...,..,,,.,..})}}}|.((((((.......))))))......((((.(((((((((((((........,.((((((.(((((((....((((((((((({,..,..,{(((((.((((((((((((.(((((,...((((({...,))))).......(((((({{.{(,..{(({(.((.....))..})))......(((((((((....(((({{({........))})}}},}..{(((((......)))))}....{((((...))))).,...{((({...})))).(((....))).|||...))))))))))))..,,)},)))))})).........,||,{{{{(....{{{.((((....))))...}}}))))}.....(((((({....})))))).,(((,,,.,,,.,,,||,(((((((((.(((.((((((.....{.((((((...)))))),,..{{{.,...,|},...,})),,...)))))).))).))))))).}}.}}.....)}))))).)))))),.,))))).....})))).}}...{((((.....{.{((,{.(((.{......).)})}}}),}.}},)))))))).))))))))................))))))).)))))).......((((((((((.((((((((((..{(((((((({...,{(((...,,,,...{{{,......}}..,,,|||||.,,|,{|||||..{||{,||,{|||.}}},.|||}.|||.}})),}))))}(((,,{{{...,}},,..|}})))}}))))).......,,,,.{||{|....|||........}}))}},......,,.,||{|{{||,.,||||||{.{(((,((,,((({{....||,.{((,.....,,,,..}}..)))))..}}}},)))).})))))).,,,.,)))}}.))).,)))))).))))))))))...{(((...(((((({...}))))))...))))......(((.......)))))))....)))).)))))}}))|}(((.(((({....})))))))....,(((..{(((((((..{{.(((.(((((.(((((((((.(((......(((..(.(((((((.({.(((....))).}}.))))))).)..)))...))).))).))))}}).)))))))).})...,)))))))))))..{(((({...,.}}}))).(((((.((({((({....((((((((...(((..((((((..(((.{((.....(((((({{..,.((((.....)))).)))))))).,.{(((....))))..........,}})))..)))))))))...)))))},))..}},}))}}))))))).((((((....)))))),,,,...})))).))))))))),.))))))))))),(((((((((...,,,,)}}}))))|(((.....)))|.(((((((((((....)))...)))))))).,..{(((((,...}}}}}}.,.......))))|.,....{{{{{{..,.,,..)))))),,.,..)))))))).))))))).,})))..(((((({...})))))).{({{{{{{.....,,....,(({((.{(({{{((((,,,||||.|,}}}...,}))}}|||.,,{{{,..(((((({...,,,,,.,,..||}}}},{{||,{||...|||||..((,.,,,.......,,,,((((((.((((..........)))).)))))).}},....,...},,,|.||{{|,}}..,))}.|......,,...)}))})))...((((((...)))))}}})))}}|((((((({......})))))))},,)})))}},|||||}}..)))}}}}})})},},,.,,,})}...)))).)))..))))))))).,,.....)))),.)))).))).))).))))).))))))))))....)))))))}},,,....))}))}..}}}}})}}))}}|}))),.)|})))))))))))))).)))),.(({{.,...))))((((.((((,,..(((.|.....,.))).,.)))).})))|,,..}))).)).)).)))).))))))))))....,....)))..)))))))))))),,....{{(,{,,{.|||.(((((.(((((((((............))))))))).(((((....))))).....((((({((.((.....))))))))))))))||{({{..,{|{|,||||,|{({(((((,(((({..,{,(((((.,,((((...(((..(((.....))).})).}}}}.,,.,}}|||}}}}}})})||}}}.||,,||{,,{{||,|,,,,,..|||.,,|{|||||,,|}.})}}|))}..,...,{,||||||{{{{{{,,.{(((({{({{{{{{{,,..,{{{{{{{({{,,,...{{(((((,,,(((({{{{,,,.....}}}))))}..,,)))))..)}))))){(((((((((.{(,{{{((((....}))),}),}}}.})))|...))))},,....,,..,{,.,......{((({..((((((((((((((.((,......,)).)))))))))))))).))))}.{((({..{((((((((((.....)))..))))))))))))((((.....{{{,{..,{{.(((((((((((({...})))).))))))))),.,))),,...))))}||}}}{|{((({{{{{({|{{{(((((..(((((((((({{..,,..,{{(({{,|...{{..((((((((((.,,({,.((((((((............({(((,(((((.(((((((((((((({(((((..((((((,,,,.{(({(.,,..,||)}}},(((((.(({.....})})))))....,|,.{{{|...}))).|{(((((((((...((.((..(((((((...((((......)))).....)))))))..)).)))))))))))}....((((((((((((((((...(((.(((((({({........})},})))))..)))...))))..{{{(....))}}(((((.((((((......)))))).)))))))))))))))))),...{((((.....))))}.........,{{(((((.............))))))},..}))))).))))).}.))))))))))))))))))).,,)))))))))))))..)),)))))))))))}...........,,,}},,...,...(((((((......)))))))..)))))).)))..)))||(.((((((....)))))).)},.|||||({.,,,,}|}|}}||||,,..|({|...{{|||{{|||}}.,,,,,}})))))))}}.}}},,||.((((((.(((...{(((((((...(((((((..(({((,,((((((((((((((...........(((.((({...}))).)))...))))).))))))))}..|||,....(((((((((((.......,(((((......,..)))))|,,......,},{{(((..((((((({(((({(({.(({..(({...})).))).}))|{{{(((({{{{(((({{{.{{{{((({,(((((((.......)))))))}..,.((((((((,...,))))))))..{{{{.{{{{,,,,|||},||||,,.||||...{|||}.})))))).,,,,.,,,)))))})))},}}}...}))))).)))))))...))))}.)))))))))))...,}},,,,,,{{,.{(((.....))))}}.....,,))))),.))))))))))))))).))}.)))))).,,,}||||}||,.,}}}}))),.)))},.....,,|||||,}}},,}}}}}.}})))}})}}))))))},||})}},}},(((((((((...,,.((....(((((((((((((({{.{{..,(((({(({{{,{..,{{{{,..(({,,,,|||{{{...(((((...))))},{|....,}.,(((((((((({....)))))))))))|{{..{,.,,,,,)),,))},,,.}||||},,,,.))},,,|||}},..},,)))).)))),})))),})))))))....)),,)))))))))||||,,,,...,))))..,,}}}}}..,||}|,}},((((((.(((((((((.{(((.((((((.....((((.,{(({....})))...))))...)))))).)))....,.,}))}}))))).)))))).,},,,))))))((((((.{{.(((((((((((.,{{{.{{.,,)),)))|,,.,,|}}}}}.)))}))).))))))...((((((...,.........))))))............

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001363540.2 NCBI
GAAUCAGAACAAUGACUGCGCCGCCGGGUACCCGGGAGCGCGUCGGAGG… 8353 nt 0.4390
NM_014705.4 NCBI
GAAUCAGAACAAUGACUGCGCCGCCGGGUACCCGGGAGCGCGUCGGAGG… 8326 nt 0.4391
Summary

This gene is a member of the dedicator of cytokinesis (DOCK) family and encodes a protein with a DHR-1 (CZH-1) domain, a DHR-2 (CZH-2) domain and an SH3 domain. This membrane-associated, cytoplasmic protein functions as a guanine nucleotide exchange factor and is involved in regulation of adherens junctions between cells. Mutations in this gene have been associated with ovarian, prostate, glioma, and colorectal cancers. Alternatively spliced variants which encode different protein isoforms have been described, but only one has been fully characterized. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.