Basic Information

Symbol
DOCK7
RNA class
mRNA
Alias
Dedicator Of Cytokinesis 7 KIAA1771 ZIR2 Dedicator Of Cytokinesis Protein 7 EIEE23 DEE23
Location (GRCh38)
1:62454298-62688464
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses Forensic psychiatry evaluation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001367561.1
Sequence length
7233.0 nt
GC content
0.4124

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1903.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2049.96 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2197.67
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001271999.2 NCBI
AGGUCCGGAGCCCGGACUGGCGGAGGCCGCGAGGGAGGGAGCACGAGCG… 7200 nt 0.4118
NM_001272000.2 NCBI
AGGUCCGGAGCCCGGACUGGCGGAGGCCGCGAGGGAGGGAGCACGAGCG… 7113 nt 0.4107
NM_001272001.2 NCBI
AGGUCCGGAGCCCGGACUGGCGGAGGCCGCGAGGGAGGGAGCACGAGCG… 7107 nt 0.4103
NM_001272002.2 NCBI
AGGUCCGGAGCCCGGACUGGCGGAGGCCGCGAGGGAGGGAGCACGAGCG… 2699 nt 0.4001
NM_001330614.2 NCBI
AGGUCCGGAGCCCGGACUGGCGGAGGCCGCGAGGGAGGGAGCACGAGCG… 7206 nt 0.4122
NM_001367561.1 NCBI
AGGUCCGGAGCCCGGACUGGCGGAGGCCGCGAGGGAGGGAGCACGAGCG… 7233 nt 0.4124
NM_033407.4 NCBI
AGGUCCGGAGCCCGGACUGGCGGAGGCCGCGAGGGAGGGAGCACGAGCG… 7140 nt 0.4109
Summary

The protein encoded by this gene is a guanine nucleotide exchange factor (GEF) that plays a role in axon formation and neuronal polarization. The encoded protein displays GEF activity toward RAC1 and RAC3 Rho small GTPases but not toward CDC42. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2012]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the DOCK7 was identified as a hub gene associated with synaptic plasticity during the addicting phase of nicotine self-administration in the ventral tegmental area [Fan et al. DOI:10.1016/J.Jgg.2024.08.009].