Basic Information

Symbol
DOCK8
RNA class
mRNA
Alias
Dedicator Of Cytokinesis 8 ZIR8 Dedicator Of Cytokinesis Protein 8 FLJ00026 FLJ00152 FLJ00346 Epididymis Luminal Protein 205 1200017A24Rik HEL-205 HIES2 MRD2
Location (GRCh38)
9:214854-465259
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry-related diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_203447.4
Sequence length
7448.0 nt
GC content
0.4843

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2380.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2513.04 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2489.36
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001190458.2 NCBI
GCCAUUUUGUCUCCUGUAACAAUUUACGCGCCGUGUAACUGUGAAUCUU… 7139 nt 0.4782
NM_001193536.2 NCBI
GCCAUUUUGUCUCCUGUAACAAUUUACGCGCCGUGUAACUGUGAAUCUU… 7235 nt 0.4791
NM_203447.4 NCBI
GACAGACGAGGUUUGCGCUUGGCUGGGCAUGUUCCGCGGCUACUCUGCG… 7448 nt 0.4843
Summary

This gene encodes a member of the DOCK180 family of guanine nucleotide exchange factors. Guanine nucleotide exchange factors interact with Rho GTPases and are components of intracellular signaling networks. Mutations in this gene result in the autosomal recessive form of the hyper-IgE syndrome. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described.[provided by RefSeq, Jun 2010]

Forensic Context

A study in humans using single-cell/nucleus RNA sequencing of carotid atherosclerosis and Alzheimer's disease datasets identified DOCK8 as a marker for manual annotation of microglia clusters in the AD dataset [Weiqi Xue et al. DOI:10.3233/JAD-230559].