Basic Information

Symbol
DOCK8
RNA class
mRNA
Alias
Dedicator Of Cytokinesis 8 ZIR8 Dedicator Of Cytokinesis Protein 8 FLJ00026 FLJ00152 FLJ00346 Epididymis Luminal Protein 205 1200017A24Rik HEL-205 HIES2 MRD2
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry-related diagnoses

MANE select

Transcript ID
NM_203447.4
Sequence length
7448.0 nt
GC content
0.4843

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2380.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2513.04 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2489.36
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
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GCCAUUUUGUCUCCUGUAACAAUUUACGCGCCGUGUAACUGUGAAUCUU… 7235 nt 0.4791
GACAGACGAGGUUUGCGCUUGGCUGGGCAUGUUCCGCGGCUACUCUGCG… 7448 nt 0.4843
Summary

This gene encodes a member of the DOCK180 family of guanine nucleotide exchange factors. Guanine nucleotide exchange factors interact with Rho GTPases and are components of intracellular signaling networks. Mutations in this gene result in the autosomal recessive form of the hyper-IgE syndrome. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described.[provided by RefSeq, Jun 2010]

Forensic Context

A study in humans using single-cell/nucleus RNA sequencing of carotid atherosclerosis and Alzheimer's disease datasets identified DOCK8 as a marker for manual annotation of microglia clusters in the AD dataset [Weiqi Xue et al. DOI:10.3233/JAD-230559].