Basic Information

Symbol
DOCK9
RNA class
mRNA
Alias
Dedicator Of Cytokinesis 9 ZIZ1 KIAA1058 Cdc42 Guanine Nucleotide Exchange Factor Zizimin-1 Dedicator Of Cytokinesis Protein 9 Zizimin1 Zizimin-1
Location (GRCh38)
13:98793429-99086625
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001366683.2
Sequence length
7631.0 nt
GC content
0.4554

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2253.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2402.47 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2345.95
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001130048.2 NCBI
AGGCUCUGCAGACCCAGCCAGCGGGGCUGACCACUUGUGCCUGGGAAGC… 7681 nt 0.4574
NM_001130049.2 NCBI
ACCCCGCCCCGAGGAGGCGGCCCGGCGAGUGGUCGCCGAGGGAGGCUGG… 4267 nt 0.4961
NM_001130050.2 NCBI
AGGCUCUGCAGACCCAGCCAGCGGGGCUGACCACUUGUGCCUGGGAAGC… 4076 nt 0.4642
NM_001318849.2 NCBI
ACCCCGCCCCGAGGAGGCGGCCCGGCGAGUGGUCGCCGAGGGAGGCUGG… 7803 nt 0.4729
NM_001366676.2 NCBI
AGGCUGUUGAGCAGGAGCGGAUUCUAGUACGGCAGCUCAGAGCUUCCCU… 7670 nt 0.4512
NM_001366677.2 NCBI
AGGCUGUUGAGCAGGAGCGGAUUCUAGUACGGCAGCUCAGAGCUUCCCU… 7632 nt 0.4499
NM_001366678.2 NCBI
AGGCUGUUGAGCAGGAGCGGAUUCUAGUACGGCAGCUCAGAGCUUCCCU… 7739 nt 0.4534
NM_001366679.2 NCBI
AGGCUCUGCAGACCCAGCCAGCGGGGCUGACCACUUGUGCCUGGGAAGC… 7574 nt 0.4539
NM_001366680.2 NCBI
AGGCUCUGCAGACCCAGCCAGCGGGGCUGACCACUUGUGCCUGGGAAGC… 7538 nt 0.4541
NM_001366681.2 NCBI
AGGCUCUGCAGACCCAGCCAGCGGGGCUGACCACUUGUGCCUGGGAAGC… 7736 nt 0.4573
Showing 1 to 10 of 14 entries
Summary

Enables cadherin binding activity. Predicted to be involved in positive regulation of GTPase activity and regulation of Rho protein signal transduction. Located in membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the mRNA of the DOCK9 was one of six candidate biomarkers whose expression levels in cardiac tissue showed a significant correlation with the early postmortem interval at both 25°C and 35°C, though with a lower coefficient of determination than the primary marker Cdc25b [Tao et al. DOI:10.1016/j.legalmed.2018.09.004].