Basic Information

Symbol
DOHH
RNA class
mRNA
Alias
Deoxyhypusine Hydroxylase HLRC1 HEAT-Like (PBS Lyase) Repeat Containing 1 Deoxyhypusine Hydroxylase/Monooxygenase HEAT-Like Repeat-Containing Protein 1 Deoxyhypusine Monooxygenase Deoxyhypusine Dioxygenase EC 1.14.99.29 MGC4293 HDOHH NEDMVIC
Location (GRCh38)
19:3490821-3500936
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001145165.2
Sequence length
1763.0 nt
GC content
0.6846

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-862.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -890.34 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 504.14
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001145165.2 NCBI
GAGAAAAUGGCGGCCCCCAGACCGCACUGCGGGCGUCGCGGCAGGUGAA… 1763 nt 0.6846
NM_031304.5 NCBI
GAGAAAAUGGCGGCCCCCAGACCGCACUGCGGGCGUCGCGGCAGGUGAA… 1791 nt 0.6857
Summary

This gene encodes a metalloenzyme that catalyzes the last step in the conversion of lysine to the unique amino acid hypusine in eukaryotic initiation factor 5A. The encoded protein hydroxylates deoxyhypusine to form hypusine in the mature eukaryotic initiation factor 5A protein. Alternative splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, Feb 2009]

Forensic Context

A study in humans identified the DOHH as a hub gene within the sky-blue co-expression module in platelets from patients with non-ST-segment elevation myocardial infarction (NSTEMI), where it was significantly associated with energy metabolism pathways [Zhang et al. PMC8129354].