Basic Information

Symbol
DOK3
RNA class
mRNA
Alias
Docking Protein 3 Downstream Of Tyrosine Kinase 3 FLJ22570 Dok-Like Protein DOKL
Location (GRCh38)
5:177501904-177511274
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001308236.3
Sequence length
3588.0 nt
GC content
0.6034

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1453.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1513.90 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 794.66
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..((.((((...(((((....((.(.((((((((((((((....)))))))(((((...))))).(((((.....((((((((((((((..((((((.(((((((((.(((((((.....((((((....((......((((((...(((((.......((((((........))))))......)))))....))))))......)).)))))).........((((((...(((((....))))).....)))))).((((((((((((((((((.....))))..)))))))((((((((((..(((((((((((((...(((..(((((((.(((.((((((.((.(((.(((((.(((((.(((((.(((((((..(((......(((.....)))((((((((((((((((...(.(((((.(((((.((((....))))((....))...((((.(((((((.(((((((.((((((.((..(((......((((((..((((((((((.((((((((..((((((...(((.((((((((((((((.......)))))))))..((((((.(((......((...(((((((....(((((((((((..((.((((((.............))))))))((((((((((((((.(......((((((((.(((....)))..)))))))))))).((((((((.((((((((((((.((....)).)))))(((.(........)))).(((..(((...))).))).))))).)).))))))))....)))))))))))...(((((((((....((((((.(....).)))))).))))(((.((((((.((.(((((((((.((((((...(((..((((....(((((((.........))))))))))).))).)))))).)))))))..)).)).)))))).))).)))))))))))))))).((((.((.....))...)))).........((.((((..((....))..)))).))...))))))))).....)))))))))........(.(((((........))))).)((((((((((.((((((((((..((....))))))).((........)).))))).))))))))))(((((....)))))..))).)).))).)))))))))))).........(((...)))...))))).))))))).))))))......))))).))))))))....))))).)...)))))).))))))))))))))).))))..)))))..............))))))).)))..))))))).))))).)))...(((((.((.((((((((((((((((....(((.((((((((((..((((.((((((((..((((..((((.((....))))))......))))...(((((.(((((((((.(.((((..(((.(.(((((......))))).)..)))..)....)))).))))))...))).)))))((((..(((((.((((.......((((((((((((((..((((((.........))))))((((........)))))))))))))(((((((.........))))))).))))))))).)))))..))))....)))))))).........(((........))).........((((......))))...(((((((((.............)))))))))..(((.....)))((........))..))))..)))))))))).)))...))))..)))))))))..((((.....(((((......))))).)))).(((((((..(((((.....((((.(((((.....(((((..((.(((..((((((.(((((((((((((.((((((.((((((...(((.((((.......)))))))(((.((((.(((((......(((.(...(((((((((((((((((((((((...(((((((((((.(((((((....((((....(((.....)))))))....))))))).))))))..............(((.((((....)))).))))))))((((((((.........((....(((((((((....((((.(.(((((((.......))))))).).((((((((((((......((((((...))))))((((((.((((.(((..((((((.......))))))((((((.((((......)))).))))))..(((((((.....)))))))))))))).))))))......(((...((((((((.......)))))))).))))))))).))))))((((.((((...))))..))))((((.((.........(((.((.......)).))).......)).)))))))).....((((((....)))).))..............))))))))).....)).........)))).)))).)))))))))))).((((......)))).((((((......((((((..(((........)))))))))........))))))..))).)))))))))))).....)))))..))))))))))))).)))))).)))).))))).)))).))).))).)))))..)))))))))).(((...((((.((((((.(((((......(((((((((...((((....)))).................((((.....)))).............)))).)))))((((.....))))....((((....(((((((...)))).)))...)))).....(((......)))....((((((....((((((......))))))..))))))...))))))))))).)))))))........))))......))))).))))))).....((((.......))))...))).))))))).((((....(((((((....((.........)))))))))))))......)).)))))))).))..)))))).)))...))))))))))..)))).)))))))))....))...))))).)))................))))))).....)))))))))))))))))))))).)))))))))))))).......)))))...((((.((...)).))))..(((......)))........))))))).)))........................((((....)))).(((((...)))))........((((((....((((.((((..........)).)).))))....)))))).))))).)))).))..)))..((((((..........(((((((((...............................((((.......))))....(((((.(.....).)))))...(((((((((..(..(((((((........))))))).......)..))))..))))).....((((....)))).....)))))))))....)))))).......................
Thermodynamic Ensemble Prediction
,((..((.((((...(((((....((.(.((((((((((((((....)))))))(((((...))))).(((((.....((((((((((((((..((((((.(((((((({{(((((((.....,,((((,.,{((......((((((..,(((((....,..((((((........))))))..,...)))))....))))))......,.,))}))),,.,.,,..((((((.,.(((((....))))).,...)))))).((((((({((((({((((.....}))).,))))))}|{{((((({{..(((((((((((((...(((..(((((((,(((,,(((((.((.(((.(((((.(((((.(((((.(((((((..(((,,.,..{{|,,,.,))}((((((((((((,(((,..(.(((({{(((((.((((....)))){(....)}...((((.((((((,.(((((((.((((((.((..{((......((((((.,{((((((((((((((((((..((((((,,.(((.{,((((((((((((.......)))))))))..((((((.(((...,.,({...(((((((,,,.(((((((((((..,{.((((((.............))))))||((((((((((({{(.{......((((((((.(((....)))..)))))))),})).((((((((.((((((((((((.((....)).)))))(((.{........)))).(((..(((...))).))).))))).)).))))))))....))))))))))).,,(((((((({....((((((.(....).)))))).))))(((.((((((.((.(((((((((.((((((...(((..((({...,(((((((.........))))))))))).))).)))))).)))))))..)).)).)))))).))).)))))))))))))))).((((,((.....}}.,.)))).........({.((({..((....,},,)))),)),,.))))))))}.....)))))))))........{.{{{||.....,,,|||||{.((((((((((.((((((((((..((....))})))).((........)).))))).)))))))))).,{||..,,).))),}))).}).))),))))))))))))...{,,...|||...}}}...)))}),))))))).))))))......))))).))))))))....))))).}...)))))).))))))))))))))}.,))}.,)))))..............))))))).)))..))))))).))))).)))...(((((.{{.{((({{({((((({(({((,,{{|||||.|||||.,(((({(({((((.{{(({{{{||{{{.,.||||||.((((.(((((....(((((.{.(((({((..,,,.,.,))}}.}}.}))))))))).))))).)))),)})})),..)}}),||||,.{|||||{(((.((((((.....)))))))))){(((((((((((((({,((({{{...,,.,.,)))))),||({((({....))))))}}}}}|(((((((.........))))))),,|||,((((({....{{|.,{((({(((.,,,|,,.,,....((((((((...(((.{,.......((((((((((((,((((((((((((.............)))))))))...{{.....}}((((.......,(({{{((((((.........))))))))))...))))))....((((.....(((((......))))).}..))))......)))(((((..{(....,}}.))))})))))))))...))).{{((((.(((((((((((((.((((((.((((((.{,({,.{{{|.......}}}},,|((({(({{.(((((......(((.{...(((((((((((((((((((((((..{((({(((((((.(((((((....((((....(((.....)))))))....))))))).)))))),....,,,,,....,{({({(({{{.|(((((...)))))|{{{{,{,.,..,,,|||,,,.|||{|{|{|..,.||||.|}||||(((,,.....}}})})}.},((((((((((((,.....((((((...))))))((((((.((({,(((..((((((.......))))))((((((.((({......}))).))))))..(((((({.....)))))))))))))).))))))......(((...((((((((.,....,)))))))).)))}}}))),)))))){{{{,(({{...|||}..}}}}.|||,,||........|||.,,.....,{||.|||.,,......})))}....}}|}.{,{{{{....)))).||,,,...........}}}}}}}}),,,}..{{{........,)))}))}.))))))))))))}((((......)))).((((((....{.((((((..(((,.....,.)))))))))........))))))..,)).))))))))}))}.....))))).,))))))))))))).)))))).))))},)))).)))).))),}},...(((((((,...{((({{,....,))),}}},)))))))...}}.))).)))))))).((((....))))..|||............((((..{{{{(({,,...........)})},.|))}||||...,})))}....{.|,..,}}}},.,..)))))))))))....)))))}.}||..||||||||,..((((((....((((((......))))))..)))))).}})))},))),}},,)))))}..}))))..|,}},}}})),))))})))}},..,..(({{.......))))..{|||.},))))}.||||}}}}{{{{{{{,,,.((,,,........}}}))))),)),.....)).)))))))).)),,))))}).))),},))))))))))..))))))))))))))....))...}}))).}}},...............))))))).....)))))))))))))))))))))).)))))))))))))}.......)))))...{(({.{,...,},))}},.{((......))}........))))))),})}........................{(({....}})).(((((...)))))........((((((....((((.{{{{..........}}.}}.))))....)))))}.))))).)))).))..))|((((.((((({.......,{{.((((.,,.,,.,,....,,,,,,.............((((.......))))....{((((,{.....,.)))))...{((((({(({,...(((((((........))))))).....,}},.})),.,))))).....{{{{....))))}},.,)}))),)}..,,.)))),},........})))}}.}}}}...

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001144875.2 NCBI
AUUCAGGGCUGUGGGUCCCAUGUGGACUGGAUGCCCAGCGUGAGUGUAU… 2311 nt 0.5720
NM_001144876.2 NCBI
AUUCAGGGCUGUGGGUCCCAUGUGGACUGGAUGCCCAGCGUGAGUGUAU… 2087 nt 0.5549
NM_001308235.3 NCBI
AUUCAGGGCUGUGGGUCCCAUGUGGACUGGAUGCCCAGCGUGAGUGUAU… 3771 nt 0.6049
NM_001308236.3 NCBI
AGACGCGCGUGCCCAGCUGAACCAGGUGCGUGAGAAGGCUGCCUUCAGG… 3588 nt 0.6034
NM_001375794.1 NCBI
AGACGCGCGUGCCCAGCUGAACCAGGUCUUGAAGCGGCGGCCCUGCUCC… 3462 nt 0.6020
NM_001375795.1 NCBI
AUUCAGGGCUGUGGGUCCCAUGUGGACUGGAUGCCCAGCGUGAGUGUAU… 3661 nt 0.6026
NM_001375796.1 NCBI
AUUCAGGGCUGUGGGUCCCAUGUGGACUGGAUGCCCAGCGUGAGUGUAU… 3579 nt 0.6024
NM_001375797.2 NCBI
AUUCAGGGCUGUGGGUCCCAUGUGGACUGGAUGCCCAGCGUGAGUGUAU… 3633 nt 0.6017
NM_001375798.1 NCBI
AUUCAGGGCUGUGGGUCCCAUGUGGACUGGAUGCCCAGCGUGAGUGUAU… 2393 nt 0.5733
NM_001375799.2 NCBI
AAGCUCUCCCUAAGCCUGCUCUGUGCCCAGCUCUGCUGAGCUGUGAGGA… 2471 nt 0.5710
Showing 1 to 10 of 14 entries
Summary

Predicted to be involved in Ras protein signal transduction and cell surface receptor protein tyrosine kinase signaling pathway. Predicted to be located in ficolin-1-rich granule membrane and plasma membrane. Predicted to be active in cytoplasm. Implicated in colorectal adenocarcinoma. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.