Basic Information

Symbol
DOK3
RNA class
mRNA
Alias
Docking Protein 3 Downstream Of Tyrosine Kinase 3 FLJ22570 Dok-Like Protein DOKL
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_001308236.3
Sequence length
3588.0 nt
GC content
0.6034

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1453.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1513.90 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 794.66
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..((.((((...(((((....((.(.((((((((((((((....)))))))(((((...))))).(((((.....((((((((((((((..((((((.(((((((((.(((((((.....((((((....((......((((((...(((((.......((((((........))))))......)))))....))))))......)).)))))).........((((((...(((((....))))).....)))))).((((((((((((((((((.....))))..)))))))((((((((((..(((((((((((((...(((..(((((((.(((.((((((.((.(((.(((((.(((((.(((((.(((((((..(((......(((.....)))((((((((((((((((...(.(((((.(((((.((((....))))((....))...((((.(((((((.(((((((.((((((.((..(((......((((((..((((((((((.((((((((..((((((...(((.((((((((((((((.......)))))))))..((((((.(((......((...(((((((....(((((((((((..((.((((((.............))))))))((((((((((((((.(......((((((((.(((....)))..)))))))))))).((((((((.((((((((((((.((....)).)))))(((.(........)))).(((..(((...))).))).))))).)).))))))))....)))))))))))...(((((((((....((((((.(....).)))))).))))(((.((((((.((.(((((((((.((((((...(((..((((....(((((((.........))))))))))).))).)))))).)))))))..)).)).)))))).))).)))))))))))))))).((((.((.....))...)))).........((.((((..((....))..)))).))...))))))))).....)))))))))........(.(((((........))))).)((((((((((.((((((((((..((....))))))).((........)).))))).))))))))))(((((....)))))..))).)).))).)))))))))))).........(((...)))...))))).))))))).))))))......))))).))))))))....))))).)...)))))).))))))))))))))).))))..)))))..............))))))).)))..))))))).))))).)))...(((((.((.((((((((((((((((....(((.((((((((((..((((.((((((((..((((..((((.((....))))))......))))...(((((.(((((((((.(.((((..(((.(.(((((......))))).)..)))..)....)))).))))))...))).)))))((((..(((((.((((.......((((((((((((((..((((((.........))))))((((........)))))))))))))(((((((.........))))))).))))))))).)))))..))))....)))))))).........(((........))).........((((......))))...(((((((((.............)))))))))..(((.....)))((........))..))))..)))))))))).)))...))))..)))))))))..((((.....(((((......))))).)))).(((((((..(((((.....((((.(((((.....(((((..((.(((..((((((.(((((((((((((.((((((.((((((...(((.((((.......)))))))(((.((((.(((((......(((.(...(((((((((((((((((((((((...(((((((((((.(((((((....((((....(((.....)))))))....))))))).))))))..............(((.((((....)))).))))))))((((((((.........((....(((((((((....((((.(.(((((((.......))))))).).((((((((((((......((((((...))))))((((((.((((.(((..((((((.......))))))((((((.((((......)))).))))))..(((((((.....)))))))))))))).))))))......(((...((((((((.......)))))))).))))))))).))))))((((.((((...))))..))))((((.((.........(((.((.......)).))).......)).)))))))).....((((((....)))).))..............))))))))).....)).........)))).)))).)))))))))))).((((......)))).((((((......((((((..(((........)))))))))........))))))..))).)))))))))))).....)))))..))))))))))))).)))))).)))).))))).)))).))).))).)))))..)))))))))).(((...((((.((((((.(((((......(((((((((...((((....)))).................((((.....)))).............)))).)))))((((.....))))....((((....(((((((...)))).)))...)))).....(((......)))....((((((....((((((......))))))..))))))...))))))))))).)))))))........))))......))))).))))))).....((((.......))))...))).))))))).((((....(((((((....((.........)))))))))))))......)).)))))))).))..)))))).)))...))))))))))..)))).)))))))))....))...))))).)))................))))))).....)))))))))))))))))))))).)))))))))))))).......)))))...((((.((...)).))))..(((......)))........))))))).)))........................((((....)))).(((((...)))))........((((((....((((.((((..........)).)).))))....)))))).))))).)))).))..)))..((((((..........(((((((((...............................((((.......))))....(((((.(.....).)))))...(((((((((..(..(((((((........))))))).......)..))))..))))).....((((....)))).....)))))))))....)))))).......................
Thermodynamic Ensemble Prediction
,((..((.((((...(((((....((.(.((((((((((((((....)))))))(((((...))))).(((((.....((((((((((((((..((((((.(((((((({{(((((((.....,,((((,.,{((......((((((..,(((((....,..((((((........))))))..,...)))))....))))))......,.,))}))),,.,.,,..((((((.,.(((((....))))).,...)))))).((((((({((((({((((.....}))).,))))))}|{{((((({{..(((((((((((((...(((..(((((((,(((,,(((((.((.(((.(((((.(((((.(((((.(((((((..(((,,.,..{{|,,,.,))}((((((((((((,(((,..(.(((({{(((((.((((....)))){(....)}...((((.((((((,.(((((((.((((((.((..{((......((((((.,{((((((((((((((((((..((((((,,.(((.{,((((((((((((.......)))))))))..((((((.(((...,.,({...(((((((,,,.(((((((((((..,{.((((((.............))))))||((((((((((({{(.{......((((((((.(((....)))..)))))))),})).((((((((.((((((((((((.((....)).)))))(((.{........)))).(((..(((...))).))).))))).)).))))))))....))))))))))).,,(((((((({....((((((.(....).)))))).))))(((.((((((.((.(((((((((.((((((...(((..((({...,(((((((.........))))))))))).))).)))))).)))))))..)).)).)))))).))).)))))))))))))))).((((,((.....}}.,.)))).........({.((({..((....,},,)))),)),,.))))))))}.....)))))))))........{.{{{||.....,,,|||||{.((((((((((.((((((((((..((....))})))).((........)).))))).)))))))))).,{||..,,).))),}))).}).))),))))))))))))...{,,...|||...}}}...)))}),))))))).))))))......))))).))))))))....))))).}...)))))).))))))))))))))}.,))}.,)))))..............))))))).)))..))))))).))))).)))...(((((.{{.{((({{({((((({(({((,,{{|||||.|||||.,(((({(({((((.{{(({{{{||{{{.,.||||||.((((.(((((....(((((.{.(((({((..,,,.,.,))}}.}}.}))))))))).))))).)))),)})})),..)}}),||||,.{|||||{(((.((((((.....)))))))))){(((((((((((((({,((({{{...,,.,.,)))))),||({((({....))))))}}}}}|(((((((.........))))))),,|||,((((({....{{|.,{((({(((.,,,|,,.,,....((((((((...(((.{,.......((((((((((((,((((((((((((.............)))))))))...{{.....}}((((.......,(({{{((((((.........))))))))))...))))))....((((.....(((((......))))).}..))))......)))(((((..{(....,}}.))))})))))))))...))).{{((((.(((((((((((((.((((((.((((((.{,({,.{{{|.......}}}},,|((({(({{.(((((......(((.{...(((((((((((((((((((((((..{((({(((((((.(((((((....((((....(((.....)))))))....))))))).)))))),....,,,,,....,{({({(({{{.|(((((...)))))|{{{{,{,.,..,,,|||,,,.|||{|{|{|..,.||||.|}||||(((,,.....}}})})}.},((((((((((((,.....((((((...))))))((((((.((({,(((..((((((.......))))))((((((.((({......}))).))))))..(((((({.....)))))))))))))).))))))......(((...((((((((.,....,)))))))).)))}}}))),)))))){{{{,(({{...|||}..}}}}.|||,,||........|||.,,.....,{||.|||.,,......})))}....}}|}.{,{{{{....)))).||,,,...........}}}}}}}}),,,}..{{{........,)))}))}.))))))))))))}((((......)))).((((((....{.((((((..(((,.....,.)))))))))........))))))..,)).))))))))}))}.....))))).,))))))))))))).)))))).))))},)))).)))).))),}},...(((((((,...{((({{,....,))),}}},)))))))...}}.))).)))))))).((((....))))..|||............((((..{{{{(({,,...........)})},.|))}||||...,})))}....{.|,..,}}}},.,..)))))))))))....)))))}.}||..||||||||,..((((((....((((((......))))))..)))))).}})))},))),}},,)))))}..}))))..|,}},}}})),))))})))}},..,..(({{.......))))..{|||.},))))}.||||}}}}{{{{{{{,,,.((,,,........}}}))))),)),.....)).)))))))).)),,))))}).))),},))))))))))..))))))))))))))....))...}}))).}}},...............))))))).....)))))))))))))))))))))).)))))))))))))}.......)))))...{(({.{,...,},))}},.{((......))}........))))))),})}........................{(({....}})).(((((...)))))........((((((....((((.{{{{..........}}.}}.))))....)))))}.))))).)))).))..))|((((.((((({.......,{{.((((.,,.,,.,,....,,,,,,.............((((.......))))....{((((,{.....,.)))))...{((((({(({,...(((((((........))))))).....,}},.})),.,))))).....{{{{....))))}},.,)}))),)}..,,.)))),},........})))}}.}}}}...

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGACGCGCGUGCCCAGCUGAACCAGGUGCGUGAGAAGGCUGCCUUCAGG… 3506 nt 0.6033
AGACGCGCGUGCCCAGCUGAACCAGCUGUCUCUAGACGGAGGGACGGGA… 3541 nt 0.6024
AUUCAGGGCUGUGGGUCCCAUGUGGACUGGAUGCCCAGCGUGAGUGUAU… 3658 nt 0.6028
AGACGCGCGUGCCCAGCUGAACCAGCUGUCUCUAGACGGAGGGACGGGA… 3544 nt 0.6021
Showing 11 to 14 of 14 entries
Summary

Predicted to be involved in Ras protein signal transduction and cell surface receptor protein tyrosine kinase signaling pathway. Predicted to be located in ficolin-1-rich granule membrane and plasma membrane. Predicted to be active in cytoplasm. Implicated in colorectal adenocarcinoma. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.