Basic Information
Symbol
DPPA3
RNA class
mRNA
Alias
Developmental Pluripotency Associated 3
Stella
Pgc7
Developmental Pluripotency-Associated Protein 3
Stella-Related Protein
STELLAR
Location (GRCh38)
12:7711402-7717561
Forensic tag(s)
Other applications
MANE select
Transcript ID
NM_199286.4
Sequence length
1100.0 nt
GC content
0.4009
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-266.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-286.30 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
336.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GUCAGUUCUUUGACCAUUCGUUGGAGCUCCGGUUUUCAGCCUCUUUCCG… | 1100 nt | 0.4009 |
Summary
This gene encodes a protein that in mice may function as a maternal factor during the preimplantation stage of development. In mice, this gene may play a role in transcriptional repression, cell division, and maintenance of cell pluripotentiality. In humans, related intronless loci are located on chromosomes 14 and X. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
A study in human and mouse samples demonstrated that the TRI reagent method effectively extracts high-yield, high-quality DNA and RNA from blood volumes as low as 2 µl, with DNA yields ranging from 618 ng to 1763 ng and RNA yields from 1542 ng to 5423 ng [Farivar et al. DOI:10.1016/J.Forsciint.2019.109931].