Basic Information

Symbol
DPT
RNA class
mRNA
Alias
Dermatopontin Tyrosine-Rich Acidic Matrix Protein TRAMP
Location (GRCh38)
1:168695457-168729206
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001937.5
Sequence length
1719.0 nt
GC content
0.4974

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-570.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -604.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 526.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001937.5 NCBI
GAGUGACAUUGUUUGCCAAAAUCCCAGGCAGCAUGGACCUCAGUCUUCU… 1719 nt 0.4974
Summary

Dermatopontin is an extracellular matrix protein with possible functions in cell-matrix interactions and matrix assembly. The protein is found in various tissues and many of its tyrosine residues are sulphated. Dermatopontin is postulated to modify the behavior of TGF-beta through interaction with decorin. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human and rat corpus cavernosum identified the DPT as a universal marker of human corpus cavernosum fibroblasts, where it was diffusely expressed across steady-state fibroblasts [Yin et al. DOI:10.1016/j.celrep.2024.114760].