Basic Information

Symbol
DPY19L1
RNA class
mRNA
Alias
Dpy-19 Like C-Mannosyltransferase 1 KIAA0877 Protein C-Mannosyl-Transferase DPY19L1 Protein Dpy-19 Homolog 1 Probable C-Mannosyltransferase DPY19L1 Dpy-19 Like 1 (C. Elegans) DPY-19-Like Protein 1 Dpy-19-Like Protein 1 Dpy-19 Like 1 EC 2.4.1.- GA0500
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
-

MANE select

Transcript ID
NM_001366673.1
Sequence length
5030.0 nt
GC content
0.4056

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1469.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1566.29 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1310.91
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
GGAGAGUGAGCUGCGCCCAGCCGCCCAGCCAGCCCGCCGUUCUCUGGCC… 5030 nt 0.4056
CCCUAAGUGGCCGCUCCGGGCGCCUUCUCCCUGCCCCGCCGCGUCUCGC… 4865 nt 0.3877
Summary

Predicted to enable mannosyltransferase activity. Predicted to be involved in protein glycosylation. Located in membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.