Basic Information

Symbol
DROSHA
RNA class
mRNA
Alias
Drosha Ribonuclease III RNASE3L RN3 HSA242976 Etohi2 RNASEN Drosha, Double-Stranded RNA-Specific Endoribonuclease Ribonuclease Type III, Nuclear Ribonuclease 3 EC 3.1.26.3 RNase III P241 Putative Protein P241 Which Interacts With Transcription Factor Sp1 Drosha, Ribonuclease Type III Putative Ribonuclease III Nuclear RNase III Drosha Ribonuclease III Protein Drosha RANSE3L
Location (GRCh38)
5:31400494-31533186
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Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001382508.1
Sequence length
5416.0 nt
GC content
0.4594

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1534.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1634.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1659.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001100412.2 NCBI
GGUUUCCUGUUCCGGAGGCGCGGGCGGUGCCACUGUCUUGGUACCUGCG… 5305 nt 0.4594
NM_001382508.1 NCBI
GGUUUCCUGUUCCGGAGGCGCGGGCGGUGCCACUGUCUUGGUACCUGCG… 5416 nt 0.4594
NM_013235.5 NCBI
GGUUUCCUGUUCCGGAGGCGCGGGCGGUGCCACUGUCUUGGUACCUGCG… 5340 nt 0.4592
Summary

This gene encodes a ribonuclease (RNase) III double-stranded RNA-specific ribonuclease and subunit of the microprocessor protein complex, which catalyzes the initial processing step of microRNA (miRNA) synthesis. The encoded protein cleaves the stem loop structure from the primary microRNA (pri-miRNA) in the nucleus, yielding the precursor miRNA (pre-miRNA), which is then exported to the cytoplasm for further processing. In a human cell line lacking a functional copy of this gene, canonical miRNA synthesis is reduced. Somatic mutations in this gene have been observed in human patients with kidney cancer. [provided by RefSeq, Sep 2016] CIViC Summary for DROSHA Gene

Forensic Context

A study in mice demonstrated that Drosha, a core RNase III enzyme in the Microprocessor complex, is essential for cropping primary microRNAs (pri-miRNAs) in the nucleus during miRNA biogenesis [Shang et al. DOI:10.1038/s41576-023-00611-y].