Basic Information

Symbol
DSCAM
RNA class
mRNA
Alias
DS Cell Adhesion Molecule Down Syndrome Cell Adhesion Molecule CHD2-42 CHD2-52 Cell Adhesion Molecule DSCAM CHD2
Location (GRCh38)
21:40010999-40847158
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001389.5
Sequence length
8571.0 nt
GC content
0.5190

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2942.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3087.47 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1936.10
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001271534.3 NCBI
ACUCGCCCGGCUCGCAGGCAGGGAAGGUUGGCAGAGGGAUCCAUGUGAC… 8517 nt 0.5197
NM_001389.5 NCBI
ACUCGCCCGGCUCGCAGGCAGGGAAGGUUGGCAGAGGGAUCCAUGUGAC… 8571 nt 0.5190
Summary

This gene is a member of the immunoglobulin superfamily of cell adhesion molecules (Ig-CAMs), and is involved in human central and peripheral nervous system development. This gene is a candidate for Down syndrome and congenital heart disease (DSCHD). A gene encoding a similar Ig-CAM protein is located on chromosome 11. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2012]

Forensic Context

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