Basic Information

Symbol
ABCB1
RNA class
mRNA
Alias
ATP Binding Cassette Subfamily B Member 1 PGY1 Multidrug Resistance Protein 1 CD243 GP170 ABC20 P-170 P-Gp MDR1 ATP-Binding Cassette, Sub-Family B (MDR/TAP), Member 1 ATP-Dependent Translocase ABCB1 Phospholipid Transporter ABCB1 Colchicin Sensitivity P-Glycoprotein 1 CLCS ATP-Binding Cassette Sub-Family B Member 1 Doxorubicin Resistance P-Glycoprotein CD243 Antigen EC 3.6.3.44 EC 7.6.2.2 EC 7.6.2.1 EC 3.6.3 ENPAT
Location (GRCh38)
7:87503017-87713375
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Forensic psychiatry-related diagnoses Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001348946.2
Sequence length
5205.0 nt
GC content
0.4081

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1463.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1560.22 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1383.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000927.5 NCBI
AUCAUUACUCUUUACCUGUGAAGAGUAGAACAUGAAGAAAUCUACUUUA… 5534 nt 0.4127
NM_001348944.2 NCBI
AUCAUUACUCUUUACCUGUGAAGAGUAGAACAUGAAGAAAUCUACUUUA… 5387 nt 0.4076
NM_001348945.2 NCBI
AUCAUUACUCUUUACCUGUGAAGAGUAGAACAUGAAGAAAUCUACUUUA… 5586 nt 0.4080
NM_001348946.2 NCBI
AUUCGAGUAGCGGCUCUUCCAAGCUCAAAGAAGCAGAGGCCGCUGUUCG… 5205 nt 0.4081
Summary

The membrane-associated protein encoded by this gene is a member of the superfamily of ATP-binding cassette (ABC) transporters. ABC proteins transport various molecules across extra- and intra-cellular membranes. ABC genes are divided into seven distinct subfamilies (ABC1, MDR/TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, White). This protein is a member of the MDR/TAP subfamily. Members of the MDR/TAP subfamily are involved in multidrug resistance. The protein encoded by this gene is an ATP-dependent drug efflux pump for xenobiotic compounds with broad substrate specificity. It is responsible for decreased drug accumulation in multidrug-resistant cells and often mediates the development of resistance to anticancer drugs. This protein also functions as a transporter in the blood-brain barrier. Mutations in this gene are associated with colchicine resistance and Inflammatory bowel disease 13. Alternative splicing and the use of alternative promoters results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Feb 2017] CIViC Summary for ABCB1 Gene

Forensic Context

A study in human leukocytes from severe burn patients identified the ABCB1 as a top gene with a sustained decreasing expression profile from the healthy state through the late recovery phase, classifying it as a key biomarker for burn recovery [Xu et al. DOI:10.1159/000493451]. In a separate human study, the ABCB1 was utilized as a marker for the manual annotation of endothelial cell clusters in an Alzheimer's disease single-nucleus RNA sequencing dataset [Xue et al. DOI:10.3233/JAD-230559].