Basic Information

Symbol
DST
RNA class
mRNA
Alias
Dystonin BP240 BPA KIAA0728 CATX-15 MACF2 BPAG1 Hemidesmosomal Plaque Protein Bullous Pemphigoid Antigen 1 Dystonia Musculorum Protein Bullous Pemphigoid Antigen FLJ21489 FLJ13425 FLJ32235 FLJ30627 DMH DT Bullous Pemphigoid Antigen 1, 230/240kDa 230/240 KDa Bullous Pemphigoid Antigen 230 KDa Bullous Pemphigoid Antigen Trabeculin-Beta D6S1101 CATX15 EBSB2 HSAN6 BP230 EBS3
Location (GRCh38)
6:56457987-56954830
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001374736.1
Sequence length
24709.0 nt
GC content
0.4164

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-6659.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -7117.88 kcal/mol
Frequency: 9.88131e-324
Diversity: 5992.56
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001144769.5 NCBI
GAGUCGCAGCCUCGUCGCUGUCUGCUGAGUCAUGGCAAGCGCUCCCCGC… 18280 nt 0.4294
NM_001144770.2 NCBI
AGUCAUUUGUGAGCUGGUGGCCGGACCACAGGCCACACACUUCUUCCGU… 17738 nt 0.4224
NM_001374722.1 NCBI
GAGUCGCAGCCUCGUCGCUGUCUGCUGAGUCAUGGCAAGCGCUCCCCGC… 24637 nt 0.4165
NM_001374729.1 NCBI
GCAGAUGCGCCGCGCAGCAUCCCCGGUGAAGGCAGCGCGCCGGUCCUCC… 23897 nt 0.4159
NM_001374730.1 NCBI
GCAGAUGCGCCGCGCAGCAUCCCCGGUGAAGGCAGCGCGCCGGUCCUCC… 17639 nt 0.4294
NM_001374734.1 NCBI
GAGUCGCAGCCUCGUCGCUGUCUGCUGAGUCAUGGCAAGCGCUCCCCGC… 24664 nt 0.4166
NM_001374736.1 NCBI
GAGUCGCAGCCUCGUCGCUGUCUGCUGAGUCAUGGCAAGCGCUCCCCGC… 24709 nt 0.4164
NM_001386100.1 NCBI
GCAGAUGCGCCGCGCAGCAUCCCCGGUGAAGGCAGCGCGCCGGUCCUCC… 17987 nt 0.4299
NM_001723.7 NCBI
AGCUGCCACUUUUCACCGUUAGAAGUAGAGCUUUUUCCAGACCUCCUAC… 8971 nt 0.4000
NM_015548.5 NCBI
AGCUGCCACUUUUCACCGUUAGAAGUAGAGCUUUUUCCAGACCUCCUAC… 16626 nt 0.4231
Showing 1 to 10 of 11 entries
Summary

This gene encodes a member of the plakin protein family of adhesion junction plaque proteins. Multiple alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been found for this gene, but the full-length nature of some variants has not been defined. It has been reported that some isoforms are expressed in neural and muscle tissue, anchoring neural intermediate filaments to the actin cytoskeleton, and some isoforms are expressed in epithelial tissue, anchoring keratin-containing intermediate filaments to hemidesmosomes. Consistent with the expression, mice defective for this gene show skin blistering and neurodegeneration. [provided by RefSeq, Mar 2010]

Forensic Context

A study in human keratinocytes and mouse skin demonstrated that X-ray irradiation (5 Gy) significantly downregulated the DST (0.53-fold) alongside 58 other genes, while upregulating 16 genes including ATF3, which was validated to induce caspase-3-dependent apoptosis [Koike et al. DOI:10.1269/jrr.46.173].